CuGenDBv2

Gene ID	PI0011419
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	ARM repeat superfamily protein
Genome location	chr07:21820004..21829568
RNA-Seq Expression	PI0011419
Synteny	PI0011419
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0066810.1 Armadillo-like helical [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008463698.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1 [Cucumis melo]

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XP_022940916.1 uncharacterized protein LOC111446360 [Cucurbita moschata]

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XP_038898234.1 uncharacterized protein LOC120085959 isoform X1 [Benincasa hispida]

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A0A0A0L246 Uncharacterized protein

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A0A1S3CKC0 uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1

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A0A5D3DVV9 Armadillo-like helical

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A0A6J1FJQ7 uncharacterized protein LOC111446360

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A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

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86.37

Show/hide

Query:  MEEFSVNDPTQLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRTLAC
        MEEF+V+DPTQLL+AAA+FANYPGVRTD SVKEF  RFPLP +INALQ KAE PGLE+TLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGL+ADSQ VR+LAC
Subjt:  MEEFSVNDPTQLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRTLAC

Query:  KTVTRLLQESNETALSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNERVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS
        KTVTRLL+E++ T   A QLI+DY IYPLL++CLLNGNE+VANSSMD++K LAAFP+GMEII P+NKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSS
Subjt:  KTVTRLLQESNETALSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNERVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS

Query:  SVASAIYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDELCVRNLI
        SVASA+YN+NLL+LLESEI+NS DTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTSFLQLLSSIISN SAESILRSRAMVI GRLLSKENIFSLVDE CVR LI
Subjt:  SVASAIYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDELCVRNLI

Query:  SAIDGILGSSEGEDVNVSEASIEALGQIGSSTLGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIA
        S+ID ILGSSEG+DVNV E++ EALGQIGSS  GATLLLSS+PTCVK+VI AAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGE+RSENDI+LNDNAEENL DLIYQ A
Subjt:  SAIDGILGSSEGEDVNVSEASIEALGQIGSSTLGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIA

Query:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIVNIVGDASTETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKVR
        SRS K+TPSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDI+NIV DASTETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASK++
Subjt:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIVNIVGDASTETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKVR

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

5.4e-157

58.49

Show/hide

Query:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRTLACKTVTR
        + D  QL  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+TLV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESNETALSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNERVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ +   +S++QL+++ GIYPLLLD ++N ++ VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESNETALSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNERVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  IYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDELCVRNLISAIDG
        +  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E  V+ LISAIDG
Subjt:  IYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDELCVRNLISAIDG

Query:  ILGSSEGEDVNVSEASIEALGQIGSSTLGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK
         L S E  D +  EA+I+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI GE+R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K
Subjt:  ILGSSEGEDVNVSEASIEALGQIGSSTLGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK

Query:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIVNIVGDASTETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSS
        +TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K++I+NIV DA+TET KI MEARYNCC AIH+AF+ S
Subjt:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIVNIVGDASTETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSS

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

3.6e-153

55.01

Show/hide

Query:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRTLACKTVTR
        + D  QL  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+TLV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESNETALSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNERVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ +   +S++QL+++ GIYPLLLD ++N ++ VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESNETALSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNERVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  IYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDEL-----------
        +  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E            
Subjt:  IYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDEL-----------

Query:  ---------------------CVRNLISAIDGILGSSEGEDVNVSEASIEALGQIGSSTLGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF
                             CV+ LISAIDG L S E  D +  EA+I+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI 
Subjt:  ---------------------CVRNLISAIDGILGSSEGEDVNVSEASIEALGQIGSSTLGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF

Query:  GESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIVNIVGDASTETTKIGMEARYNCCL
        GE+R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K+TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K++I+NIV DA+TET KI MEARYNCC 
Subjt:  GESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIVNIVGDASTETTKIGMEARYNCCL

Query:  AIHKAFMSS
        AIH+AF+ S
Subjt:  AIHKAFMSS

Sequences

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CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATTTTCTGTAAATGATCCGACTCAGCTACTCCAAGCAGCTGCAAACTTCGCAAATTATCCTGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCG
CTTCCCCCTTCCCGCCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAATTTCCAGGTCTAGAGGATACTCTGGTTGCATGTCTTGACAGGATATTCAAAACCAAGTATGGAG
CTTCTCTTATACCGCACTATATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACGGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAACCTTAGCTTGTAAAACGGTCACTCGCCTTTTGCAGGAGTCC
AATGAAACTGCTCTTTCGGCTATACAACTAATTATTGACTATGGCATCTATCCACTTTTGCTCGACTGTCTTCTCAATGGTAACGAACGAGTTGCTAACTCATCGATGGA
TTCAATTAAGACACTGGCTGCATTTCCACAGGGGATGGAAATCATCATCCCGTCAAATAAAACAGAAGCAACACACCTAGGGACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGG
GAAGAGTTCGAGTCATGGCATTGGTAGTGAAGCTATTTTCAGTTTCTAGTTCTGTGGCATCGGCAATATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAAT
AATTCAAAGGACACACTTGTAACTTTAAGTGTGTTGGAACTCTTGTACGAGCTAGTGGAGATTGAACACGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGTTTTCTCCAACTACT
AAGCTCTATAATCAGCAACTCATCAGCAGAGTCTATTCTACGATCAAGAGCCATGGTCATTTGTGGAAGACTTTTGTCCAAAGAGAACATTTTCTCGCTTGTAGATGAAT
TGTGTGTGCGGAATTTGATATCTGCTATAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGAGAGGATGTAAATGTATCTGAAGCTTCAATTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCA
AGCACGTTGGGAGCCACCTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACCTGTGTGAAGCATGTAATTTATGCAGCATTTGATCGGCATGAACATGGTAAACAGCTGGCAGCCATGCA
TGCTCTTGGTAACATCTTCGGGGAAAGTCGATCAGAGAATGATATTGTGCTAAATGATAATGCAGAAGAAAATTTGCGAGATTTGATATATCAAATTGCATCCAGAAGTT
CAAAAATGACACCCTCAGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTTCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGTCTA
ATGGAAATCTGCTCGAAACAAGACATAGTAAATATAGTTGGTGATGCAAGTACTGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAACTGTTGTTTGGCTATCCATAA
GGCCTTCATGTCTTCAACTAGGCTTACTGGTGATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCGAAGGTTAGATTTAGATTCAAATACTTGTGCATACATAAGTATTCCATACTTT
TTTTTAACTTTTTCATTTTCCAGGCAGTGTATTATAAAAGTGCAAAGGCTCCCATCTTTCAGTCGTATCTGATTGTTTTGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GAAGAATCGAAACCGACTGAAAGATATTCTCACAGCGCCACTCTCCGATTCTTTTCTCATTTTCACTCTCATACGAAGATTCCTTGAGCGAAGAAATGGAGGAATTTTCT
GTAAATGATCCGACTCAGCTACTCCAAGCAGCTGCAAACTTCGCAAATTATCCTGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCGCTTCCCCCTTCCCGC
CATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAATTTCCAGGTCTAGAGGATACTCTGGTTGCATGTCTTGACAGGATATTCAAAACCAAGTATGGAGCTTCTCTTATACCGC
ACTATATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACGGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAACCTTAGCTTGTAAAACGGTCACTCGCCTTTTGCAGGAGTCCAATGAAACTGCTCTT
TCGGCTATACAACTAATTATTGACTATGGCATCTATCCACTTTTGCTCGACTGTCTTCTCAATGGTAACGAACGAGTTGCTAACTCATCGATGGATTCAATTAAGACACT
GGCTGCATTTCCACAGGGGATGGAAATCATCATCCCGTCAAATAAAACAGAAGCAACACACCTAGGGACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGGGAAGAGTTCGAGTCA
TGGCATTGGTAGTGAAGCTATTTTCAGTTTCTAGTTCTGTGGCATCGGCAATATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAATAATTCAAAGGACACA
CTTGTAACTTTAAGTGTGTTGGAACTCTTGTACGAGCTAGTGGAGATTGAACACGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGTTTTCTCCAACTACTAAGCTCTATAATCAG
CAACTCATCAGCAGAGTCTATTCTACGATCAAGAGCCATGGTCATTTGTGGAAGACTTTTGTCCAAAGAGAACATTTTCTCGCTTGTAGATGAATTGTGTGTGCGGAATT
TGATATCTGCTATAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGAGAGGATGTAAATGTATCTGAAGCTTCAATTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCAAGCACGTTGGGAGCC
ACCTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACCTGTGTGAAGCATGTAATTTATGCAGCATTTGATCGGCATGAACATGGTAAACAGCTGGCAGCCATGCATGCTCTTGGTAACAT
CTTCGGGGAAAGTCGATCAGAGAATGATATTGTGCTAAATGATAATGCAGAAGAAAATTTGCGAGATTTGATATATCAAATTGCATCCAGAAGTTCAAAAATGACACCCT
CAGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTTCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGTCTAATGGAAATCTGCTCG
AAACAAGACATAGTAAATATAGTTGGTGATGCAAGTACTGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAACTGTTGTTTGGCTATCCATAAGGCCTTCATGTCTTC
AACTAGGCTTACTGGTGATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCGAAGGTTAGATTTAGATTCAAATACTTGTGCATACATAAGTATTCCATACTTTTTTTTAACTTTTTCA
TTTTCCAGGCAGTGTATTATAAAAGTGCAAAGGCTCCCATCTTTCAGTCGTATCTGATTGTTTTGTGAGAAAGAAAGGTCTAATTGATATATTCATGTGCCTATGCAATA
ATGCCTTAAAATGGGAAGGGAGGCGGAAAAAAGAGAAAAAAGGTCATCCGGAAGTGATTTTAGTAGCAACTTTAGCTAAAATGATAGGTTTTATGACGTGATATTCATAT
AATCCGTTTAATGTTTGGTTCTATAATTTTAAAGTTATGTTGTGGAGTGTTTGTATATCCATTTCAAAATCACTTCCCAGGAAAGGGAAGGGAAGTATTGTGTTTGTGGA
TTTGAACTTTTGGGGTGGTTATGGTCAGGCTAATGCTTTAAATGGTTTGTCTGCAGCTGCAGGAAGCGGTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAAGGAATGTTGAAACT
CAACCAGCAATAATGACAGCTGAAAGATTTTGAAGAGTAAACCATGGTTCAAAAGTAGGCAAGCCTTATATACAAATGGTTTGTTTGATGTAATATTTCTCAACTAGCTG
CAATGACATCAGACTTTTCTTTCACGCTAGCAGTTGAAAATAGATTTTTCTAGTCTCTTCCATGGATTGTGTACTAATATTTCTCTACTCTCTTTGGATAAAAGGTTCGT
GAATGTGAATGGATTGATGTATTTATTAATTTCTTTTTTATCA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEEFSVNDPTQLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRTLACKTVTRLLQES
NETALSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNERVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAIYNANLLSLLESEIN
NSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDELCVRNLISAIDGILGSSEGEDVNVSEASIEALGQIGS
STLGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL
MEICSKQDIVNIVGDASTETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKVRFRFKYLCIHKYSILFFNFFIFQAVYYKSAKAPIFQSYLIVL

PI0011419 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome