; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0011346 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0011346
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationchr11:1466211..1467929
RNA-Seq ExpressionPI0011346
SyntenyPI0011346
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold122G001230 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-10699Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein6.9e-10598.02Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988829.9e-10498.48Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein5.6e-10799Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557807.1e-8685.64Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883501.3e-8283.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein2.7e-2944.33Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)4.3e-3547.52Show/hide
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AT2G33510.2 unknown protein4.5e-3244.24Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACAGCAATATCCGGCGGAAAACGTGGAGGATGTACTGGTGGTGGCTGGATGCAAGAGATGCTTCATGTATTTCATGGTGCCAAAACAGGTTGAAGATTGTCCCAAATGCA
GCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGACGAGAGTAATGGGTTCCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGACATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCTCTTGAGCAATCTTTCCGTAACTTCACCCTC
AACCACCGTCTATCCTCCGCCGCCCCCTCCTCCGCCGGAGTTCGGAGATCACCGTCTTCATTTTCTTCCTCTTCTTCCTCCTCCGATGACGAACCTCATCTTCCTCTTCA
TCAACATAATCGCTTCGACACAATCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCCCTCCCTCCTTTCTGGGAGCAATGCCTCGATTTGAAGACAGGGGAAGTTTACTATAGAAACT
GCCGAACGGGAATGAAGGTAAAAGAAGATCCGAGGACAGCCGTAGCACAAAGCCGAGATTTATACTCGGAAGACGACGGGGAGGACGGTGATGAGAGTTCTTCAGACGGA
GGAAGTGAGGAGTCGTGCTCTTCATCGTCGTACGGTGGTAGTAGACAGCAATATCCGGCGGAAAACGTGGAGGATGTACTGGTGGTGGCTGGATGCAAGAGATGCTTCAT
GTATTTCATGGTGCCAAAACAGGTTGAAGATTGTCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGACGAGAGTAATGGGTTCCCATGAACCACATTTT
TTTTCTTTTTGAGAAAACAAGAAATCAAAATCAAACTGTATTTGGGTTAATTGATCTGACAAAATCATTGATTCTTTTTCTTTGGATTAATTTGGTGAGCAAAAGGGTAA
ATGGGGTTTAATTTCTTAATTAGCTCTATAATCTCTATGTCGATCTGTAGTGGTTCTGTGTGTTGTTATTGATATGGAGATAATAATTTTAGAAAAAAGAATTGAAATGA
AAAGAATGTGAGGAACTGCCATGGATGTATGAGAAGGAAGAAGATAGAGGGGGTATGAATGGGATGGTCAACGACTCAAAGGAAGAAGGAATAATATTTTGCTCGTGAAG
ACAGCGACTTGTTGCTTTCATGATTCCACGACCCACACTGATTGAATCGTACGCAATTATTATTATTATTTTAAAACGGAAAATTCAATCCATTTACTAATTTTTTAATA
TGATTAATTATAGGATTATGTAATTCCAAATGGGATAACGTTACCCATTATAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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