; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0011903 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0011903
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionarabinogalactan peptide 23-like
Genome locationchr01:26285505..26286020
RNA-Seq ExpressionPI0011903
SyntenyPI0011903
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044702 - Arabinogalactan protein 23/40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN45143.1 hypothetical protein Csa_016530 [Cucumis sativus]1.1e-1285.94Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESL----SPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADESL    SPAAAPGPSSAASA LPVLGAS+VSF+ AYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESL----SPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
XP_008461276.1 PREDICTED: arabinogalactan peptide 23-like [Cucumis melo]2.6e-1491.67Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADES+SPAAAPGPSSAASA LPVLGAS+VSF+ AYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
XP_022933008.1 arabinogalactan peptide 23-like [Cucurbita moschata]4.6e-1177.78Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DESLSPAAAPGPSSAASATLP L    GAS+VS +AY+ N
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
XP_023004714.1 arabinogalactan peptide 23-like [Cucurbita maxima]3.5e-1177.78Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DESLSPAAAPGPSSAASA LP L    GAS+VSF+AY+ N
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
XP_038899473.1 arabinogalactan protein 23-like [Benincasa hispida]6.4e-1384.13Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVS+AVAADESLSPAAAPGPSSAASA LP L    GAS+V+F+AYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L5 Uncharacterized protein5.3e-1385.94Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESL----SPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADESL    SPAAAPGPSSAASA LPVLGAS+VSF+ AYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESL----SPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
A0A1S3CDX5 arabinogalactan peptide 23-like1.3e-1491.67Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADES+SPAAAPGPSSAASA LPVLGAS+VSF+ AYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFL-AYFLN
A0A6J1F3F5 arabinogalactan peptide 23-like2.2e-1177.78Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DESLSPAAAPGPSSAASATLP L    GAS+VS +AY+ N
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
A0A6J1H8I1 arabinogalactan peptide 23-like1.1e-1074.6Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DESLSPAAAPGPSSAASA LP L    GAS+VSF+A++ N
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
A0A6J1KX42 arabinogalactan peptide 23-like1.7e-1177.78Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DESLSPAAAPGPSSAASA LP L    GAS+VSF+AY+ N
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8S2W4 Arabinogalactan protein 239.3e-0758.73Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P  APGP+SAASA LP L    GAS+VS  +Y+L+
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41905.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: arabinogalactan protein 23 (TAIR:AT3G57690.1)8.9e-0553.12Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGP-SSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIAC  +FAAA+++A +AA+     A APGP +S AS  +P L    GAS+VS  AY+LN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGP-SSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
AT3G57690.1 arabinogalactan protein 236.6e-0858.73Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P  APGP+SAASA LP L    GAS+VS  +Y+L+
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVL----GASIVSFLAYFLN

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATGAAGAAGATCGCTTGCGCCGCTCTTTTCGCCGCCGCTGCCGTCAGCGCTGCTGTGGCTGCCGATGAGTCTCTCTCTCCCGCCGCTGCGCCGGGGCCGAGCAG
CGCCGCCTCCGCCACTCTCCCCGTTCTCGGTGCCTCAATTGTTTCCTTTCTTGCTTACTTCTTGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGCAATCCATCAATCAAAGGCTTCTTCGGTTCGATCGCTCTCATCTCAACCGGAAGTGAGTTTTCTGCCGAAGAAAGCCAATTCCTTCAATCTCATCCATCCTCCATGG
AAATGAAGAAGATCGCTTGCGCCGCTCTTTTCGCCGCCGCTGCCGTCAGCGCTGCTGTGGCTGCCGATGAGTCTCTCTCTCCCGCCGCTGCGCCGGGGCCGAGCAGCGCC
GCCTCCGCCACTCTCCCCGTTCTCGGTGCCTCAATTGTTTCCTTTCTTGCTTACTTCTTGAACTGAAGCCCCGTTGGCGTTGGAGAGGGAGATTCAATTTTATGCTTTAT
GTTCTTTTTTTTAATGTGTTTATTTCCATGGATGATGTTATGTGACGTCATAGATTAATTAAAAACAATAATAATAAAAAAGAATCCGGATTCGTTATATTATATATTTT
ACAATTTCTCTCATTCTATATCTATGTTTATTGTTCTCTGCTTTTTTTTTCTTCTATATATATACAATGTTCGGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESLSPAAAPGPSSAASATLPVLGASIVSFLAYFLN