; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0011196 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0011196
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRibonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationchr06:19830812..19832312
RNA-Seq ExpressionPI0011196
SyntenyPI0011196
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0004748 - ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000358 - Ribonucleotide reductase small subunit family
IPR009078 - Ferritin-like superfamily
IPR012348 - Ribonucleotide reductase-like
IPR030475 - Ribonucleotide reductase small subunit, acitve site
IPR033909 - Ribonucleotide reductase small subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581100.1 hypothetical protein SDJN03_21102, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-18194.53Show/hide
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XP_008450003.1 PREDICTED: ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucumis melo]1.9e-18396.35Show/hide
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XP_022935447.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucurbita moschata]5.2e-18194.53Show/hide
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XP_023527500.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-18194.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8R8 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.4e-18496.66Show/hide
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A0A1S3BNB8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain9.3e-18496.35Show/hide
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A0A445FE72 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain isoform A7.4e-17389.06Show/hide
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A0A6J1F5K5 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.5e-18194.53Show/hide
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A0A6J1J9K8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain6.2e-18094.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O57175 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain4.2e-13371.21Show/hide
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        EP+LAPNP+RF +FPIQY  IW MYKKAEASFWT EEVD+S+DI  W+ LT DEK+FI HVLAFFAASDGIV ENLA RF  EVQ+ EAR FYGFQ+AIE
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Query:  DFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEYQ
        DFACL++  L    SE+ VR I+T+AV+IE+EF+  ALPV L+GMN ++M  YIEFVADRL+  LG++KIYNV NPFD+ME ISL+GKTNFFEKRVGEYQ
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        K  VMS  +     + F +D DF
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P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B4.9e-15880.48Show/hide
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        MPS+P+EP+L P PDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R W+ SLT+DE+HFI HVLAFFAASDGIVLENL+ RFM +VQ++EARAFY
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        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LFRAI+T+PCV KKA+WA+KWI  + SFAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
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Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACL+YSLLR KL EDR++ IV +AV IEREFVCDALP ALVGMN +LMSQYIEFVADRL+ ALG  K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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        KRVGEYQKAS+MS+++GN      H FK+DEDF
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.0e-16785.11Show/hide
Query:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFYG
        MP IP+EPLLA +PDRFCMFPIQYPQIWEMYKKA ASFWTAEEVDLS D RHW++LT  E+HFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQ+AEARAFYG
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Query:  FQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR
        FQIAIENIHSEMYSLLLE+YIKDS+EK+RLFRA++T PCV+KKA WAL+WI+ +++FAER++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISR
Subjt:  FQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR

Query:  DEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEK
        DEGLHCDFACLLYSLLR KL+E+RV+ IV +AV IEREFVCDALP ALVGMNGDLMS+YIEFVADRL+ ALGY+K+YN QNPFDWMELISLQGKTNFFEK
Subjt:  DEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEK

Query:  RVGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        RVGEYQKASVMS+LNGNG  HEFK+DEDF
Subjt:  RVGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A2.5e-14174.38Show/hide
Query:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFYGFQIAI
        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKAEASFWTAEEVDLS D++ W++LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQ+ EARAFYGFQIA+
Subjt:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFYGFQIAI

Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF AI+T+PC+ KKA W L WI+S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
Subjt:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH

Query:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V +IV EAV IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+  LG E+ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
Subjt:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY

Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C5.8e-15981.33Show/hide
Query:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWD-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFY
        MPS+P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R W+ SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQ++EARAFY
Subjt:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWD-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFY

Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LFRAI+T+PCV KKA WA+KWI+ + +FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE+RV+ IV +AV IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+GALGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A1.7e-14274.38Show/hide
Query:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFYGFQIAI
        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKAEASFWTAEEVDLS D++ W++LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQ+ EARAFYGFQIA+
Subjt:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFYGFQIAI

Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF AI+T+PC+ KKA W L WI+S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
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Query:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V +IV EAV IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+  LG E+ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
Subjt:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY

Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein4.1e-16081.33Show/hide
Query:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWD-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFY
        MPS+P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R W+ SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQ++EARAFY
Subjt:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWD-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFY

Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LFRAI+T+PCV KKA WA+KWI+ + +FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE+RV+ IV +AV IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+GALGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
Subjt:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE

Query:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTTCAATTCCCGATGAGCCTCTCCTCGCCCCTAACCCCGATCGCTTCTGCATGTTCCCAATTCAATATCCCCAAATCTGGGAGATGTACAAGAAAGCCGAAGCCTC
CTTCTGGACCGCCGAAGAGGTCGATCTCTCACAAGACATTCGCCATTGGGATTCCTTAACTTCCGACGAGAAACACTTCATCACTCACGTCCTTGCCTTCTTCGCTGCCT
CTGATGGTATCGTTTTGGAGAACCTTGCTGGACGGTTCATGAAAGAAGTCCAACTCGCTGAAGCCAGAGCCTTCTATGGTTTCCAAATTGCTATTGAGAACATTCATTCT
GAGATGTATAGTCTTCTCCTTGAAACTTATATCAAAGATTCGAATGAGAAGAATCGGTTATTTCGTGCTATTGATACTGTCCCATGTGTGAAGAAGAAGGCCGATTGGGC
GTTGAAGTGGATTGAGAGCACGGACTCGTTTGCTGAGCGAATTTTGGCATTTGCTTGTGTTGAGGGAATTTTCTTTTCAGGTAGTTTCTGCTCTATTTTCTGGTTGAAAA
AACGTGGGTTAATGCCTGGATTAACGTTCTCAAATGAGTTAATTTCACGAGATGAAGGCCTTCATTGTGATTTTGCTTGTTTGTTGTATTCATTGTTGAGGAAGAAATTG
AGTGAGGATCGAGTGAGGGAGATTGTTACGGAGGCCGTGAATATAGAGAGGGAATTCGTTTGTGATGCTTTGCCGGTGGCTCTTGTTGGAATGAATGGAGATTTGATGAG
TCAATACATTGAATTTGTGGCCGATAGATTGGTTGGAGCATTAGGGTATGAGAAAATCTACAATGTTCAAAACCCATTTGATTGGATGGAGTTGATTTCGTTGCAAGGAA
AGACTAATTTCTTTGAGAAAAGAGTTGGGGAATATCAAAAGGCATCTGTAATGTCAAATCTAAATGGAAATGGAGGAATTCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTACAAATTTCAAGAAAAAGAAATTCGGTGAAATTTAGATAAAAAAAATTTAAATCACCCGCTATTTTTCAAAACCCTATCCCCAATTTCATTCTATAAAAGCCCTAGTT
ATTCGCTCCTTCCTCCACCATCAAAAATCCCCAAAATCACGCCGGAATCCCTAATTCCCTCTTCCAATTTCCGACCATGCCTTCAATTCCCGATGAGCCTCTCCTCGCCC
CTAACCCCGATCGCTTCTGCATGTTCCCAATTCAATATCCCCAAATCTGGGAGATGTACAAGAAAGCCGAAGCCTCCTTCTGGACCGCCGAAGAGGTCGATCTCTCACAA
GACATTCGCCATTGGGATTCCTTAACTTCCGACGAGAAACACTTCATCACTCACGTCCTTGCCTTCTTCGCTGCCTCTGATGGTATCGTTTTGGAGAACCTTGCTGGACG
GTTCATGAAAGAAGTCCAACTCGCTGAAGCCAGAGCCTTCTATGGTTTCCAAATTGCTATTGAGAACATTCATTCTGAGATGTATAGTCTTCTCCTTGAAACTTATATCA
AAGATTCGAATGAGAAGAATCGGTTATTTCGTGCTATTGATACTGTCCCATGTGTGAAGAAGAAGGCCGATTGGGCGTTGAAGTGGATTGAGAGCACGGACTCGTTTGCT
GAGCGAATTTTGGCATTTGCTTGTGTTGAGGGAATTTTCTTTTCAGGTAGTTTCTGCTCTATTTTCTGGTTGAAAAAACGTGGGTTAATGCCTGGATTAACGTTCTCAAA
TGAGTTAATTTCACGAGATGAAGGCCTTCATTGTGATTTTGCTTGTTTGTTGTATTCATTGTTGAGGAAGAAATTGAGTGAGGATCGAGTGAGGGAGATTGTTACGGAGG
CCGTGAATATAGAGAGGGAATTCGTTTGTGATGCTTTGCCGGTGGCTCTTGTTGGAATGAATGGAGATTTGATGAGTCAATACATTGAATTTGTGGCCGATAGATTGGTT
GGAGCATTAGGGTATGAGAAAATCTACAATGTTCAAAACCCATTTGATTGGATGGAGTTGATTTCGTTGCAAGGAAAGACTAATTTCTTTGAGAAAAGAGTTGGGGAATA
TCAAAAGGCATCTGTAATGTCAAATCTAAATGGAAATGGAGGAATTCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGAAGATTGAAGATGAAGATGAGTTCACTGTGTAGAA
TAATGTTTGTGGGTTCTTCTTCTTTCTTGTAATTCTTATCTGTAGTTTAGTATTGAAGGATTAGATTTGATTAAGTTTGGTTAATTTCAGATTGAAAAATGTTTCATGGT
TTGGGTTTATGTTTATGTTGCATTTGGTGTGTTATGGTCACCAACTATGGCAGACATATGAAGCTTAAGATATGATGAGGTAAAAGAACCATTTTGTGATACTTGCTTTG
CTGCTGTTGTGTATCTTTGTTAAAGCATTATTATGTAATATAATGTTTCATCATATAACACACAACTCTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDIRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQLAEARAFYGFQIAIENIHS
EMYSLLLETYIKDSNEKNRLFRAIDTVPCVKKKADWALKWIESTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLLRKKL
SEDRVREIVTEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF