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PI0012663 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0012663
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein RALF-like 7
Genome locationchr04:3024411..3024872
RNA-Seq ExpressionPI0012663
SyntenyPI0012663
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058710.1 protein RALF-like 7 [Cucumis melo var. makuwa]9.6e-1365.62Show/hide
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        + ILI M+MVCSLM++P NAN ++SYGAIG D    C DG+CKTL D ANGYNRGCE EN C+S
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KAE8648219.1 hypothetical protein Csa_018424, partial [Cucumis sativus]1.3e-0955.74Show/hide
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KAE8648222.1 hypothetical protein Csa_023891, partial [Cucumis sativus]1.3e-0955.74Show/hide
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        +++ M+MVCSLM NP NA ++ YGAIG      C+DG C+ LGD AN Y RGCE E HC+S
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KAG6603811.1 hypothetical protein SDJN03_04420, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-1055Show/hide
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        I I+MM+V S ++ P  A ++ YGA+GADAG  C DG C+TLGD AN YNRGCE +  C+
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KGN49664.1 hypothetical protein Csa_018501 [Cucumis sativus]1.3e-0955.74Show/hide
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        +++ M+MVCSLM NP NA ++ YGAIG      C+DG C+ LGD AN Y RGCE E HC+S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJT5 Uncharacterized protein1.2e-0851.56Show/hide
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        ++I M+M CSL+ NP NA ++ YG IG      C+DG C+ LGD AN Y RGCE E HC+S  S
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A0A0A0KLD0 Uncharacterized protein6.3e-1055.74Show/hide
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        +++ M+MVCSLM NP NA ++ YGAIG      C+DG C+ LGD AN Y RGCE E HC+S
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A0A5A7UUI8 Protein RALF-like 74.6e-1365.62Show/hide
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        + ILI M+MVCSLM++P NAN ++SYGAIG D    C DG+CKTL D ANGYNRGCE EN C+S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAATTTTGATAGTTATGATGATGGTTTGTTCATTAATGTTAAACCCAAGAAACGCAAACGCTATTAGCTATGGTGCCATCGGTGCAGATGCAGGCACAATATGCAG
AGATGGTAATTGCAAAACATTAGGAGATGCAGCCAATGGTTATAACAGAGGATGTGAAACTGAAAACCATTGTAAATCGGATGGTTCACACCCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATTTGAATGAGTCAAAGGTCAATACCAAAATAAATAAAATTACAGTCAACACCAACAAAACAATGACAATTTTGATAGTTATGATGATGGTTTGTTCATTAATGTTA
AACCCAAGAAACGCAAACGCTATTAGCTATGGTGCCATCGGTGCAGATGCAGGCACAATATGCAGAGATGGTAATTGCAAAACATTAGGAGATGCAGCCAATGGTTATAA
CAGAGGATGTGAAACTGAAAACCATTGTAAATCGGATGGTTCACACCCTTAGCTTCCACATCTCCATTTTACCATTCCATGTCCTATCTCTCCTCTAATTAGGACCATTC
CATACAAATTCAATTTAATTATTCTTTTTATCATTGATAGTTTCTTATTTATCCAACGGTGTAAAACTACTATCATTCACTCATTATTTATAATTTATTACAAAATAAAA
TAGGACCAAATTGAATTAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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