CuGenDBv2

Gene ID	PI0011835
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase
Genome location	chr02:3715435..3717702
RNA-Seq Expression	PI0011835
Synteny	PI0011835
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0042229.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold824G00020 [Cucumis melo var. makuwa]

1.9e-141

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TYK14259.1 uncharacterized protein E5676_scaffold1121G00510 [Cucumis melo var. makuwa]

1.7e-134

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XP_004149017.1 uncharacterized protein LOC101215704 [Cucumis sativus]

4.6e-140

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XP_008451102.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492482 [Cucumis melo]

9.2e-141

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XP_038878616.1 uncharacterized protein LOC120070805 [Benincasa hispida]

2.0e-135

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LX12 Uncharacterized protein

2.2e-140

97.29

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A0A1S3BQQ9 uncharacterized protein LOC103492482

4.5e-141

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A0A5A7TLK8 Uncharacterized protein

9.0e-142

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A0A5D3CVI9 Uncharacterized protein

8.2e-135

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A0A6J1DW78 uncharacterized protein LOC111024066

6.9e-118

85.71

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Query:  SPSQSSTFPFHFHSLNSINLLLPKTLFPGFPSHPKNALKTFLHFHKTRSKKSLSNTFNSPSSTHASLIEAPILWAGRLCIFYALLRAGLAGSQSNPLVSD
        SP Q + FPFHFHSL+SIN LLP+TLFP F + P N LK FLHFH+T SKKS  +TF S ++T ASLIEAPILWAGR+CIFYALLRAG AGSQSNPLVSD
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Query:  LDLSYGGSSDGESSSDLGFSKWLESVRGKPVDEAVDKRKLVSKWHPTTKGTLRRNYRVPSKSEGRRLLKAIASLLSDDDHFVDATSHKGCQIRRESAHGE
        LD+SYGG + GES SDLGFSKWLESVRGKPVDEA DKRKLVSKWHPTTKGTLRRNYRVPSKSEGRRLLKAIASLLSDDDHF+DATSHKGCQIRRESAHGE
Subjt:  LDLSYGGSSDGESSSDLGFSKWLESVRGKPVDEAVDKRKLVSKWHPTTKGTLRRNYRVPSKSEGRRLLKAIASLLSDDDHFVDATSHKGCQIRRESAHGE

Query:  SVCCNNVRALFDELPTPHLIVEITPFPAGPLNENDYTKAEKLERVLRSGPSI
        SVCCNNVRALFDELPTPHLIVEITPFPAGPLN+ DYTKAEKLERVLRSGPS+
Subjt:  SVCCNNVRALFDELPTPHLIVEITPFPAGPLNENDYTKAEKLERVLRSGPSI

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G32930.1 unknown protein

1.2e-85

67.74

Show/hide

Query:  STFPFHFHSLNSINLLLPKTLFPGFPSHPKNALKTFLHFHKTRSKKSLSNTFNSPSSTHASLIEAPILWAGRLCIFYALLRAGLAGSQSNPLVSDLDLSY
        ST P   +S N   LLL K++FPG         K  LH    R  K +SN      ST ASL+E PILWAGR+C+FYAL++AG AGS+SNP+VS LD   
Subjt:  STFPFHFHSLNSINLLLPKTLFPGFPSHPKNALKTFLHFHKTRSKKSLSNTFNSPSSTHASLIEAPILWAGRLCIFYALLRAGLAGSQSNPLVSDLDLSY

Query:  GGSSDGESSSDLGFSKWLESVRG-KPVDEAVDKRKLVSKWHPTTKGTLRRNYRVPSKSEGRRLLKAIASLLSDDDHFVDATSHKGCQIRRESAHGESVCC
        G   + +  +DLGFSKWL++++G KP  +A DKRKLVSKWHPTTKGTLRRNYR+PSK+EG RLLKAIASLLSDDDHF DATSHKGCQIRRESAHG+SVCC
Subjt:  GGSSDGESSSDLGFSKWLESVRG-KPVDEAVDKRKLVSKWHPTTKGTLRRNYRVPSKSEGRRLLKAIASLLSDDDHFVDATSHKGCQIRRESAHGESVCC

Query:  NNVRALFDELPTPHLIVEITPFPAGPLNENDYTKAEKLERVLRSGPSI
        NNVRALFDELPTPHL+VEITPFPAGPL ENDY KAEKLER+LRSG +I
Subjt:  NNVRALFDELPTPHLIVEITPFPAGPLNENDYTKAEKLERVLRSGPSI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTTCACTCTCTCATTTCCCCTTCCCAATCCTCTACTTTCCCCTTCCATTTTCACTCTCTCAATTCCATTAACCTTCTTCTCCCCAAAACCCTTTTCCCTGGTTTTCC
ATCCCACCCCAAAAATGCCCTCAAAACCTTCCTCCATTTCCACAAAACAAGATCCAAAAAATCCCTCTCCAACACCTTCAATTCTCCTTCCTCCACTCACGCTTCTCTCA
TCGAAGCTCCTATTTTGTGGGCTGGTAGACTTTGCATCTTCTATGCCCTTCTAAGAGCTGGTCTTGCTGGATCTCAATCCAACCCACTTGTCTCTGATTTGGACTTATCC
TATGGTGGTAGTTCTGATGGAGAAAGCAGCAGTGATTTGGGGTTTTCTAAATGGTTGGAGAGTGTAAGAGGAAAGCCAGTGGATGAAGCAGTTGATAAAAGAAAACTAGT
GAGCAAATGGCATCCTACCACAAAGGGAACCCTCAGAAGGAACTATCGAGTGCCATCTAAATCCGAAGGACGGCGTCTTCTTAAGGCCATCGCATCCCTCCTTTCTGACG
ATGATCACTTCGTTGATGCCACATCCCACAAGGGTTGTCAAATCAGGAGGGAAAGTGCTCATGGGGAGAGTGTTTGTTGCAACAATGTGAGAGCTTTGTTTGATGAGCTT
CCAACCCCACATCTTATTGTGGAAATAACTCCATTCCCTGCTGGGCCTCTCAATGAAAATGATTACACAAAAGCTGAGAAACTAGAGAGAGTGCTCAGATCTGGTCCCTC
TATTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTTAACAGTCACCTTGTCTCCCTCGCTATGCACTGCCACTGCGTGGATTAGAGCATTTCCTCAGTCTACAACTCAACAATGCTTCACTCTCTCATTTCCCCTTCCCAATC
CTCTACTTTCCCCTTCCATTTTCACTCTCTCAATTCCATTAACCTTCTTCTCCCCAAAACCCTTTTCCCTGGTTTTCCATCCCACCCCAAAAATGCCCTCAAAACCTTCC
TCCATTTCCACAAAACAAGATCCAAAAAATCCCTCTCCAACACCTTCAATTCTCCTTCCTCCACTCACGCTTCTCTCATCGAAGCTCCTATTTTGTGGGCTGGTAGACTT
TGCATCTTCTATGCCCTTCTAAGAGCTGGTCTTGCTGGATCTCAATCCAACCCACTTGTCTCTGATTTGGACTTATCCTATGGTGGTAGTTCTGATGGAGAAAGCAGCAG
TGATTTGGGGTTTTCTAAATGGTTGGAGAGTGTAAGAGGAAAGCCAGTGGATGAAGCAGTTGATAAAAGAAAACTAGTGAGCAAATGGCATCCTACCACAAAGGGAACCC
TCAGAAGGAACTATCGAGTGCCATCTAAATCCGAAGGACGGCGTCTTCTTAAGGCCATCGCATCCCTCCTTTCTGACGATGATCACTTCGTTGATGCCACATCCCACAAG
GGTTGTCAAATCAGGAGGGAAAGTGCTCATGGGGAGAGTGTTTGTTGCAACAATGTGAGAGCTTTGTTTGATGAGCTTCCAACCCCACATCTTATTGTGGAAATAACTCC
ATTCCCTGCTGGGCCTCTCAATGAAAATGATTACACAAAAGCTGAGAAACTAGAGAGAGTGCTCAGATCTGGTCCCTCTATTTGAGATATTTCTTAATCTCTTTGCATTA
TTGTATCTCAACTTCTTTGTACAGTGGTTGAAAGTTGAAACTAATCCATCTCTAATCTTGATAGGGACGTTGCTTTTAGAAAAAATGTCTCAGTATGATCGTTTTATTCG
TCCCAAGGTTAAAATATCGATGTCGATGAAGATATCGAGGTTTCAATTTTATGGAAATCGTTATAATTAGTCAATTTTCAGATTTAGATGGACTTAGACTATTACTAACA
GTTTTTTAATCATCATTTCTATAAAGTAAACCATTTAGCCCCTGTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLHSLISPSQSSTFPFHFHSLNSINLLLPKTLFPGFPSHPKNALKTFLHFHKTRSKKSLSNTFNSPSSTHASLIEAPILWAGRLCIFYALLRAGLAGSQSNPLVSDLDLS
YGGSSDGESSSDLGFSKWLESVRGKPVDEAVDKRKLVSKWHPTTKGTLRRNYRVPSKSEGRRLLKAIASLLSDDDHFVDATSHKGCQIRRESAHGESVCCNNVRALFDEL
PTPHLIVEITPFPAGPLNENDYTKAEKLERVLRSGPSI

PI0011835 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome