; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0009915 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0009915
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionLEA_2 domain-containing protein
Genome locationchr02:16299947..16301909
RNA-Seq ExpressionPI0009915
SyntenyPI0009915
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008463399.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501566 [Cucumis melo]8.5e-13998.43Show/hide
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XP_023516527.1 uncharacterized protein LOC111780378 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-13495.69Show/hide
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XP_038880700.1 uncharacterized protein LOC120072313 [Benincasa hispida]4.0e-13696.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CJ71 uncharacterized protein LOC1035015664.1e-13998.43Show/hide
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A0A5D3DZ77 Uncharacterized protein4.1e-13998.43Show/hide
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A0A6J1CSV1 uncharacterized protein LOC1110144441.7e-12990.98Show/hide
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A0A6J1HD92 uncharacterized protein LOC1114617591.4e-13495.29Show/hide
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A0A6J1JFC5 uncharacterized protein LOC1114852351.4e-13495.29Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G45688.1 unknown protein5.1e-4940.35Show/hide
Query:  MESP--SHPSYTRHSRSSSASRFSGTF----RSALGRKGSRKR---NDKGWPECNVIEEEGDYDDLNGDKGLTRRCQILMALLAFVFIFFLFCLIIWGAS
        M SP  SH S  RHSR SS+SRFSG+     R      GS+++    +K W EC VIEEEG  DD + D G+ RRC +L  ++ F  +F  F LI++GA+
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Query:  RPFKAEIKVKSMTVHNVYFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQLKKYYQPRQSNRIELVNLQGNKVPLYGA
        +P K +I VKS+T   +    G D  GV T ++T+N +LR+   N  TFFG+HV+S+PI+L +SQI + SG +KK+YQ R+S R  LV++ G K+PLYG+
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Query:  GATL----------EALDKNG-------------NIPMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEIDSRNSKPMKIKADSCT
        G+TL          +   K G              +PM L F V SR  V+GKLV+ K  K++ C +  + +N     +   +CT
Subjt:  GATL----------EALDKNG-------------NIPMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEIDSRNSKPMKIKADSCT

AT1G45688.2 unknown protein3.3e-3243.24Show/hide
Query:  MESP--SHPSYTRHSRSSSASRFSGTF----RSALGRKGSRKR---NDKGWPECNVIEEEGDYDDLNGDKGLTRRCQILMALLAFVFIFFLFCLIIWGAS
        M SP  SH S  RHSR SS+SRFSG+     R      GS+++    +K W EC VIEEEG  DD + D G+ RRC +L  ++ F  +F  F LI++GA+
Subjt:  MESP--SHPSYTRHSRSSSASRFSGTF----RSALGRKGSRKR---NDKGWPECNVIEEEGDYDDLNGDKGLTRRCQILMALLAFVFIFFLFCLIIWGAS

Query:  RPFKAEIKVKSMTVHNVYFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQ----LKKYYQPRQ
        +P K +I VKS+T   +    G D  GV T ++T+N +LR+   N  TFFG+HV+S+PI+L +SQI + SG     ++K Y+ R+
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AT2G41990.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Late embryogenesis abundant protein, group 2 (InterPro:IPR004864)1.4e-3335.08Show/hide
Query:  MESPSHPSY-----TRHSRSSSASRFSGTFRSALGRKGSRKRNDKGWPECNVIEEEGDYDDLNGDKGLTRRCQI-LMALLAFVFIFFLFCLIIWGASRPF
        M SP+HP Y       HSR SS SRFS   R+ L  K  R+R          I +  D  D   D    R  ++ +  LL+ +F+F +F LI+WGAS+ +
Subjt:  MESPSHPSY-----TRHSRSSSASRFSGTFRSALGRKGSRKRNDKGWPECNVIEEEGDYDDLNGDKGLTRRCQI-LMALLAFVFIFFLFCLIIWGASRPF

Query:  KAEIKVKSMTVHNVYFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQLKKYYQPRQSNRIELVNLQGNKVPLY-GAGA
          ++ VK M V ++    G+D +GVPT +L++N ++RI   NP+TFF +HV++SP+ L YS + ++SG++ K+   R      +  +QG+++PLY G   
Subjt:  KAEIKVKSMTVHNVYFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQLKKYYQPRQSNRIELVNLQGNKVPLY-GAGA

Query:  TLEALDKNGNIPMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEIDSRN
         L+ L    ++P+ L   +HS+  ++G+LV SK   R+ CS  +D+ +
Subjt:  TLEALDKNGNIPMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEIDSRN

AT3G24600.1 Late embryogenesis abundant protein, group 25.1e-5747.66Show/hide
Query:  PSH-PSYT--RHSRSSSASRFS-GTFRSALGRKGSRKRNDKGWPE-CNVIEEEGDYDDLNGDKGLT-RRCQILMALLAFVFIFFLFCLIIWGASRPFKAE
        P H P+YT    SR SS+SR S GT       KGS +R++  WPE    I E+  YDD   ++GL+  +C+ ++ +L  V +F +FC ++WGAS PF   
Subjt:  PSH-PSYT--RHSRSSSASRFS-GTFRSALGRKGSRKRNDKGWPE-CNVIEEEGDYDDLNGDKGLT-RRCQILMALLAFVFIFFLFCLIIWGASRPFKAE

Query:  IKVKSMTVHNVYFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQLKKYYQPRQSNRIELVNLQGNKVPLYGAGATLEA
        + VKS+ +H+ Y+GEG D TGV TK+L+ N S+++T+ +PA +FGIHVSSS   L +S + +A+GQLK YYQPR+S  I +V L G +VPLYGAG  L A
Subjt:  IKVKSMTVHNVYFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQLKKYYQPRQSNRIELVNLQGNKVPLYGAGATLEA

Query:  LDKNGNIPMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEI-DSRNSKPMKIKADSC
         DK G +P+ L FE+ SRGN++GKLV+SKH   VSCS  I  S+ SKP++    +C
Subjt:  LDKNGNIPMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEI-DSRNSKPMKIKADSC

AT5G42860.1 unknown protein5.7e-4039.55Show/hide
Query:  HSRSSSASRFSGTFRSALGRKGSRKRNDKGWPECNVIEEEGDYDDLNGDK---GLTRRCQILMALLAFVFIFFLFCLIIWGASRPFKAEIKVKSMTVHNV
        HS SSS SRFS          GS+++   G  +  +IEEEG  DD  GD+    L RRC +L  ++ F  +F  F LI++ A++P K +I VKS+T   +
Subjt:  HSRSSSASRFSGTFRSALGRKGSRKRNDKGWPECNVIEEEGDYDDLNGDK---GLTRRCQILMALLAFVFIFFLFCLIIWGASRPFKAEIKVKSMTVHNV

Query:  YFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQLKKYYQPRQSNRIELVNLQGNKVPLYGAGATL----------EAL
            G D  G+ T ++T+N +LR+   N  TFFG+HV+SSPI+L +SQI + SG +KK+YQ R+S R  +VN+ G+K+PLYG+G+TL          +  
Subjt:  YFGEGSDTTGVPTKLLTINCSLRITVHNPATFFGIHVSSSPINLMYSQIAVASGQLKKYYQPRQSNRIELVNLQGNKVPLYGAGATL----------EAL

Query:  DKNGNI------------PMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEIDSRN-SKPMKIKADSCT
         K G I            PM L F V SR  V+GKLV+ K  KR+ C +  + +  SK + I  ++CT
Subjt:  DKNGNI------------PMMLVFEVHSRGNVVGKLVRSKHRKRVSCSLEIDSRN-SKPMKIKADSCT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAGCCCTTCTCATCCCTCTTATACTCGCCACTCTCGCTCCTCGTCGGCGAGTCGGTTTTCCGGTACGTTTCGATCCGCTCTTGGCCGGAAAGGTAGCCGGAAACG
CAACGATAAAGGGTGGCCAGAGTGTAATGTGATTGAAGAAGAGGGAGACTATGATGATCTAAATGGAGATAAAGGGTTAACTAGAAGATGCCAGATTCTGATGGCTTTGC
TTGCGTTTGTTTTTATCTTCTTCTTGTTCTGTTTGATCATTTGGGGTGCTAGCAGACCTTTCAAAGCAGAGATCAAAGTCAAGAGCATGACCGTTCATAATGTTTATTTT
GGAGAAGGATCAGACACAACAGGAGTTCCAACCAAATTACTGACTATCAACTGTTCATTAAGAATTACTGTTCATAATCCTGCAACTTTCTTTGGCATTCATGTCAGTTC
CTCCCCCATCAATCTCATGTATTCCCAGATTGCAGTTGCTTCTGGTCAGTTGAAGAAATACTATCAACCGAGACAGAGCAATCGAATTGAATTGGTGAATCTTCAAGGGA
ACAAGGTGCCATTATATGGGGCTGGAGCCACCCTTGAAGCCTTGGATAAAAATGGAAACATTCCTATGATGTTGGTGTTTGAAGTCCATTCAAGAGGGAATGTGGTGGGG
AAACTAGTAAGATCAAAGCATAGAAAGCGTGTATCGTGTTCTTTGGAGATTGACTCTCGCAACTCGAAGCCTATGAAGATTAAAGCTGATTCATGTACATATGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCCCCCCCCTGGCCCTTTCTCAGTGGTGACTGATGGCTCATCACTGCGGCTTTACTCCCATTATCCCCATTCACCTTTCTTCTTCCCTTCTCTTTCTCATTCCCACGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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