| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0042597.1 putative RNA-binding protein 18 [Cucumis melo var. makuwa] | 7.3e-77 | 81.63 | Show/hide |
Query: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
+DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKE
Subjt: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLA+EK NT NDTS+AASES KSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQDNIS KDHIDKS LKTS
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| XP_008437528.1 PREDICTED: probable RNA-binding protein 18 [Cucumis melo] | 1.2e-76 | 82.05 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLA+EK NT NDTS+AASES KSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQDNIS KDHIDKS LKTS
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| XP_011654647.1 probable RNA-binding protein 18 isoform X2 [Cucumis sativus] | 2.8e-76 | 82.05 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLA+EK TNT NDTSR ASES KSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQDNIS KDH DKSSLK S
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| XP_031741097.1 probable RNA-binding protein 18 isoform X1 [Cucumis sativus] | 7.3e-93 | 93.85 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVY LIA+VKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLA+EK TNT NDTSR ASES KSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQDNIS KDH DKSSLK S
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| XP_038875193.1 probable RNA-binding protein 18 [Benincasa hispida] | 1.3e-70 | 80.66 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSP+GKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNI
MHGKLACGRPLVVRLA+E+F TNT NDTSRAA ESSKSRLGGS+Y Q+TRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDN+
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KJM9 RRM domain-containing protein | 7.9e-77 | 81.63 | Show/hide |
Query: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
+DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKE
Subjt: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLA+EK TNT NDTSR ASES KSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQDNIS KDH DKSSLK S
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| A0A1S3ATX2 probable RNA-binding protein 18 | 6.0e-77 | 82.05 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLA+EK NT NDTS+AASES KSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQDNIS KDHIDKS LKTS
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| A0A5A7TLJ6 Putative RNA-binding protein 18 | 3.5e-77 | 81.63 | Show/hide |
Query: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
+DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKE
Subjt: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLA+EK NT NDTS+AASES KSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQDNIS KDHIDKS LKTS
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| A0A6J1DUC5 probable RNA-binding protein 18 isoform X1 | 3.0e-68 | 75.13 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
DS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEA LIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLA+EK +T SRAA ESSKSRLGGS+YGQ+TR+DKIAAIKNKLRALEG ESSS VKKQKQDNISC+D+IDK LKTS
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| A0A6J1DXL8 probable RNA-binding protein 18 isoform X2 | 2.3e-68 | 74.75 | Show/hide |
Query: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
+DS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEA LIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKE
Subjt: QDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLA+EK +T SRAA ESSKSRLGGS+YGQ+TR+DKIAAIKNKLRALEG ESSS VKKQKQDNISC+D+IDK LKTS
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDNISCKDHIDKSSLKTS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q3ZCC5 Probable RNA-binding protein 18 | 3.6e-10 | 31.61 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGNLD +ITE L++L FG + DFL+H G G+PRG+ F+ + +K QEA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLAN---EKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
VR A+ +++ N + + E S S S L+ + KI AI+ KL+ +
Subjt: VRLAN---EKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
|
|
| Q5R6W3 Probable RNA-binding protein 18 | 5.6e-11 | 32.03 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGNLD +ITE L+KL FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K QEA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLANEKFTTNTMNDTSRAASES-SKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
VR A+ + N + S S + L+ + KI AI+ KL+ +
Subjt: VRLANEKFTTNTMNDTSRAASES-SKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
|
|
| Q6PBM8 Probable RNA-binding protein 18 | 1.3e-12 | 32.68 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGN+D +ITE L+KL FGK+ DFL+H GP G+PRG+ F+ + +KE EA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALE
VR A+ + + + AS S L+ + KI AI+ KL+ +E
Subjt: VRLANEKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALE
|
|
| Q96H35 Probable RNA-binding protein 18 | 5.6e-11 | 32.03 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGNLD +ITE L+KL FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K QEA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLANEKFTTNTMNDTSRAASES-SKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
VR A+ + N + S S + L+ + KI AI+ KL+ +
Subjt: VRLANEKFTTNTMNDTSRAASES-SKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
|
|
| Q9CR83 Probable RNA-binding protein 18 | 3.3e-11 | 32.9 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGNLD +ITE L+KL FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K QEA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLAN---EKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
VR A+ +++ N + + E S S S L+ + KI AI+ KL+ +
Subjt: VRLAN---EKFTTNTMNDTSRAASESSKSRLGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G36660.1 poly(A) binding protein 7 | 8.8e-04 | 26.85 | Show/hide |
Query: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPL
S +Y+ N+++ +TE L K FS G I S + ++G+ +GF F+ +S+ E EA A + HG++ G+PL
Subjt: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPL
Query: VVRLANEK
V +A +K
Subjt: VVRLANEK
|
|
| AT3G16380.1 poly(A) binding protein 6 | 2.1e-05 | 27.78 | Show/hide |
Query: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPL
S LY+ NL + E L ++F +G+I+S + H + G +GF F+ C + +E+K AK ++G L G+P+
Subjt: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPL
Query: VVRLANEK
VVR+A K
Subjt: VVRLANEK
|
|
| AT5G03580.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.5e-07 | 45 | Show/hide |
Query: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKII----SEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+ LYI NLD +++E L +FS FGK+I ++DF RGE RGFAFIE+ S +
Subjt: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKII----SEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.8e-04 | 32.95 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
K+++G L +TEA K F+ FG I ++ R + PRGF FI Y S+E + V Q M E KLA K
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYPLIAAVKQLLIFACKVSMQEAKLAKEK
|
|
| AT5G52545.1 unknown protein | 2.3e-12 | 54.43 | Show/hide |
Query: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTS-RAASESSKSR-LGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQK
MHG+LACGRPLVVRLA+EK ++ +D S R+ E +++R + GSS GQ++R +K+ AIKNKL+ALE E KKQK
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLANEKFTTNTMNDTS-RAASESSKSR-LGGSSYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQK
|
|
