CuGenDBv2

Gene ID	PI0011077
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome location	chr03:25932338..25933627
RNA-Seq Expression	PI0011077
Synteny	PI0011077
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7015908.1 hypothetical protein SDJN02_21012, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.0e-78

82.56

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XP_008441227.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485423 [Cucumis melo]

9.3e-93

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XP_011649907.1 uncharacterized protein LOC105434677 [Cucumis sativus]

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95.9

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XP_023549797.1 putative protein TPRXL [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.9e-78

80.9

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XP_038885392.1 uncharacterized protein LOC120075791 [Benincasa hispida]

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94.39

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC103485423

4.5e-93

94.87

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A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein

4.5e-93

94.87

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A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC111020211

3.0e-73

83.77

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A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC111456137

3.8e-76

80.81

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         DWRKSNRQNSQRDPFFDAF+ECSKEP+ A        AELW+  SNGKA++RSLSDRFGFLN  SSCKRTCGVSESIVY PR  RSSFDLLN R+GG
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A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC111487739

7.2e-75

80.81

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G22680.1 unknown protein

1.1e-19

42.13

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        T    +RR++S   SS+ ++S   S SSSS  S  F  +SP    ATP+      IPFSWE LPG PK+ S  R        LS+LLPLPP+ +  S + 
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Query:  RFGFQDWRKSNRQNSQRDPFFDAFLECSKEPTTAAVDAELWSGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTARSSFDLLNQRSGG
        R      +K+    + RDPF  A +ECSK  TT   D E  +G  + K + +S S   G LNLYSSC+R C VSESIVYLP++  +S+D L+  + G
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AT1G71970.1 unknown protein

5.7e-24

Show/hide

Query:  SSRRTHSFSSSSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSLLPLPP--NSTTPSSSKRFGFQ
        SSRR    S SSS+S SS SS S  S  FP DSP ++ ATP+R     +PFSWE LPG PK  S     R +    + LLPLPP  N + P++ K+    
Subjt:  SSRRTHSFSSSSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSLLPLPP--NSTTPSSSKRFGFQ

Query:  DWRKSNRQNS----QRDPFFDAFLECSKEPTTAA-----------VDAELW--SGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTAR-SS
            S+++NS     +DPF  A LECSK+  T +           VD      SG S+      S+ DRFG +NLY SC+RTC V+ESIVYLPR  + +S
Subjt:  DWRKSNRQNS----QRDPFFDAFLECSKEPTTAA-----------VDAELW--SGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTAR-SS

Query:  FDLLNQR
        +D L  R
Subjt:  FDLLNQR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATACAATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCTCTTCTTCTTCTTCTAATTCCCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGCTCTTACTATTTCCCCGA
TGATTCTCCTTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCAGGAATCCCCAAAAAACAGTCTCCGGCCAGGC
TCCGACGAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCCTCTCTCCTCCCTTTACCTCCCAATTCCACTACTCCATCCTCTTCCAAACGCTTCGGATTTCAAGATTGGAGGAAATCGAAC
CGCCAAAATTCACAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCACCGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGTGGCGCTAGCAATGGTAA
GGCGATTACAAGAAGTTTGAGCGATCGATTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGGACATGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTTCCTAGAACGGCGA
GGAGTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGCAGCGGTGGTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTTATCTAACGATGATTTTTGTAATTTGCTCAAAGAATAATTATAATTCATATAAATTCCTTAAAAAAAATTTAATTAATATATATATATAACAAAATTCTTAGAAACTT
GAAGTGGGTTTTTGTGTGAGCAAAAAGCCAAATCCCAAATCCCAAATTTTCCCAAATTTCTCTAAAAAAGAGAATGTGAAGAATCAAAGAGAAAAAAGAAAAAAGAAAGA
AAACAATGAATACAATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCTCTTCTTCTTCTTCTAATTCCCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGCTCTTACTATTTC
CCCGATGATTCTCCTTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCAGGAATCCCCAAAAAACAGTCTCCGGC
CAGGCTCCGACGAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCCTCTCTCCTCCCTTTACCTCCCAATTCCACTACTCCATCCTCTTCCAAACGCTTCGGATTTCAAGATTGGAGGAAAT
CGAACCGCCAAAATTCACAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCACCGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGTGGCGCTAGCAAT
GGTAAGGCGATTACAAGAAGTTTGAGCGATCGATTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGGACATGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTTCCTAGAAC
GGCGAGGAGTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGCAGCGGTGGTTGAAGAAAAAATAAGAGATAAGTTGGTGATTTGATTAAATGTTTGTTTAGTTTAATTAATCTCTTTG
TTTGTGGTGAAATGATTATGAATATGGAATGGCTTAATCCTAATTTGGGTTTGTTAATCTGTGATTACTGCGCTGGATTTGTTTGTGAAATTTACGTCAAAATTTGAATT
GAAAATGGCAAAATTAGTCTCTTAATTTCTTTTTCTTATTCTTTTTTGTTTTTAACTATATTATATTATATCATATCATATTATATGTGAATTATTTATTTGTCACTTAA
ATTATTGTGTTGCTCTGTATTGTATTATTTACATGTGACACTTCCCGACATTGTGTTTGTAATTTACGATATCATCAATTTCCATTTTTCCCTTTGGACCATTCTATAAA
TCAAACCCACAATTATTTTCTTTCTAATTTTTTAATTATTTTATTTTAATATAATCCTTTTGTACCAATTTACATTATCC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNTMFQSSRRTHSFSSSSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSLLPLPPNSTTPSSSKRFGFQDWRKSN
RQNSQRDPFFDAFLECSKEPTTAAVDAELWSGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTARSSFDLLNQRSGG

PI0011077 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome