; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0012841 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0012841
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionVARLMGL domain-containing protein
Genome locationchr12:24269991..24271580
RNA-Seq ExpressionPI0012841
SyntenyPI0012841
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR032795 - DUF3741-associated sequence motif


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031834.1 transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]4.5e-20394.53Show/hide
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A0A0A0LY94 VARLMGL domain-containing protein9.5e-19993.28Show/hide
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No hits found
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AT5G58630.1 unknown protein1.8e-1631.25Show/hide
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           + V   ++++   E     ++   KEK+KSR++    K    I  ++    +G  S           + K E EC S D+ SPVSVLD   +     
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              G   + SP N  RR+LS+E E  + N +   D + +       +   D  I+   Y+E    ICK+T  +L  S+W   K  +   E   G I 
Subjt:  ESTQLTGDTASNSPIN-PRRKLSTEHEIPQ-NPSRNDDDLIINGGKIAKTIGIDNGIQRERYEE---EICKITEMELGESNWKYSKVCEEHQEFEAGGII

Query:  EGLDSYILEGLLEEFV
        E + S IL+ LLEE +
Subjt:  EGLDSYILEGLLEEFV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTTGTTGCCTTCTCCTTCTTGTTCTTCTTCTTCTTCCTTCTCCTCTTCCACTTTTGATGCTCATGTCTGCAACCCCAGAGCTGCAGCAGCTACACCCAGCTGTCT
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TCTTGAGCTTGAAAATGAAGACTACTTCATCCTTAGCTTTGAAGAAGAAAGAAAAAGTAAAGAATTCAAACCAAAAGTAAGAAACAGTAGAGAATTCAAGCAAAGAAAGG
AAGATGAAGACAAATGTAAACACCGGGAAAGCAACAAAACAGAACATTCTTATGTGAGAAAGACAAAGAAGAAGATATTCGATCCAGAAGAAGCCAAACAGTTCGTCTTA
ATCGATTTGAAAGAAAAGAAGAAATCAAGAAAGAGAGTCTCAAGAAATAAACCCTCCTCCAGAATTTCAACGAAGGACCGCCATGGAAGAAAATCAACAAGAAAAGTAGA
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GGGATTGATAATGGGATCCAACGGGAAAGATATGAAGAAGAGATTTGTAAGATAACAGAGATGGAATTAGGAGAATCGAATTGGAAATACAGTAAAGTTTGTGAAGAACA
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AACAAGAAAAGTAGAATCAGAGTGCAGCTCCGATGAATTAAGCCCAGTTTCAGTTCTCGACAAGTGTGAATTCCTACGAGATCAAGAAGAATCAACCCAATTAACAGGAG
ATACCGCTTCGAATTCCCCCATAAACCCAAGAAGGAAATTATCAACGGAGCACGAAATTCCTCAGAACCCATCTCGAAACGACGATGATTTGATCATCAACGGAGGAAAA
ATCGCGAAGACAATAGGGATTGATAATGGGATCCAACGGGAAAGATATGAAGAAGAGATTTGTAAGATAACAGAGATGGAATTAGGAGAATCGAATTGGAAATACAGTAA
AGTTTGTGAAGAACATCAAGAATTTGAAGCTGGAGGTATAATTGAAGGTCTTGATTCGTATATTCTTGAAGGCTTGCTAGAGGAATTTGTAGAACAAATGTATGATTTGA
TCTTCATCTGAAGATCAACTACTAACATGTAAATTTCAAATTATAGTTACTAAATTCACCTGAAAGTTCAACCAAAATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IDLKEKKKSRKRVSRNKPSSRISTKDRHGRKSTRKVESECSSDELSPVSVLDKCEFLRDQEESTQLTGDTASNSPINPRRKLSTEHEIPQNPSRNDDDLIINGGKIAKTI
GIDNGIQRERYEEEICKITEMELGESNWKYSKVCEEHQEFEAGGIIEGLDSYILEGLLEEFVEQMYDLIFI