; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0010449 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0010449
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionBasic helix-loop-helix transcription factor
Genome locationchr02:21903807..21907424
RNA-Seq ExpressionPI0010449
SyntenyPI0010449
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058209.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-10494.84Show/hide
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XP_004146337.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis sativus]9.6e-11793.31Show/hide
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XP_008453552.1 PREDICTED: transcription factor bHLH35 [Cucumis melo]1.9e-13390.65Show/hide
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XP_022922024.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita moschata]7.4e-10183.2Show/hide
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XP_038878728.1 transcription factor bHLH35-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-11290.46Show/hide
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        TAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAIAGLNDPHSPM
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU95 BHLH domain-containing protein4.6e-11793.31Show/hide
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        MD IGDDYLN  G +IFI E+LDSWG EEP SG YDSSSPDGSAASKN+ SERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIH LHDQERRIQ
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A0A1S3BWL7 transcription factor bHLH359.3e-13490.65Show/hide
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A0A5A7UXG0 Transcription factor bHLH355.3e-10594.84Show/hide
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like3.6e-10183.2Show/hide
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        ERR+Q EI ELESG   KITG EFDQ +LPLLLR KRKKTE+YFSY SP SR SPIEV DLSVTYMGDRTI VSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIIT
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A0A6J1JJ79 transcription factor bHLH35-like1.4e-10082.79Show/hide
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        ERR+Q EI ELESG   KITG EFDQ +LPLLLR KR KTE+YFSY SP SR SPIEV DLSVTYMGDRTI VSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIIT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JEB7 Transcription factor BHLH61.9e-3537.75Show/hide
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        ++G D   A      G    + G       D   A+KNI+ ER+RRRKLNE+L+ALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI+YI  L  +E+++  E+  LES  
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                     G   D++       P     + KK ++  S  S         +   P+E+ +L V+ +GDR +VVS+TC KR D+M ++C   E L+
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Query:  LKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAIAGLNDPHSPM
        L++ITANIT+V+G L+ T+F+E +  +   +K  +E A++ L    SP+
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH354.2e-5959.82Show/hide
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        SW  EE +SG YDSSSPDG+A   ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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Query:  DQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERD
        D+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIEA++EE++
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Query:  YLKIKIETAIAGLNDPHSP
         L++KIET I   N+  SP
Subjt:  YLKIKIETAIAGLNDPHSP

Q700E3 Transcription factor bHLH271.9e-4346.9Show/hide
Query:  MDSIGDDYLNSLGTDIFIAE---DLDSWGFEEPVSGYYDSSSPDGS----AASKNIVSERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHALH
        M+ +  +Y N   T +F      + DSW  EE  SG  +SSSPDG+    A+SKN+VSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNISK+DKAS+IKD+IDY+  L 
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Query:  DQERRIQAEIYELES-GTLKKITGYEFDQDQLPLLLR------SKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVF
        DQE+ ++AEI ELES  TL +    ++D +     L+        R K  +   Y + V    PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
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Query:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIE
        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++
Subjt:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIE

Q9LSE2 Transcription factor ICE12.1e-1330.98Show/hide
Query:  SKNIVSERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHALHDQERRIQAEIYELESGTLKKITGYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPV
        +KN+++ER RR+KLN+RL+ LRSVVP ISKMD+ASI+ DAIDY+  L  +   +  E+     G+L   +         P  L  + K+     S  SP 
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Query:  SRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAI
         + + +E     V     R + + M C +R   ++   +  ++L L +  A I+  +G  L     E  QE ++ L  +I+  +
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Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES1.3e-1229.84Show/hide
Query:  YDSSSPDGSAASKNIVSERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHALHDQERRIQAEI---YELESGTLKKITGYEFDQDQLP-----L
        Y   S  GS A KN+++ER RR+KLN+RL+ALRS+VP I+K+D+ASI+ DAI+Y+  L ++ + +Q E+    E E G+ +   G   +   +      L
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Query:  LLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEE
           S     +Q    ++   +   +E   + V  +  R   V + C  +     +L E  +SL L++  AN T     +     +E    E
Subjt:  LLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.6e-5146.8Show/hide
Query:  MDSIGDDYLNSLGTDIFIAE---DLDSWGFEEPVSGYYDSSSPDGS----AASKNIVSERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHALH
        M+ +  +Y N   T +F      + DSW  EE  SG  +SSSPDG+    A+SKN+VSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNISK+DKAS+IKD+IDY+  L 
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Query:  DQERRIQAEIYELES-GTLKKITGYEFDQDQLPLLLR------SKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVF
        DQE+ ++AEI ELES  TL +    ++D +     L+        R K  +   Y + V    PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
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Query:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAIAGLNDPH
        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++A++EE   ++ KI+ AIA  NDP+
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AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.1e-6159.46Show/hide
Query:  DLDSWGFEEPVSGYYDSSSPDGSA---ASKNIVSERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHALHDQERRIQAEIYELESGTLKKIT-G
        + DSW  EE +SG YDSSSPDG+A   ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++  
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Query:  YEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQE
         +FD+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIEA++E
Subjt:  YEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQE

Query:  ERDYLKIKIETAIAGLNDPHSP
        E++ L++KIET I   N+  SP
Subjt:  ERDYLKIKIETAIAGLNDPHSP

AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.2e-5261.66Show/hide
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        SW  EE +SG YDSSSPDG+A   ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.2e-5261.66Show/hide
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.2e-5261.66Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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