CuGenDBv2

Gene ID	PI0010458
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]
Genome location	chr02:20433003..20435245
RNA-Seq Expression	PI0010458
Synteny	PI0010458
Gene Ontology terms	GO:0006782 - protoporphyrinogen IX biosynthetic process (biological process) GO:0004852 - uroporphyrinogen-III synthase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR003754 - Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase IPR036108 - Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6587847.1 hypothetical protein SDJN03_16412, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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TYK03635.1 Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008444040.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487492 [Cucumis melo]

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XP_011648476.1 uncharacterized protein LOC105434481 [Cucumis sativus]

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XP_038878808.1 uncharacterized protein LOC120070948 [Benincasa hispida]

2.2e-141

89.08

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        RV AYETRWAGPDCARKLVERGKDEKLDAIVFTSTGEVEGLLKSLGHLGL+WEVM+KRWPEMVVAA+GPVTAAGAERLG+KVDL
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TrEMBL top hits

e value

%identity

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A0A0A0LZ08 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

1.6e-150

94.37

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A0A1S3BA78 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

4.6e-153

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A0A5A7U8V3 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

4.6e-153

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A0A5D3BX13 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

2.7e-153

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A0A6J1KXQ2 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

4.2e-130

82.39

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        AATEI +PLL   GDTFLIAALGKDSELLDH  L+  CPNTSRIRVVVP+IATP+GLVEALG+GNHRRVLCPVPRVVGLNEPPVVPNFLRDL A GWVPV
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        RVDAYETRWAGP+CAR LV+RG+DEKLDAIVFTSTGEVEGLLKSL  LGL+WE+M+K+WPEMV+AAHGPVTAAGAERLGVK+DL
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O26268 Putative uroporphyrinogen-III synthase

9.0e-05

26.87

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        A T P   +     L+   G   L  PTL ++         +       +  + FTS++ + +L     E    +        L+A +G           
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Query:  TTICPNTSRI------RV-VVPEIATPTGLVEALGVGNHRRVLCPVPRVVGLNEPPVVPNFLRDLEAKGWVPVRVDAYET---RWAGPDCARKLVERGKD
            P T+R+      RV +VPE  T  GL++AL   N       +PR   L+   V+P   R LE  G   +  +AY +      GP  A +L++   D
Subjt:  TTICPNTSRI------RV-VVPEIATPTGLVEALGVGNHRRVLCPVPRVVGLNEPPVVPNFLRDLEAKGWVPVRVDAYET---RWAGPDCARKLVERGKD

Query:  EKLDAIVFTSTGEVEGLLKSLGHLGLEW-EVMKKRWPEMVVAAHGPVTAAGAERLGVKVDLEEETIVQ
         K+DA+ FTS   VE L K  G+   E  EV+K+    + VAA GP+T    E  G+     E   V+
Subjt:  EKLDAIVFTSTGEVEGLLKSLGHLGLEW-EVMKKRWPEMVVAAHGPVTAAGAERLGVKVDLEEETIVQ

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAGCATAGGCTCCGCGCAACTCAACTGCCCATTTCACCTCAATCCACTCACTTCATCTCCTTCTCCCCCCATTCCCGACCACTCCTCTCCGCGTACGGCGGCCTTCAC
GACGCCTCAAAACTATGCTGGCAGCCTCTCCCACCTCCTCTCTCTCAAAGGCTTCGAACCCCTCTGGTGTCCCACCCTAACCGTCCAGCCCACTCCTCTAGCCATCAAAT
CTCATCTCCTTCCGCCCATTCTGCATTCCTTCTCCGCCATCGCCTTCACTTCCCGCTCCGGCATTACAGCCCTCCTCGACGCTGCTACTGAAATTGGCGAGCCCTTGCTA
CCGTCGCACGGCGATACTTTCTTAATCGCAGCCCTAGGTAAGGACTCAGAGCTTCTCGACCATGAATTTCTTACCACAATTTGCCCTAACACGAGTCGAATTAGAGTTGT
GGTACCTGAAATTGCAACTCCAACCGGTTTAGTGGAAGCTCTTGGAGTTGGAAACCACCGTAGGGTTTTATGTCCGGTTCCTCGCGTCGTGGGACTGAACGAACCCCCAG
TGGTTCCGAACTTCCTCCGTGACCTGGAGGCGAAAGGTTGGGTTCCGGTTCGTGTCGATGCTTACGAGACCCGATGGGCCGGACCCGATTGCGCGAGGAAGCTGGTGGAG
AGAGGGAAGGATGAGAAATTGGATGCCATTGTGTTTACGAGTACTGGGGAAGTGGAGGGGCTGCTTAAAAGCTTGGGGCACTTGGGATTGGAGTGGGAGGTGATGAAAAA
GAGATGGCCGGAAATGGTGGTGGCTGCGCATGGCCCCGTGACAGCGGCAGGAGCTGAGAGACTCGGCGTTAAGGTTGATTTGGAGGAGGAGACCATTGTGCAACAACGTC
AAGATCATCAATTGAAGCCATGTCTATTAAATGATGGTAGTATTAAAAAAAAAAGAACGAAGCAGAAAACCTGTTGTTGCTCCAAAGAAGAAGAAAACCCGGTTGTTCCA
AAGAAAAAGACAGTAGATGCTAAAGGTAGTGGAGGCAAAATTGGTGTTGTTCCAAAGAAGAAAACAGGGAGATGCCAAAGACAGTGGATGCAACATATATATCATTTTTT
TGTTTATCGAAATACAAGCACAACTCAATATGTAAAAATAAGAAAAAAAAACTTTTCCAACCTGATGGAAAAACATTATTTTATTTTAAAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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PSHGDTFLIAALGKDSELLDHEFLTTICPNTSRIRVVVPEIATPTGLVEALGVGNHRRVLCPVPRVVGLNEPPVVPNFLRDLEAKGWVPVRVDAYETRWAGPDCARKLVE
RGKDEKLDAIVFTSTGEVEGLLKSLGHLGLEWEVMKKRWPEMVVAAHGPVTAAGAERLGVKVDLEEETIVQQRQDHQLKPCLLNDGSIKKKRTKQKTCCCSKEEENPVVP
KKKTVDAKGSGGKIGVVPKKKTGRCQRQWMQHIYHFFVYRNTSTTQYVKIRKKNFSNLMEKHYFILK

PI0010458 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome