; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0009046 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0009046
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionMediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1
Genome locationchr04:20145916..20146435
RNA-Seq ExpressionPI0009046
SyntenyPI0009046
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0034013.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-4879.69Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS
        MYDVPIVPAPVQRRR  VQEPD+LEEV+QH ++VP + QTQS    VSP+M MP FGT YYDSGVGQSS+FG GYYNSEAG SS++FGQ YYDLG+DPSS
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS

Query:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ
        SYMHGHGRGRGEHNEYLYYE PAAVPEQ
Subjt:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ

KAA0037866.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-5269.41Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP
        MYDV IVPAPVQR+R  VQE D+LEEV+QHV++VP V   QTQS    VSP+M MP FGT YYD GVGQSS+FG  YYNSEAGPSS++FGQ YYDLG++P
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP

Query:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF
        SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYE P  VP+Q            Y+NK+ RVDD NQ EI DVQVVEHIDFF
Subjt:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF

KAA0055624.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-4778.91Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS
        MYDVPIVPAPVQRRR  VQEPD+LEEV+QH ++VP + QT+S    VSP+M MP FGT YYDSGVGQSS+FG GYYNSEAG SS++FGQ YYDLG+DPSS
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS

Query:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ
        SYMHGHGRGRGEHNEYLYYE PAAVPEQ
Subjt:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ

KAA0067080.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-4778.91Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS
        MYDVPIVPAPVQRRR  VQEPD+LEEV+QH ++VP + QTQS    VSP+M MP FGT YYDS VGQSS+FG GYYNSEAG SS++FGQ YYDLG+DPSS
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS

Query:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ
        SYMHGHGRGRGEHNEYLYYE PAAVPEQ
Subjt:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ

TYK09816.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-5269.41Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP
        MYDV IVPAPVQR+R  VQE D+LEEV+QHV++VP V   QTQS    VSP+M MP FGT YYD GVGQSS+FG  YYNSEAGPSS++FGQ YYDLG++P
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP

Query:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF
        SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYE P  VP+Q            Y+NK+ RVDD NQ EI DVQVVEHIDFF
Subjt:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SU33 Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein2.1e-4879.69Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS
        MYDVPIVPAPVQRRR  VQEPD+LEEV+QH ++VP + QTQS    VSP+M MP FGT YYDSGVGQSS+FG GYYNSEAG SS++FGQ YYDLG+DPSS
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS

Query:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ
        SYMHGHGRGRGEHNEYLYYE PAAVPEQ
Subjt:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ

A0A5A7T6Q6 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X14.9e-5369.41Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP
        MYDV IVPAPVQR+R  VQE D+LEEV+QHV++VP V   QTQS    VSP+M MP FGT YYD GVGQSS+FG  YYNSEAGPSS++FGQ YYDLG++P
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP

Query:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF
        SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYE P  VP+Q            Y+NK+ RVDD NQ EI DVQVVEHIDFF
Subjt:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF

A0A5A7UKC7 Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein6.2e-4878.91Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS
        MYDVPIVPAPVQRRR  VQEPD+LEEV+QH ++VP + QT+S    VSP+M MP FGT YYDSGVGQSS+FG GYYNSEAG SS++FGQ YYDLG+DPSS
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS

Query:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ
        SYMHGHGRGRGEHNEYLYYE PAAVPEQ
Subjt:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ

A0A5A7VIP6 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X11.8e-4778.91Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS
        MYDVPIVPAPVQRRR  VQEPD+LEEV+QH ++VP + QTQS    VSP+M MP FGT YYDS VGQSS+FG GYYNSEAG SS++FGQ YYDLG+DPSS
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSS

Query:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ
        SYMHGHGRGRGEHNEYLYYE PAAVPEQ
Subjt:  SYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ

A0A5D3CHF6 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X14.9e-5369.41Show/hide
Query:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP
        MYDV IVPAPVQR+R  VQE D+LEEV+QHV++VP V   QTQS    VSP+M MP FGT YYD GVGQSS+FG  YYNSEAGPSS++FGQ YYDLG++P
Subjt:  MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHV--RQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDP

Query:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF
        SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYE P  VP+Q            Y+NK+ RVDD NQ EI DVQVVEHIDFF
Subjt:  SSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEPPAAVPEQ-----------PYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACGATGTACCTATTGTACCTGCGCCAGTTCAAAGGAGACGTGCTCAAGTGCAAGAGCCTGATGAATTGGAAGAAGTTGAACAACATGTGCAAAAAGTGCCTCATGT
GAGACAAACACAAAGCGGGACTGGTGACGTTAGTCCAATGATGAGGATGCCGGCATTTGGAACGGGATATTATGATTCAGGAGTCGGTCAATCGTCAAACTTCGGGACAG
GATATTATAATTCAGAGGCAGGTCCATCATCGTCAAACTTTGGACAAGGATACTACGATTTAGGGACCGATCCATCGTCTTCATACATGCATGGACACGGGCGTGGTCGT
GGAGAACATAACGAATATTTGTACTACGAACCGCCTGCAGCGGTACCCGAGCAGCCATATGACAACAAAAAGTGCAGGGTCGACGATGGCAACCAGCAAGAAATCGGCGA
CGTCCAGGTTGTGGAACACATTGATTTTTTTAAAAAAATTTGTAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACGATGTACCTATTGTACCTGCGCCAGTTCAAAGGAGACGTGCTCAAGTGCAAGAGCCTGATGAATTGGAAGAAGTTGAACAACATGTGCAAAAAGTGCCTCATGT
GAGACAAACACAAAGCGGGACTGGTGACGTTAGTCCAATGATGAGGATGCCGGCATTTGGAACGGGATATTATGATTCAGGAGTCGGTCAATCGTCAAACTTCGGGACAG
GATATTATAATTCAGAGGCAGGTCCATCATCGTCAAACTTTGGACAAGGATACTACGATTTAGGGACCGATCCATCGTCTTCATACATGCATGGACACGGGCGTGGTCGT
GGAGAACATAACGAATATTTGTACTACGAACCGCCTGCAGCGGTACCCGAGCAGCCATATGACAACAAAAAGTGCAGGGTCGACGATGGCAACCAGCAAGAAATCGGCGA
CGTCCAGGTTGTGGAACACATTGATTTTTTTAAAAAAATTTGTAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYDVPIVPAPVQRRRAQVQEPDELEEVEQHVQKVPHVRQTQSGTGDVSPMMRMPAFGTGYYDSGVGQSSNFGTGYYNSEAGPSSSNFGQGYYDLGTDPSSSYMHGHGRGR
GEHNEYLYYEPPAAVPEQPYDNKKCRVDDGNQQEIGDVQVVEHIDFFKKICN