| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6583479.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.3e-90 | 89.89 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQF+TFSG+EI K+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLY DFLRKMRNPKLE LRK +L KKIIKKC+ LT+ NKS KCS CGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| XP_004148776.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X1 [Cucumis sativus] | 6.1e-97 | 97.19 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEI KLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+KDFLRKMRNPKLEALRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKST+CSRCGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| XP_008465290.2 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 [Cucumis melo] | 3.3e-98 | 97.75 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEI KLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC+TCHANFGDCPGHYGYVNL+LPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| XP_038894318.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X1 [Benincasa hispida] | 2.9e-94 | 93.82 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQ EGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSG+EI K+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC TCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRK+RNPKLE LRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| XP_038894319.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X2 [Benincasa hispida] | 2.9e-94 | 93.82 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQ EGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSG+EI K+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC TCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRK+RNPKLE LRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LSG9 DNA-directed RNA polymerase | 3.2e-107 | 97.42 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEI KLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGLDFTFYFVVYSSCSHL
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+KDFLRKMRNPKLEALRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKST+CSRCGYLNGLDFTFYFVVYSSCSHL
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGLDFTFYFVVYSSCSHL
|
|
| A0A1S3CNX9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 1.6e-98 | 97.75 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEI KLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC+TCHANFGDCPGHYGYVNL+LPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| A0A2I4DDG5 DNA-directed RNA polymerase subunit | 7.4e-72 | 71.19 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
M AQ E + FTK PYIEDVGPRKIKSM+F+TFS +EI KLAEVQVYKG YYD R PI+GGLLDPRMGPANK C CATCH +FG+CPGH+GY+ LA+PV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLN
YNVGY +TIL+ILKCICKSC+ ILLEE L K++L+KMR+PK+E L+K +L+K I+KKC+ LT+GNK+ KCSRCGY+N
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLN
|
|
| A0A6J1HLT9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 4.6e-90 | 89.33 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MN+AQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQF+TFSG+EI K+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLY DFLRKMRNPKLE LRK +L KKIIKKC+ LT+ NKS KCS CGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| A0A6J1I0L0 DNA-directed RNA polymerase subunit | 1.3e-89 | 88.76 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MN+ QVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQF+TFSG+EI K+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
+NVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLY DFLRKMRNPKLE LRK +L KKIIKKC+ LT+ NKS KCS CGYLNG
Subjt: YNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNG
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| F4JXF9 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 | 1.1e-56 | 60.95 | Show/hide |
Query: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTIL
FTK+PYIEDVGP KIKS+ F+ S E+ K AEVQV+ YD + KP + GLLDPRMGP NK C TC NF +CPGHYGY+ L LPVYNVGYF IL
Subjt: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTIL
Query: EILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
+ILKCICK CS +LL+EKLY+D LRKMRNP++E L+K +L K ++KKCST+ + + C +CGYLNG+
Subjt: EILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
|
|
| O94666 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc1 | 3.7e-28 | 40.24 | Show/hide |
Query: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQV-YKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKC
I+D P++IK +QF E K V+V + LY T R P + G LD MG +NK CATC + DC GH+GYV LALPV+++GYF L IL+
Subjt: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQV-YKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKC
Query: ICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
ICK CS +LL ++ + FL+ +R P ++ LR+ + K+I C K +CS+C + G+
Subjt: ICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
|
|
| P04051 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 1.0e-30 | 40.62 | Show/hide |
Query: PRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYD--TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCICKS
P++IK ++F+ S A+I +EV+V +D R P G LDP+MG ++ +CATCH N C GH+G++ LALPV+++GYF ++IL+ ICK+
Subjt: PRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYD--TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCICKS
Query: CSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
CS ILL E + FL ++R P ++ LR+ ++KKI+ +C K +C CG LNG+
Subjt: CSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
|
|
| Q6BI69 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 3.8e-33 | 39.39 | Show/hide |
Query: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTT--RKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILK
+ DV P+ IK ++F S +I +EV+V+ YD R P DGG LD +MG ++ +CATCH N C GH+G++ LALPV++VGYF +++L+
Subjt: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTT--RKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILK
Query: CICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
CICK+CS +LL+E+ + FL +R P ++ LR+ ++KK++++C K +C C ++NG+
Subjt: CICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
|
|
| Q86AQ5 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc1 | 1.8e-30 | 41.72 | Show/hide |
Query: EDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYD-TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCI
ED P+KI +QF S +I +L+ VQ+ +D RKP G+LD ++G ++K C TC + DC GH+GY+ L LPV+++GY I+ IL+ I
Subjt: EDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYD-TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCI
Query: CKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
CKSCS ILL E+ + +LRKMRN K++ L++ L+KKI +C K+ +C +CG NG+
Subjt: CKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G40030.1 nuclear RNA polymerase D1B | 1.7e-04 | 34.69 | Show/hide |
Query: KCATCHANFGD-CPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCICKSCSRI
KC +C A D C GH+GY+ L +P+Y+ + + ++L +C C +I
Subjt: KCATCHANFGD-CPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCICKSCSRI
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 1.4e-22 | 38.73 | Show/hide |
Query: KIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTR--KPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCICKSCS
K++ +QF S EI +++ + V + +TT KP GGL D R+G ++ KC TC AN +CPGH+GY+ LA P+Y+VG+ T+L I++C+C +CS
Subjt: KIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTR--KPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTILEILKCICKSCS
Query: RILLEEKLYK-DFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLT
+IL +E+ +K K++NPK + +KKI+ C T
Subjt: RILLEEKLYK-DFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLT
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 7.8e-58 | 60.95 | Show/hide |
Query: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTIL
FTK+PYIEDVGP KIKS+ F+ S E+ K AEVQV+ YD + KP + GLLDPRMGP NK C TC NF +CPGHYGY+ L LPVYNVGYF IL
Subjt: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTIL
Query: EILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
+ILKCICK CS +LL+EKLY+D LRKMRNP++E L+K +L K ++KKCST+ + + C +CGYLNG+
Subjt: EILKCICKSCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 2.1e-55 | 57.54 | Show/hide |
Query: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTIL
FTK+PYIEDVGP KIKS+ F+ S E+ K AEVQV+ YD + KP + GLLDPRMGP NK C TC NF +CPGHYGY+ L LPVYNVGYF IL
Subjt: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEIGKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVYNVGYFTTIL
Query: EILKCICK----------SCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
+ILKCICK CS +LL+EKLY+D LRKMRNP++E L+K +L K ++KKCST+ + + C +CGYLNG+
Subjt: EILKCICK----------SCSRILLEEKLYKDFLRKMRNPKLEALRKCDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTKCSRCGYLNGL
|
|
