CuGenDBv2

Gene ID	PI0009510
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr01:22600163..22604462
RNA-Seq Expression	PI0009510
Synteny	PI0009510
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

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XP_022156079.1 uncharacterized protein LOC111023052 [Momordica charantia]

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XP_038899087.1 uncharacterized protein LOC120086484 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K4R1 Uncharacterized protein

1.0e-112

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A0A1S4DXB3 uncharacterized protein LOC103489727

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A0A6J1DS86 uncharacterized protein LOC111023052

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A0A6J1H692 uncharacterized protein LOC111460909

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A0A6J1KXA5 uncharacterized protein LOC111497980

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        MLS T R RTLSSSLCS SH FRS RT+  P KRRSKP+AF   K D+KSEWWAVDGEMHEIGDNVP RERFVIPREN+PNRRRKQLR+QFMRRTRLVLK
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        APM       SQ+   RRQRTD QPQRY SESD
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G07440.1 unknown protein

2.9e-75

68.9

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        R  RTEA   +RR+K  +  L K ++KSEWW VDGEMHEIGD+VPPRERF IPR+N+PN+RRKQLR+QFMRRTRLVLKESEHEPWCKKYMELY ELRENW
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Query:  ERLYWDEGYSKKLARDHANYESSE--DEDFSPYRNRQFTDDRSKGQDFRRNMQGGNWENVSQIRDKFEYDRERRMKERAFAPMR-EDRTFPSQNPNFRRQ
        ERLYWDEGYSKKLA DHANYES+E  DEDF+PYRNR+   D++K Q F R  QG NWE VSQIRDKFEYDRERRM+++AFAPM     +  S++ N+  Q
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Query:  RTDVQPQRY
        R    P R+
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AT5G48530.1 unknown protein

8.6e-67

68.72

Show/hide

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        MLS+  R  + + SL + +   R  RTEA   +RR+K PS   L K ++KSEWW VDGEMHEIGD+VP RERF IPR+N+PN+RRKQLREQFMRRTRLVL
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        KESEHEPWCKKYMELY E+RENWERLYWDEGYSKK+ARDHANYES+E  DEDF+PYRNR+ + D   + Q F R  QG  NWE VSQIRDKFEYD
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTCTCACTCACTCACAGATTTCGGACTCTGTCCTCATCTCTATGTTCCAATTCTCATCCATTTCGATCGTTCCGGACGGAGGCCAGACCCTCCAAGCGGCGCTCAAA
GCCTTCTGCATTCACCTTAAACAAGCCCGACCAAAAGTCCGAGTGGTGGGCTGTTGATGGCGAAATGCATGAAATCGGCGACAATGTCCCCCCTCGCGAGCGATTTGTTA
TACCCAGAGAAAATCTCCCCAATCGGCGTCGAAAGCAGCTCAGGGAACAGTTCATGCGTCGGACTCGCCTCGTTCTCAAGGAATCTGAGCACGAGCCATGGTGCAAAAAG
TACATGGAGCTTTATCAGGAGCTAAGGGAAAACTGGGAGAGACTGTACTGGGATGAGGGTTATTCCAAAAAACTTGCTAGGGATCATGCAAACTATGAGTCTTCTGAGGA
CGAAGATTTTTCTCCTTATAGAAATAGGCAATTCACTGATGATCGGAGTAAGGGACAGGATTTTAGGAGGAACATGCAAGGTGGTAACTGGGAGAATGTCAGCCAGATTA
GAGATAAGTTTGAATACGATAGGGAGAGAAGAATGAAAGAGAGAGCCTTTGCACCTATGCGTGAAGATCGAACTTTTCCCTCACAGAATCCAAATTTTCGAAGGCAACGA
ACAGATGTGCAGCCACAAAGATACATGTCCGAGAGCGATAGTGACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TTAGTTCTTTATTCATTTTCATTTTCTTTCTTTTGCAAATCATACTCCTCTAGACGCTGCTCCCGGCGAAAACCCACACCTGCCGGAAAACCCTATTTGCAAGTTCTCTT
TGTCGTATCGGAAAACATCCTTGCACCGGCGTGAAGCTTCACAAGCTTATGCTCTCACTCACTCACAGATTTCGGACTCTGTCCTCATCTCTATGTTCCAATTCTCATCC
ATTTCGATCGTTCCGGACGGAGGCCAGACCCTCCAAGCGGCGCTCAAAGCCTTCTGCATTCACCTTAAACAAGCCCGACCAAAAGTCCGAGTGGTGGGCTGTTGATGGCG
AAATGCATGAAATCGGCGACAATGTCCCCCCTCGCGAGCGATTTGTTATACCCAGAGAAAATCTCCCCAATCGGCGTCGAAAGCAGCTCAGGGAACAGTTCATGCGTCGG
ACTCGCCTCGTTCTCAAGGAATCTGAGCACGAGCCATGGTGCAAAAAGTACATGGAGCTTTATCAGGAGCTAAGGGAAAACTGGGAGAGACTGTACTGGGATGAGGGTTA
TTCCAAAAAACTTGCTAGGGATCATGCAAACTATGAGTCTTCTGAGGACGAAGATTTTTCTCCTTATAGAAATAGGCAATTCACTGATGATCGGAGTAAGGGACAGGATT
TTAGGAGGAACATGCAAGGTGGTAACTGGGAGAATGTCAGCCAGATTAGAGATAAGTTTGAATACGATAGGGAGAGAAGAATGAAAGAGAGAGCCTTTGCACCTATGCGT
GAAGATCGAACTTTTCCCTCACAGAATCCAAATTTTCGAAGGCAACGAACAGATGTGCAGCCACAAAGATACATGTCCGAGAGCGATAGTGACTGACAAATTGACTAAAA
CTTTATCTGCATCTATGTGAAGAAGAGGTTAGAAATATCCTTACAGCTCATCTCTCCCTTTGCTGTCGTTACCATTATCTGCAGTTGTAGGGTGTCTTCTCCATCTCAAG
TGTAAAACAACCAGAATAATTTTGGTTACTTTGTTAGGTTCACCTCGAGATCTGTGGTTGGTTTCGATATTGTGTTAATATGCTCTATAGAGTGAACACAAATAAACTGA
ACCTTTGGTACCGCTACATTCAAATGACATAATGATTGAAAGAGCCTGGCAATGGGGAGGCTTTTTTTGGTCTCCTTTTTAGATCTCTAAAAGAAGGCCAATTGAGAGAG
AGATTGGTGATGGATATAATATCTATACTTTACACACCTTGAAATCTAGAATTTTGTTACAATTGAATTGAATCCTATGTGTGAATCTTGCTGTTAAAGGTACTGTGAAG
GAACTGAAAGGCTCAATAGAGTGTAGTTTAAATTGACTAGTTGGTCAGTCAACAAGCTCAAAAAAGGTCTCGAACCTGCAATTC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLSLTHRFRTLSSSLCSNSHPFRSFRTEARPSKRRSKPSAFTLNKPDQKSEWWAVDGEMHEIGDNVPPRERFVIPRENLPNRRRKQLREQFMRRTRLVLKESEHEPWCKK
YMELYQELRENWERLYWDEGYSKKLARDHANYESSEDEDFSPYRNRQFTDDRSKGQDFRRNMQGGNWENVSQIRDKFEYDRERRMKERAFAPMREDRTFPSQNPNFRRQR
TDVQPQRYMSESDSD

PI0009510 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome