; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0010846 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0010846
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description30S ribosomal protein S15, chloroplastic
Genome locationchr07:1458027..1462718
RNA-Seq ExpressionPI0010846
SyntenyPI0010846
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
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GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000589 - Ribosomal protein S15
IPR005290 - Ribosomal protein S15, bacterial-type
IPR009068 - S15/NS1, RNA-binding


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004152189.1 uncharacterized protein LOC101212028 [Cucumis sativus]2.0e-21388.89Show/hide
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XP_022998182.1 uncharacterized protein LOC111492906 [Cucurbita maxima]1.7e-18579.07Show/hide
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XP_023523996.1 uncharacterized protein LOC111788072 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-18578.85Show/hide
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XP_038893797.1 uncharacterized protein LOC120082614 [Benincasa hispida]5.4e-19583.3Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVK2 30S ribosomal protein S15, chloroplastic9.6e-21488.89Show/hide
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A0A1S3BXJ5 30S ribosomal protein S15, chloroplastic4.9e-21890.87Show/hide
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A0A5A7TSB7 30S ribosomal protein S15, chloroplastic4.9e-21890.87Show/hide
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A0A6J1G9E3 30S ribosomal protein S15, chloroplastic5.1e-18378.19Show/hide
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A0A6J1K776 30S ribosomal protein S15, chloroplastic8.4e-18679.07Show/hide
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Query:  LEEIRRNLSEFRSRSSVPPPSDLSSTPSS-SSSWQRGISFQELYKKNAMRKGVDGNAPADSTGGGRISMPFDSIKESLRQVNSARGMQNEQKSGDSFSLS
        LEEIR+NLSEFRSRSSVPPPS+L  TPSS SSSWQRGISFQELYK+NAMRKG DG+AP     G    + FDSI+ESLRQV+S++ MQNE+KSGDS SLS
Subjt:  LEEIRRNLSEFRSRSSVPPPSDLSSTPSS-SSSWQRGISFQELYKKNAMRKGVDGNAPADSTGGGRISMPFDSIKESLRQVNSARGMQNEQKSGDSFSLS

Query:  AFKDSLKLKPSDPSWPPVMGGTEGLPVSVFGKEMKDRKDGKNVGMKTEFVKMYSYEELGNKLRALRPDKEKGKKKFSLTELNDRLVKLRTMEEKETESRI
        AFK+SLKLKP DP+   V GGTE LP SVFGKEM DRK G+N GMKTEFVKMYS+ ELG KLRALRP+KEKGK  FSLTELN+RL+KLRTMEEKETES+I
Subjt:  AFKDSLKLKPSDPSWPPVMGGTEGLPVSVFGKEMKDRKDGKNVGMKTEFVKMYSYEELGNKLRALRPDKEKGKKKFSLTELNDRLVKLRTMEEKETESRI

Query:  GGISFQDLRASLMQMKISDDEKAKKTTIQRLDILGQLVRTPKYMLEPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKI
        GGISFQDLR SL++MK+SDDEKAKKTTIQRLDILGQL RTP +ML+PP+EHLVEKYFHPDNMSSAEK+KIELAKVR++FKMSESDCGSARVQVAQLT KI
Subjt:  GGISFQDLRASLMQMKISDDEKAKKTTIQRLDILGQLVRTPKYMLEPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKI

Query:  NHLTAVLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPD
        NHLTAVL KKDKHSKKGLL MVQ RKKLLKYLRRTDWESYCMVL+ LG RDNPD
Subjt:  NHLTAVLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0K1D1 30S ribosomal protein S158.3e-1350Show/hide
Query:  KIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR
        K + A++ +KFK+ ++D GS  VQ+A LT +IN+L A LQ  KKD HS++GLL MV QR+ LL YL +TD E Y  +++ L LR
Subjt:  KIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR

B0K9P5 30S ribosomal protein S158.3e-1350Show/hide
Query:  KIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR
        K + A++ +KFK+ ++D GS  VQ+A LT +IN+L A LQ  KKD HS++GLL MV QR+ LL YL +TD E Y  +++ L LR
Subjt:  KIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR

B0THS1 30S ribosomal protein S152.4e-1256Show/hide
Query:  KFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR
        KFK  E D GS  VQ+A LT +IN+LT  L+  KKD HS++GLL MV QR+ LL YL+RTD E Y  ++  LGLR
Subjt:  KFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR

B5XSX7 30S ribosomal protein S153.1e-1251.25Show/hide
Query:  AKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTA--VLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR
        AK+  +F   E+D GS  VQVA LT +INHL       KKD HS++GLL MV QR+KLL YL+R D   Y  +++ LGLR
Subjt:  AKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTA--VLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLR

C0QTM4 30S ribosomal protein S152.4e-1243.3Show/hide
Query:  MSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPDTR
        MS   + K E+ K   +F   E D GS  VQ+A LT +I +LT  ++  KKD HS++GL+GMV +R+KLL YL+RTD+E Y  ++  L +R+   +R
Subjt:  MSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQ--KKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPDTR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15810.1 S15/NS1, RNA-binding protein6.6e-7444.54Show/hide
Query:  MALQLSFKPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDTA-----DTSTASPQSSISSYLSDVRARLKQDQQFSSSPTARRPSD--PLTSPNRSTSPASKA
        MAL L+   ++ +  +N SLI  F SNSS+ S P    A       S +SP  S SS + D++  LK   Q +     R+P D     S NR ++  S  
Subjt:  MALQLSFKPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDTA-----DTSTASPQSSISSYLSDVRARLKQDQQFSSSPTARRPSD--PLTSPNRSTSPASKA

Query:  ASLEEIRRNLSEFRSRSSVPPPSDLSSTPSSSSSWQRGISFQELYKKNAMRKGVD-GNAPADSTGGGRISMPFDSIKESLRQVNSARGMQNEQKSGDSFS
           + + +NL++F+ RS+VPPP D       S      IS   LYK++A     D  N+ A       +S   +++K    Q+N++  M    K G    
Subjt:  ASLEEIRRNLSEFRSRSSVPPPSDLSSTPSSSSSWQRGISFQELYKKNAMRKGVD-GNAPADSTGGGRISMPFDSIKESLRQVNSARGMQNEQKSGDSFS

Query:  LSAFKDSLKLKPSDPSWPPVMGGTEGLPVSVFGKEMKDRK--DGKNVGMKTEFVKMYSYEELGNKLRALRPDKEKGKKKFSLTELNDRLVKLRTMEEKET
        L +FK ++                E LP  +F  +M + K  +G+     TEF+  Y+ EELG KLR LRP+ EK +  FSL ELN RLVKLR +EEKE 
Subjt:  LSAFKDSLKLKPSDPSWPPVMGGTEGLPVSVFGKEMKDRK--DGKNVGMKTEFVKMYSYEELGNKLRALRPDKEKGKKKFSLTELNDRLVKLRTMEEKET

Query:  ESRIGGISFQDLRASLMQMKISDDEKAKKTTIQRLDILGQLVRTPKYMLEPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQL
        + R    +F  LR  +   K   +E ++ ++ Q + I+G L   P+Y L PPKE LV+ YFHPDNMSSAEKMKIEL+KVR++FKMSESDCGSARVQVAQL
Subjt:  ESRIGGISFQDLRASLMQMKISDDEKAKKTTIQRLDILGQLVRTPKYMLEPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQL

Query:  TIKINHLTAVLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPD
        T KI HL++ L KKDKHS+KGLLGMVQ+RKKLLKYLRRTDW+SYC+VL  L LRDNPD
Subjt:  TIKINHLTAVLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPD

AT1G80620.1 S15/NS1, RNA-binding protein2.6e-8647.38Show/hide
Query:  MALQLSFKPKNPKTLTNPSLIHLF----SSNSSAPSDPNDDTADTSTASPQSSISSYLSDVRARLKQDQQFSSSPTARRPSDPLTSPNRSTSPASKAASL
        MAL L+ +PK  +  +NPSLIHLF    SS+SS+P D N+     S +S    ISSY S +R+ LKQ Q         R             P +  +  
Subjt:  MALQLSFKPKNPKTLTNPSLIHLF----SSNSSAPSDPNDDTADTSTASPQSSISSYLSDVRARLKQDQQFSSSPTARRPSDPLTSPNRSTSPASKAASL

Query:  EEIRRNLSEFRSRSSVPPPSDLSSTPSSSSSWQRGISFQELYKKNAMRKGVDGNAPADSTGGGRI-SMPFDSIKESLRQVNSARGMQNEQKSGDS--FSL
        ++IRRNL+EFRSR++ PPP D+                Q+L+K+N + K         S G  RI  +P  +IK +LRQ      M+ +Q + +S   +L
Subjt:  EEIRRNLSEFRSRSSVPPPSDLSSTPSSSSSWQRGISFQELYKKNAMRKGVDGNAPADSTGGGRI-SMPFDSIKESLRQVNSARGMQNEQKSGDS--FSL

Query:  SAFKDSLKLKPSDPSWPPVMGG-TEGLPVSVFGKEMKDRKDGKNVGMKTEFVKMYSYEELGNKLRALRPDKEKGKKKFSLTELNDRLVKLRTMEEKETE-
        S  ++ +K   +D     V+GG  EGLP SV GKE+++ +D     MK+EF+K Y   ELG KLR  RP+ +K +  FSL ELN RLVKLR MEE++ + 
Subjt:  SAFKDSLKLKPSDPSWPPVMGG-TEGLPVSVFGKEMKDRKDGKNVGMKTEFVKMYSYEELGNKLRALRPDKEKGKKKFSLTELNDRLVKLRTMEEKETE-

Query:  -SRIGGISFQDLRASLMQMKISDDEKAKKTTIQRLDILGQLVRTPKYMLEPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQL
         S +      +LR+   +      +  K    Q  +I G L  TPKYMLEPPK+ LVE YFHPDNMSSAEKMKIELAKVR++FKMSESDCGSARVQVAQL
Subjt:  -SRIGGISFQDLRASLMQMKISDDEKAKKTTIQRLDILGQLVRTPKYMLEPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQL

Query:  TIKINHLTAVLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPD
        T KI HL++VL KKDKHS+KGL+ MVQ+RKKLLKY+RRTDW+SYC+ L  LGLRDNPD
Subjt:  TIKINHLTAVLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDTLGLRDNPD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCTTCAACTCAGCTTCAAACCCAAGAACCCCAAAACTCTCACCAATCCTTCTCTCATCCATCTCTTCTCCTCTAATTCCTCTGCCCCATCTGATCCAAACGATGA
CACAGCCGATACATCCACTGCCTCACCTCAATCTTCCATCTCCTCTTACCTCAGCGATGTCAGAGCCCGCCTCAAACAGGACCAACAATTTTCTTCTTCACCCACTGCTA
GAAGACCTTCCGACCCACTCACTTCTCCCAATCGCTCGACTTCTCCGGCTTCCAAAGCCGCCTCACTTGAAGAAATCAGAAGAAATCTCTCTGAATTTCGCAGCCGATCG
TCTGTGCCTCCTCCCTCCGACCTCAGTTCTACACCTTCCTCTTCTTCGTCTTGGCAGCGCGGTATTTCTTTTCAAGAGCTGTACAAGAAAAATGCCATGAGAAAGGGTGT
GGATGGTAATGCACCTGCAGATTCGACGGGAGGTGGCCGTATCAGTATGCCATTTGATTCTATTAAGGAGAGCTTACGGCAGGTGAATTCAGCGAGAGGGATGCAAAATG
AACAGAAGAGTGGGGATTCGTTTTCTTTATCGGCGTTTAAGGACAGCTTGAAATTGAAACCGTCGGACCCGTCGTGGCCACCGGTGATGGGTGGGACAGAGGGGTTACCA
GTGTCGGTTTTTGGGAAGGAGATGAAGGACAGAAAAGATGGGAAGAATGTGGGAATGAAGACAGAGTTTGTGAAGATGTATAGCTATGAGGAATTGGGAAATAAGTTGAG
AGCTCTGAGGCCAGATAAAGAAAAAGGGAAAAAAAAATTTTCATTGACGGAGTTGAATGACAGGTTGGTGAAGCTTAGGACAATGGAGGAGAAGGAGACTGAGTCGAGAA
TTGGGGGAATTTCATTTCAGGATTTGAGAGCGAGCTTGATGCAGATGAAGATTTCTGATGATGAAAAGGCAAAGAAAACGACAATCCAGCGGCTCGATATCTTGGGTCAG
CTAGTTCGAACACCAAAATATATGCTAGAACCTCCAAAGGAACATCTTGTTGAGAAGTATTTCCATCCGGATAACATGTCATCTGCCGAAAAGATGAAAATTGAGCTAGC
AAAAGTTAGAGACAAATTTAAAATGTCAGAATCAGACTGTGGATCTGCTCGTGTTCAAGTTGCTCAACTGACCATTAAAATCAATCATCTAACTGCCGTCCTGCAGAAGA
AGGATAAGCATTCTAAGAAAGGTCTTCTTGGAATGGTACAACAGAGGAAAAAGCTACTGAAGTATCTTCGACGAACCGACTGGGAATCCTACTGTATGGTTCTTGACACA
CTTGGTCTTCGAGACAACCCGGATACAAGGCCTGAGTTCAAGTGGTTCTCTGTCCATCTCTTTCCCGAGGTTTGCACTTCAGTTTTGTTGGAGAGAAAGTTCTGTGATAT
TTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATACCTGCTAACCTGATCTCTAAGTTTTGCCGACCCGACCCGGTTTTGCCGTCCCAGAGGTTTATTTCTCAAACCCTAGTCAGACTTCGGCGCCTTCTTCTTCAGTTTCT
CTTACAATGGCGCTTCAACTCAGCTTCAAACCCAAGAACCCCAAAACTCTCACCAATCCTTCTCTCATCCATCTCTTCTCCTCTAATTCCTCTGCCCCATCTGATCCAAA
CGATGACACAGCCGATACATCCACTGCCTCACCTCAATCTTCCATCTCCTCTTACCTCAGCGATGTCAGAGCCCGCCTCAAACAGGACCAACAATTTTCTTCTTCACCCA
CTGCTAGAAGACCTTCCGACCCACTCACTTCTCCCAATCGCTCGACTTCTCCGGCTTCCAAAGCCGCCTCACTTGAAGAAATCAGAAGAAATCTCTCTGAATTTCGCAGC
CGATCGTCTGTGCCTCCTCCCTCCGACCTCAGTTCTACACCTTCCTCTTCTTCGTCTTGGCAGCGCGGTATTTCTTTTCAAGAGCTGTACAAGAAAAATGCCATGAGAAA
GGGTGTGGATGGTAATGCACCTGCAGATTCGACGGGAGGTGGCCGTATCAGTATGCCATTTGATTCTATTAAGGAGAGCTTACGGCAGGTGAATTCAGCGAGAGGGATGC
AAAATGAACAGAAGAGTGGGGATTCGTTTTCTTTATCGGCGTTTAAGGACAGCTTGAAATTGAAACCGTCGGACCCGTCGTGGCCACCGGTGATGGGTGGGACAGAGGGG
TTACCAGTGTCGGTTTTTGGGAAGGAGATGAAGGACAGAAAAGATGGGAAGAATGTGGGAATGAAGACAGAGTTTGTGAAGATGTATAGCTATGAGGAATTGGGAAATAA
GTTGAGAGCTCTGAGGCCAGATAAAGAAAAAGGGAAAAAAAAATTTTCATTGACGGAGTTGAATGACAGGTTGGTGAAGCTTAGGACAATGGAGGAGAAGGAGACTGAGT
CGAGAATTGGGGGAATTTCATTTCAGGATTTGAGAGCGAGCTTGATGCAGATGAAGATTTCTGATGATGAAAAGGCAAAGAAAACGACAATCCAGCGGCTCGATATCTTG
GGTCAGCTAGTTCGAACACCAAAATATATGCTAGAACCTCCAAAGGAACATCTTGTTGAGAAGTATTTCCATCCGGATAACATGTCATCTGCCGAAAAGATGAAAATTGA
GCTAGCAAAAGTTAGAGACAAATTTAAAATGTCAGAATCAGACTGTGGATCTGCTCGTGTTCAAGTTGCTCAACTGACCATTAAAATCAATCATCTAACTGCCGTCCTGC
AGAAGAAGGATAAGCATTCTAAGAAAGGTCTTCTTGGAATGGTACAACAGAGGAAAAAGCTACTGAAGTATCTTCGACGAACCGACTGGGAATCCTACTGTATGGTTCTT
GACACACTTGGTCTTCGAGACAACCCGGATACAAGGCCTGAGTTCAAGTGGTTCTCTGTCCATCTCTTTCCCGAGGTTTGCACTTCAGTTTTGTTGGAGAGAAAGTTCTG
TGATATTTAATTTATGTCATCATATCATGAAGAGAGATGCCTTGAGCTTGTTGGCATGAAAGGCAAATTGGCATTGAAAGCGTGGAGATAGTTCATTGCTATAATGGGAA
GTGCAGATTTTTCAAGTTTTATTTCAATAGATTGTATTAGCAAATCCTGGTCTGATTTAATAATTTTTTTTTTTTTTGGGAATTCATTCCTTTTTAGCTGCAAAATGAAC
TGCCCTGCTTCTGCTGGCAAATAATGGATTTGAAAGTAAAGTGGTCTGCAACAATTTTAGCCTGCAGTTGAACCATTTTCATTTCATTTTACTTATACTTTTTATACTAA
ATCTTCCCTTTCTTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALQLSFKPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDTADTSTASPQSSISSYLSDVRARLKQDQQFSSSPTARRPSDPLTSPNRSTSPASKAASLEEIRRNLSEFRSRS
SVPPPSDLSSTPSSSSSWQRGISFQELYKKNAMRKGVDGNAPADSTGGGRISMPFDSIKESLRQVNSARGMQNEQKSGDSFSLSAFKDSLKLKPSDPSWPPVMGGTEGLP
VSVFGKEMKDRKDGKNVGMKTEFVKMYSYEELGNKLRALRPDKEKGKKKFSLTELNDRLVKLRTMEEKETESRIGGISFQDLRASLMQMKISDDEKAKKTTIQRLDILGQ
LVRTPKYMLEPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKMKIELAKVRDKFKMSESDCGSARVQVAQLTIKINHLTAVLQKKDKHSKKGLLGMVQQRKKLLKYLRRTDWESYCMVLDT
LGLRDNPDTRPEFKWFSVHLFPEVCTSVLLERKFCDI