CuGenDBv2

Gene ID	PI0012287
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic
Genome location	tig00000566:12036..14117
RNA-Seq Expression	PI0012287
Synteny	PI0012287
Gene Ontology terms	GO:0019684 - photosynthesis, light reaction (biological process) GO:0005886 - plasma membrane (cellular component) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016655 - oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, quinone or similar compound as acceptor (molecular function) GO:0048038 - quinone binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001694 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H IPR018086 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

ASY96384.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Cucumis melo subsp. agrestis]

1.9e-139

86.83

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISL-----------LEAQ
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISL           +EAQ
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISL-----------LEAQ

Query:  SKYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVY
        SKYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVY
Subjt:  SKYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVY

Query:  EVFGMTISIFITLAKTYLF
        EVFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  EVFGMTISIFITLAKTYLF

QCY72897.1 NdhA [Cucumis hystrix]

3.0e-140

87.74

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

YP_004841840.1 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 1 [Cucumis melo subsp. melo]

6.6e-140

87.42

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

YP_009004096.1 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 1 [Cucumis hystrix]

1.1e-139

87.42

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDI+SFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

YP_009752545.1 NADH dehydrogenase subunit A [Trichosanthes tubiflora]

2.5e-139

87.11

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYI GYELFEINK YE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S4EU64 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

3.2e-140

87.42

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

A0A218KGA1 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

5.5e-140

87.42

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDI+SFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

A0A4Y5RD72 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

1.4e-140

87.74

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

A0A6M8Y6K2 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

3.2e-140

87.42

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

G3ETV4 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

3.2e-140

87.42

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A0A390 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

3.5e-128

78.3

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDT+++Q INSF +LE LKE YGI+W+L+PI T VLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLG+LQALADGTKLLFKENLLPSRGD RLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I           +I VFLWIAISS+APIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGF+IFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGW++SIPYI   E+F+INK  +
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFG  I IFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

Q09WW3 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

1.8e-127

77.36

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MI  T +VQDINSFSR EFLKE YGI+W  +PI T VLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADG KLLFKENL PSRG+TRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISIL+SYS++           +I VFLWIAISS+APIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGF+IFLISSLAECERLPFDLPEAEEEL+AGYQTEYSGIKF            VSSLFVT+LYLGGW+ISIPYI  ++ FEINK Y 
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VF  TI +FITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

Q0ZIW3 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

6.9e-132

80.5

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDT +VQDINSFSRLE+LKE YGI+W+LVPI T VLGITIGVL IVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLG+LQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSY +I           +I VFLWIAISS+APIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGF++FLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWD+SIPYI   E FEINK  E
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFG TI IFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

Q1KXQ8 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

4.6e-128

79.25

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDT++VQ INSFSRLE LKE YGI+WVL+PI T VLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLG+LQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSY +I           SI VFLWIAISS+AP+GLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGF++FLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGW++SIPYI   ELF+I K   
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFG  I IFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

Q2QD36 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

1.5e-142

87.42

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MIIDTSQVQDI+SFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I            I VFLWIAISSVAPIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF            VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        VFGMTISIFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G07785.1 NADH dehydrogenase family protein

3.0e-05

32.32

Show/hide

Query:  AGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSN
        A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF + P    +  L++ +++           +I +    AISS+   G+++ +G  SN
Subjt:  AGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSN

ATCG01100.1 NADH dehydrogenase family protein

2.5e-121

74.84

Show/hide

Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI
        MII  + VQ INSF +LE LKE YG++W+ VPI + VLGI  GVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLG+LQALADGTKLLFKENL PSRG+T LFSI
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSI

Query:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS
        GPSIAVISILLSYS+I           +I +FLWIAISS+APIGLLM SGYGSN KYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVL+ISLL          EAQS
Subjt:  GPSIAVISILLSYSLI-----------SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL----------EAQS

Query:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE
        KYGFWGWNLWRQPIGF+IFLISSLAECERLPFDLPEAEEEL+AGYQTEYSGIKF            +SSLFVTVLYLGGW+ISIPYI   ELF+ +   +
Subjt:  KYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKF------------VSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYE

Query:  VFGMTISIFITLAKTYLF
        +FG TI IFITLAKTYLF
Subjt:  VFGMTISIFITLAKTYLF

ATMG00516.1 NADH dehydrogenase 1C

6.6e-29

34.27

Show/hide

Query:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI---------
        ++ VP  IL  +L + +GV  +V  ER++ A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF + P    +  L++ +++         
Subjt:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI---------

Query:  --SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECE
          +I +    AISS+   G+++ +G  SN KY+FLG LR+AAQ +SYE+ + L ++ + +       S+       +W      P+  V+FLIS LAE  
Subjt:  --SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECE

Query:  RLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFVSSLF--------------VTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITL
        R PFDLPEAE E VAGY  EYS +   S+LF               T+ + GGW    P IL   +F+       F + + +F+ L
Subjt:  RLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFVSSLF--------------VTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITL

ATMG01120.1 NADH dehydrogenase 1B

6.6e-29

34.27

Show/hide

Query:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI---------
        ++ VP  IL  +L + +GV  +V  ER++ A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF + P    +  L++ +++         
Subjt:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI---------

Query:  --SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECE
          +I +    AISS+   G+++ +G  SN KY+FLG LR+AAQ +SYE+ + L ++ + +       S+       +W      P+  V+FLIS LAE  
Subjt:  --SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECE

Query:  RLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFVSSLF--------------VTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITL
        R PFDLPEAE E VAGY  EYS +   S+LF               T+ + GGW    P IL   +F+       F + + +F+ L
Subjt:  RLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFVSSLF--------------VTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITL

ATMG01275.1 NADH dehydrogenase 1A

6.6e-29

34.27

Show/hide

Query:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI---------
        ++ VP  IL  +L + +GV  +V  ER++ A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF + P    +  L++ +++         
Subjt:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISILLSYSLI---------

Query:  --SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECE
          +I +    AISS+   G+++ +G  SN KY+FLG LR+AAQ +SYE+ + L ++ + +       S+       +W      P+  V+FLIS LAE  
Subjt:  --SISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECE

Query:  RLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFVSSLF--------------VTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITL
        R PFDLPEAE E VAGY  EYS +   S+LF               T+ + GGW    P IL   +F+       F + + +F+ L
Subjt:  RLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFVSSLF--------------VTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITL

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATAATTGATACATCACAAGTCCAAGATATCAATTCTTTTTCGAGATTGGAATTCTTAAAAGAATTCTATGGAATTCTATGGGTACTTGTCCCTATTTTGACTACTGT
ATTGGGAATCACAATAGGCGTACTAGTAATTGTATGGTTAGAAAGAGAAATATCCGCAGGGATACAACAACGGATTGGACCTGAATATGCTGGTCCTTTGGGAGTTCTTC
AAGCTTTAGCAGATGGTACAAAACTACTTTTTAAAGAAAATCTGCTTCCATCTAGAGGTGATACTCGTTTATTCAGTATCGGACCATCCATAGCAGTCATATCAATTTTA
CTAAGCTATTCACTGATCTCCATATCGGTTTTTTTATGGATTGCCATTTCAAGTGTTGCTCCCATCGGACTTCTTATGTCGTCAGGATATGGATCCAATAAGAAATATTC
CTTCTTAGGTGGTCTACGAGCTGCTGCTCAATCAATTAGTTATGAAATACCATTAACTCTATGTGTATTAGCAATATCTCTACTTGAGGCTCAATCAAAATATGGTTTTT
GGGGGTGGAATTTGTGGCGTCAACCTATAGGGTTTGTTATTTTTCTAATTTCTTCCTTAGCAGAATGCGAGAGATTACCTTTCGATTTACCAGAAGCAGAAGAAGAATTA
GTAGCAGGTTATCAAACAGAGTATTCGGGTATAAAATTTGTTTCTTCGTTATTTGTAACTGTTCTTTACTTGGGTGGTTGGGATATCTCTATTCCATACATATTAGGTTA
TGAACTTTTTGAAATAAATAAAGTGTATGAAGTTTTTGGAATGACAATTAGTATCTTTATTACATTAGCGAAAACTTATTTGTTCTTCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSIGPSIAVISIL
LSYSLISISVFLWIAISSVAPIGLLMSSGYGSNKKYSFLGGLRAAAQSISYEIPLTLCVLAISLLEAQSKYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEEL
VAGYQTEYSGIKFVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFF

PI0012287 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome