; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0012399 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0012399
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRibonuclease Z
Genome locationchr05:20816210..20822520
RNA-Seq ExpressionPI0012399
SyntenyPI0012399
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001279 - Metallo-beta-lactamase
IPR036866 - Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like


Homology Show/hide homology
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A0A0A0KHX0 Lactamase_B domain-containing protein4.8e-17697.49Show/hide
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A0A1S3BN27 ribonuclease Z, chloroplastic6.0e-17998.12Show/hide
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A0A5A7V7F0 Ribonuclease Z5.6e-17796.31Show/hide
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A0A5D3DC50 Ribonuclease Z1.8e-17597.18Show/hide
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A0A6J1ERP8 tRNase Z TRZ2, chloroplastic3.0e-17094.04Show/hide
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B1YLU8 Ribonuclease Z2.1e-1128.97Show/hide
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P60193 Nuclear ribonuclease Z (Fragment)3.2e-6063.31Show/hide
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          LV LD+GE YE+R +L  RAFKT H IPSQGYVIYSV++KLK+ Y+ L G +I++LK SGVEIT+T+
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Q58897 Ribonuclease Z2.5e-1229.87Show/hide
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        N +FITH H DHI G+P  + S G +       +F P   KE +E  L++     +  + V  +      T     N    A+ T+H IPS  Y+   ++
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        K      K KK  + + G  ++KLK       I   I+ PE           +A++GDT    DF    +    L   +LI EATF D A   + A+++ 
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        H+ I + +  A+    KA++LTH S+RY  E
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Q8L633 tRNase Z TRZ2, chloroplastic1.4e-12770.55Show/hide
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        MQ+S    P+ PP++FP    H+P + T +       +  + V+  + SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y+IEGISVGG ETCVI+PE
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         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +F+P  IKEDVEKLLEIHRTMGQVEL+V+L+ L VGETYE+RN++V R F 
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Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIE
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E
Subjt:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIE

Q8LGU7 tRNase Z TRZ11.3e-9060.87Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV
        +K + +EGY IEG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ +PA IKE VE L E+HR +   
Subjt:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV

Query:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFKTQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAK
        EL  +LV LD+GE + +R +L  +AFKT HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTTSDF++D  NADAL+AK
Subjt:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFKTQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAK

Query:  ILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIE
        +L+ E+TFLD++VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY ++
Subjt:  ILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74700.1 tRNAse Z19.4e-9260.87Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV
        +K + +EGY IEG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ +PA IKE VE L E+HR +   
Subjt:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV

Query:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFKTQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAK
        EL  +LV LD+GE + +R +L  +AFKT HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTTSDF++D  NADAL+AK
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Query:  ILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIE
        +L+ E+TFLD++VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY ++
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AT2G01730.1 cleavage and polyadenylation specificity factor 73 kDa subunit-II1.5e-0423.56Show/hide
Query:  VFITHAHLDHIGGLPMYV---ASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLL-------EIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFKTQHVIPSQG
        + ITH H+DH+G LP +       G   +S PT  L   + ED  +++       E+  T         ++A+D+ +T ++  +L  RA+   HV+ +  
Subjt:  VFITHAHLDHIGGLPMYV---ASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLL-------EIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFKTQHVIPSQG

Query:  YVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGD--TTSDFMLDPRNADALRAKILITEATF
         ++Y+                     K G           + +TGD   T+D  L     D L+  +LI+E+T+
Subjt:  YVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGD--TTSDFMLDPRNADALRAKILITEATF

AT2G04530.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein9.6e-12970.55Show/hide
Query:  MQISIPISPLRPPQVFP---FHQPILHTPKPQGIALQSHLNPVNSFRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPE
        MQ+S    P+ PP++FP    H+P + T +       +  + V+  + SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y+IEGISVGG ETCVI+PE
Subjt:  MQISIPISPLRPPQVFP---FHQPILHTPKPQGIALQSHLNPVNSFRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPE

Query:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFK
         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +F+P  IKEDVEKLLEIHRTMGQVEL+V+L+ L VGETYE+RN++V R F 
Subjt:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFK

Query:  TQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF
        T HVIPSQGYVIYSVRKKL+KQY HLKGKQIEK+KKSGVEITDTILSPE+AFTGDTTS++MLDPRNADALRAK+LITEATFLDE+ S EHA+  GHTHI 
Subjt:  TQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF

Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIE
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E
Subjt:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATTTCTATCCCCATTTCGCCTCTCAGACCTCCTCAAGTTTTCCCATTTCATCAACCCATTTTACACACACCCAAACCTCAGGGAATTGCTCTCCAAAGTCATCT
GAATCCTGTAAATTCCTTCAGAGATTCCGGTCTTTTATCTACAATCGGCGTCGAAGAAGAGTACCGGAGAGCACGGTCACAGGTTAATCGAAAGGGGGTCGATTTAGAAG
GGTATTCAATCGAGGGAATCTCAGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATCATTCCGGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTGGGAGGTGCCCATCTCGAGCAATTCAGCAA
AACTTTGTATTTATCACTCACGCCCACCTTGATCACATTGGTGGGCTACCAATGTATGTAGCTAGTCGTGGTTTATATAGTTTAAGTCCTCCTACAGTATTTTTGCCTGC
TTGTATTAAAGAAGATGTGGAAAAACTACTTGAGATTCACAGGACCATGGGCCAGGTGGAGTTGGACGTTGATTTGGTTGCACTAGATGTGGGAGAAACATATGAAATGC
GTAATAACCTTGTCTGCAGAGCATTTAAAACTCAGCATGTGATACCAAGCCAGGGTTATGTCATTTATTCAGTTAGAAAAAAATTGAAGAAGCAATACATGCATCTTAAG
GGGAAACAGATCGAGAAGCTAAAGAAATCTGGAGTTGAGATTACAGACACCATATTGTCTCCGGAGGTGGCCTTCACAGGTGATACAACGTCAGATTTTATGCTTGATCC
CCGTAATGCCGATGCATTGAGGGCAAAAATTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTGGATGAAGCAGTTAGCATAGAACATGCACGGCAACATGGTCACACTCACATATTTG
AGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTTACTCATTTTTCGTCTCGATACCATATAGAGGTGAAACTTATTTTAACGAAGTTCATTTTGTGC
TGCATTCTCATGAATCATGATGATAAGTCTCTAACGTGCATTAGTTCACTTCACAACTTTGGGCTTCATACTGGATTTCTTCTATGCACTCTCTATCAGGCATGCCCACG
CTCAATCTTATATGCTTGTTTGATTGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGCAGTCACATATCCACATCCTCTACTCTTGTTTTTTCCTTTCCTATCTGAGACCAATTAAACCTCCCCTAAACCCCCTTTCTTCTTCCTCCAATTCCTTTCACAATCT
TATGTAATTCCCTTCTAACCCATTACAAGATGCAAATTTCTATCCCCATTTCGCCTCTCAGACCTCCTCAAGTTTTCCCATTTCATCAACCCATTTTACACACACCCAAA
CCTCAGGGAATTGCTCTCCAAAGTCATCTGAATCCTGTAAATTCCTTCAGAGATTCCGGTCTTTTATCTACAATCGGCGTCGAAGAAGAGTACCGGAGAGCACGGTCACA
GGTTAATCGAAAGGGGGTCGATTTAGAAGGGTATTCAATCGAGGGAATCTCAGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATCATTCCGGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTG
GGAGGTGCCCATCTCGAGCAATTCAGCAAAACTTTGTATTTATCACTCACGCCCACCTTGATCACATTGGTGGGCTACCAATGTATGTAGCTAGTCGTGGTTTATATAGT
TTAAGTCCTCCTACAGTATTTTTGCCTGCTTGTATTAAAGAAGATGTGGAAAAACTACTTGAGATTCACAGGACCATGGGCCAGGTGGAGTTGGACGTTGATTTGGTTGC
ACTAGATGTGGGAGAAACATATGAAATGCGTAATAACCTTGTCTGCAGAGCATTTAAAACTCAGCATGTGATACCAAGCCAGGGTTATGTCATTTATTCAGTTAGAAAAA
AATTGAAGAAGCAATACATGCATCTTAAGGGGAAACAGATCGAGAAGCTAAAGAAATCTGGAGTTGAGATTACAGACACCATATTGTCTCCGGAGGTGGCCTTCACAGGT
GATACAACGTCAGATTTTATGCTTGATCCCCGTAATGCCGATGCATTGAGGGCAAAAATTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTGGATGAAGCAGTTAGCATAGAACATGC
ACGGCAACATGGTCACACTCACATATTTGAGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTTACTCATTTTTCGTCTCGATACCATATAGAGGTGA
AACTTATTTTAACGAAGTTCATTTTGTGCTGCATTCTCATGAATCATGATGATAAGTCTCTAACGTGCATTAGTTCACTTCACAACTTTGGGCTTCATACTGGATTTCTT
CTATGCACTCTCTATCAGGCATGCCCACGCTCAATCTTATATGCTTGTTTGATTGATTAGCTGGATAGTCAGTTTCCCCTCTCAAAACAAAACATAATTGAAATTCTACC
ATTTAAGCTTTCAAGAAGTCATAGTTGGATCCTAAAAAGAACATTCACGTACACGTAACATACGAGATGTTGACATGCCTTTTTCTAGAAAAGTAGGACACGACACCTGG
GGACACGTTGATTTTTTTTAATATATATGTGTGTGTATAGTTTAGATTTTAATACTTTTTAAAAGTAGATTTCAAGATTGTCCAACATTGCTCTTAATCTTTGAGCTGAG
TCCTAATAGTATTATTGTCATATGTCAGCAAATCACAGACGAGTAAATGTTTTTGAATTGCAGGACATCCGTAAAGCAGTATCAAAGCTGCAGTCGAACGTGACGGCGAA
AGTGGTTCCTCTCACTGAAGGATTCAAGTCAGTGTATTAGTGTAGGATATGGATCGATGGTTACGAAGTGTAATTATTTAGCATCAAAACAGAGAAATAGGAATATAGGT
AATTATTTCTCTGTAAATTTATTGTTGGTTTCTTTAGCATTAGGCCCTTAGCAACAACTTTACTTTGCCTCATTAATAGCCATAGTGACACATGTTTGAAGTTATTACGC
ATATAGAGATGGAAGCTGGAACCATAAAATTCCAAAATTCGGGTTTAAGTCATACATGTTGGTCAGTTTGGTTTCATATGAGGTCAGGTACAAGTACAAAATTTTATTTG
ACTGATTGGATCTGAATAGACCTGTCCATTTCTGTCAGTTCAGTTTTGGTCGATTTTGTTGGTTCTGATCAATCAGTTCATCAAGAGGTGGAAGCTGGAACCCAAAAAAG
TCCACAATTCGGCTCAGTTGGTTTAAGCTTATACATGATGGTTAGTTTGGTTTCATATAAGGTAAGGTACAAACTTTTACTTGACTGAAATGGGATCTGAATAGACTTTG
TCCATTTCCGTCAGTTCAGTTTTGGTTGGTTTTGTGGTTATGATCAGTTTTTTATCATGCAACAGTGATCTCGGCGTCAGTTTTTTCTTAAACAATAGGCTGAGTTTAGC
CAGAAACTGAACCAAAAGACCAACTTACAATCTTGATAGTTCATAATAGAATAGTCATGATTACTTTCTTCCCATTGACCTCTGTGTTCTGTATCTACCTGAACTTTTAC
TTTCAGCAGAATGAATTATCCAGTTAGGAGGTGAAAACCCGAGATGGGATCAAATGGAAGAAAGAGACAATTTAAGGACTAAAACAAAGACCAGACAAGGCAGCTGAAGT
TTCTGCCTTAGTAGTACACTGATGGAGTTAGCCTGGACCTCTCTTCCTTTACTTTTCCCTATAACCTTAAAGCACCTCCAAACCACAACACATGCATATTAATGTACCTA
CAAGACAACCAAGTACACACAGTCCCACTCTCTATAGTCTCCATCCTCATCTAAATTAAAATATCTTTCTTTGCTGTCGGGTCCTCGAGTGAAGGAATAAATTGCTTGGG
ACAATCGTGCATGAACCTTTCGTTTTGTTTGTTCTCGACGTGGTTTGCTATCGCTCATTATACCAGAGATGAAGGGAGGTTTCGTTTTTGGCCTTTGTAGTCTTAACATT
TAGCTAGCATACATCATTCTAGTTGAGAGACATCACTGTCACAAGAATGAGTTTACTCTCTTTGTTTTTACGAGGTTGTATTGTTTCGATCAATGCTATTTGATTTGCAC
TAATGATTTTAATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQISIPISPLRPPQVFPFHQPILHTPKPQGIALQSHLNPVNSFRDSGLLSTIGVEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQ
NFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFKTQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLK
GKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEVKLILTKFILC
CILMNHDDKSLTCISSLHNFGLHTGFLLCTLYQACPRSILYACLID