; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0010530 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0010530
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationchr06:7546946..7549575
RNA-Seq ExpressionPI0010530
SyntenyPI0010530
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR044646 - Pentatricopeptide repeat-containing protein EMB1417-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033710.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-17493.66Show/hide
Query:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M H LAQATL+SFS SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
        ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF

Query:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE
        ADMEELGVQPNMAIVTKVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE SSLEDDE
Subjt:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE

Query:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        E+  DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

TYK23004.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-17493.66Show/hide
Query:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M H LAQATL+SFS SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
        ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF

Query:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE
        ADMEELGVQPNMAIVTKVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE SSLEDDE
Subjt:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE

Query:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        E+  DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

XP_004140747.2 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucumis sativus]5.9e-18094.97Show/hide
Query:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
        M IIFTSM HSLAQATLSSF  SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
Subjt:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA

Query:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH
        LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLES+PRIFFHKMISLYYD+AMH
Subjt:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH

Query:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG
        DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKY+KLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEH KMEHSSTN +DEAEITSE 
Subjt:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG

Query:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        SSLEDDE+MS DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

XP_008439301.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 isoform X2 [Cucumis melo]3.6e-17793.49Show/hide
Query:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
        M+IIFTSM H LAQATL+SFS SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
Subjt:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA

Query:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH
        LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMH
Subjt:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH

Query:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG
        DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE 
Subjt:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG

Query:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        SSLEDDEE+  DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

XP_016899030.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 isoform X1 [Cucumis melo]1.2e-16794.29Show/hide
Query:  YRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTL
        +RMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTL
Subjt:  YRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTL

Query:  ENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVT
        ENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVT
Subjt:  ENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVT

Query:  KVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIW
        KVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE SSLEDDEE+  DPDEILEDEH+W
Subjt:  KVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIW

Query:  SKSNFEHDFMGLGQL
        SKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  SKSNFEHDFMGLGQL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q9 Uncharacterized protein2.9e-18094.97Show/hide
Query:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
        M IIFTSM HSLAQATLSSF  SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
Subjt:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA

Query:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH
        LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLES+PRIFFHKMISLYYD+AMH
Subjt:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH

Query:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG
        DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKY+KLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEH KMEHSSTN +DEAEITSE 
Subjt:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG

Query:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        SSLEDDE+MS DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

A0A1S3AY30 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 isoform X21.7e-17793.49Show/hide
Query:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
        M+IIFTSM H LAQATL+SFS SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA
Subjt:  MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGA

Query:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH
        LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMH
Subjt:  LDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMH

Query:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG
        DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE 
Subjt:  DKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEG

Query:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        SSLEDDEE+  DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  SSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

A0A1S4DTK8 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 isoform X15.6e-16894.29Show/hide
Query:  YRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTL
        +RMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTL
Subjt:  YRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTL

Query:  ENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVT
        ENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVT
Subjt:  ENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVT

Query:  KVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIW
        KVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE SSLEDDEE+  DPDEILEDEH+W
Subjt:  KVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIW

Query:  SKSNFEHDFMGLGQL
        SKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  SKSNFEHDFMGLGQL

A0A5A7SS06 Pentatricopeptide repeat-containing protein2.4e-17493.66Show/hide
Query:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M H LAQATL+SFS SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
        ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF

Query:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE
        ADMEELGVQPNMAIVTKVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE SSLEDDE
Subjt:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE

Query:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        E+  DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

A0A5D3DHA7 Pentatricopeptide repeat-containing protein1.4e-17493.66Show/hide
Query:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M H LAQATL+SFS SYRMLTLVYTFP+TSK+IESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
        ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVF

Query:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE
        ADMEELGVQPNMAIVTKVGN+FQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIR KYLSENGNS NGLSE  KMEHSSTN LDEAEITSE SSLEDDE
Subjt:  ADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDE

Query:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL
        E+  DPDEILEDEH+WSKSNFEHDFMGLGQL
Subjt:  EMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEHDFMGLGQL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2V3H0 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975, chloroplastic3.4e-4546.08Show/hide
Query:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY    +HDK+ EVFADMEEL V P+     +V   F+EL   +  + ++++Y   +++Y Y  G+RV+++ +Y
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY

Query:  LSEN
         SE+
Subjt:  LSEN

Q8LG95 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211903.3e-10165.42Show/hide
Query:  MLTLVYTFP---ITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT
        ML+L Y+ P   + +++  +  F+  P++ VVCAA+GPRPR PRVWKT+KRIGTISKAAK++ C+KGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPL+ VKKAL  
Subjt:  MLTLVYTFP---ITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT

Query:  LENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIV
        LE+++EWK+IIQ+TKWMLSKGQGRTMG+YF+LLNALAED R+DEAEELWNKLF +HLE  PR FF+KMIS+YY R MH KLFEVFADMEELGV+PN+AIV
Subjt:  LENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIV

Query:  TKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEIL
        + VG VF +L M DKYEKLMKKYPPP+WE+RYIKG+RVK++AK L+E      GLS  E       + +D  EI SE    ED  E   D  E+L
Subjt:  TKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEIL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G18975.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.4e-4646.08Show/hide
Query:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY    +HDK+ EVFADMEEL V P+     +V   F+EL   +  + ++++Y   +++Y Y  G+RV+++ +Y
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY

Query:  LSEN
         SE+
Subjt:  LSEN

AT4G18975.2 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.4e-4646.08Show/hide
Query:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY    +HDK+ EVFADMEEL V P+     +V   F+EL   +  + ++++Y   +++Y Y  G+RV+++ +Y
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY

Query:  LSEN
         SE+
Subjt:  LSEN

AT4G18975.3 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.4e-4646.08Show/hide
Query:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY    +HDK+ EVFADMEEL V P+     +V   F+EL   +  + ++++Y   +++Y Y  G+RV+++ +Y
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY

Query:  LSEN
         SE+
Subjt:  LSEN

AT4G18975.4 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.4e-4646.08Show/hide
Query:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY    +HDK+ EVFADMEEL V P+     +V   F+EL   +  + ++++Y   +++Y Y  G+RV+++ +Y
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKY

Query:  LSEN
         SE+
Subjt:  LSEN

AT4G21190.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.4e-10265.42Show/hide
Query:  MLTLVYTFP---ITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT
        ML+L Y+ P   + +++  +  F+  P++ VVCAA+GPRPR PRVWKT+KRIGTISKAAK++ C+KGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPL+ VKKAL  
Subjt:  MLTLVYTFP---ITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT

Query:  LENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIV
        LE+++EWK+IIQ+TKWMLSKGQGRTMG+YF+LLNALAED R+DEAEELWNKLF +HLE  PR FF+KMIS+YY R MH KLFEVFADMEELGV+PN+AIV
Subjt:  LENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMAIV

Query:  TKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEIL
        + VG VF +L M DKYEKLMKKYPPP+WE+RYIKG+RVK++AK L+E      GLS  E       + +D  EI SE    ED  E   D  E+L
Subjt:  TKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEIL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATCATTTTCACTTCAATGCCACACTCTCTAGCCCAAGCAACGCTCTCGTCCTTCTCGGTTTCCTACCGGATGCTTACTTTAGTTTACACTTTTCCAATCACGTC
CAAAAAGATAGAATCTGTAAATTTTTCCTGGTGTCCAAGCAGTTCGGTTGTATGCGCTGCAAAGGGTCCACGGCCGAGATATCCTCGGGTTTGGAAAACCAAAAAGAGGA
TTGGGACTATATCCAAGGCAGCAAAGCTTGTTGATTGTGTAAAGGGACTGTCTAACGTCAAAGAGGAAGTCTATGGGGCTCTTGATTCCTTCATTGCCTGGGAACTGGAG
TTTCCTCTTATTACAGTAAAGAAAGCCCTGAAGACCTTAGAGAACCAAAGAGAATGGAAGAGGATAATTCAGTTGACGAAATGGATGTTAAGTAAAGGCCAGGGAAGAAC
AATGGGAAGCTATTTTACGCTATTAAATGCATTAGCTGAAGATGGAAGAGTTGATGAAGCTGAAGAGCTTTGGAACAAATTGTTTTCCCAGCATCTGGAGAGCATGCCTC
GCATATTCTTTCATAAAATGATATCCCTCTACTACGATCGGGCAATGCACGACAAGTTATTTGAGGTATTTGCTGATATGGAGGAACTTGGAGTTCAACCAAATATGGCA
ATTGTCACTAAGGTTGGAAACGTTTTCCAAGAGTTGGGTATGCTCGATAAATATGAAAAACTGATGAAGAAATATCCCCCACCAAAATGGGAATATCGTTACATCAAAGG
AAAACGCGTCAAAATACGAGCTAAGTATCTATCTGAAAATGGTAATTCCAACAATGGCTTAAGTGAGCATGAGAAAATGGAGCATAGTTCAACAAATTTATTAGATGAAG
CTGAAATAACTTCCGAAGGTTCCAGTCTCGAAGATGATGAAGAAATGAGCGTAGATCCAGATGAAATTCTGGAAGATGAACATATATGGAGCAAATCCAATTTTGAGCAT
GATTTCATGGGGCTTGGGCAATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAATTTTCCGTAGAAAAATTGGAAATGCAAATCATTTTCACTTCAATGCCACACTCTCTAGCCCAAGCAACGCTCTCGTCCTTCTCGGTTTCCTACCGGATGCTTACTTT
AGTTTACACTTTTCCAATCACGTCCAAAAAGATAGAATCTGTAAATTTTTCCTGGTGTCCAAGCAGTTCGGTTGTATGCGCTGCAAAGGGTCCACGGCCGAGATATCCTC
GGGTTTGGAAAACCAAAAAGAGGATTGGGACTATATCCAAGGCAGCAAAGCTTGTTGATTGTGTAAAGGGACTGTCTAACGTCAAAGAGGAAGTCTATGGGGCTCTTGAT
TCCTTCATTGCCTGGGAACTGGAGTTTCCTCTTATTACAGTAAAGAAAGCCCTGAAGACCTTAGAGAACCAAAGAGAATGGAAGAGGATAATTCAGTTGACGAAATGGAT
GTTAAGTAAAGGCCAGGGAAGAACAATGGGAAGCTATTTTACGCTATTAAATGCATTAGCTGAAGATGGAAGAGTTGATGAAGCTGAAGAGCTTTGGAACAAATTGTTTT
CCCAGCATCTGGAGAGCATGCCTCGCATATTCTTTCATAAAATGATATCCCTCTACTACGATCGGGCAATGCACGACAAGTTATTTGAGGTATTTGCTGATATGGAGGAA
CTTGGAGTTCAACCAAATATGGCAATTGTCACTAAGGTTGGAAACGTTTTCCAAGAGTTGGGTATGCTCGATAAATATGAAAAACTGATGAAGAAATATCCCCCACCAAA
ATGGGAATATCGTTACATCAAAGGAAAACGCGTCAAAATACGAGCTAAGTATCTATCTGAAAATGGTAATTCCAACAATGGCTTAAGTGAGCATGAGAAAATGGAGCATA
GTTCAACAAATTTATTAGATGAAGCTGAAATAACTTCCGAAGGTTCCAGTCTCGAAGATGATGAAGAAATGAGCGTAGATCCAGATGAAATTCTGGAAGATGAACATATA
TGGAGCAAATCCAATTTTGAGCATGATTTCATGGGGCTTGGGCAATTGTAAATATACACACACATAATAGTTCCTTGTTGAAGTTTTTGATAGTGTAGACTTTTATATTT
CTGTTTTTATTATTTTGTAGTTTGAATAGACACATTGATCATAGAGCCAATTCCCTTTATGTCAGCCTTGAATATTATAGTCCCCGATCTAACATATGGCCTAGGCTTAG
GAAGAACTAGGGAACAATTCTTGGTTTAAAATTTTCATTAACAAAATATACGAACGTCGTCCTATAACTCATGAGGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQIIFTSMPHSLAQATLSSFSVSYRMLTLVYTFPITSKKIESVNFSWCPSSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELE
FPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDRAMHDKLFEVFADMEELGVQPNMA
IVTKVGNVFQELGMLDKYEKLMKKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRAKYLSENGNSNNGLSEHEKMEHSSTNLLDEAEITSEGSSLEDDEEMSVDPDEILEDEHIWSKSNFEH
DFMGLGQL