; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0012929 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0012929
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionGag/pol protein
Genome locationchr12:15158596..15158850
RNA-Seq ExpressionPI0012929
SyntenyPI0012929
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0041250.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-0671.74Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEANVATTEK+F++G SSKTKV PSQMKKKGKG  P+  + +K
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

KAA0047896.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-0957.5Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERKFSLLR----------------RKLRRKHKVNMIY
        GKEVE NVATT+K+FI GSS KTKV PSQMKKK +G LPR+VRERK   +                   LRRKHKVNM+Y
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERKFSLLR----------------RKLRRKHKVNMIY

TYK02170.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-0780.43Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEANVATT+K+FI GSS KTKV PSQMKKK +G LPR+VRERK
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

TYK16050.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-0671.74Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEANVATTEK+F++G SSKTKV PSQMKKKGKG  P+  + +K
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

TYK29862.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-0565.22Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEAN+ATTEK+ + GSSSKT+V PSQ+KKKGKG  P+  + +K
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TD75 Gag/pol protein2.4e-0671.74Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEANVATTEK+F++G SSKTKV PSQMKKKGKG  P+  + +K
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

A0A5A7U0X9 Gag/pol protein1.7e-0957.5Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERKFSLLR----------------RKLRRKHKVNMIY
        GKEVE NVATT+K+FI GSS KTKV PSQMKKK +G LPR+VRERK   +                   LRRKHKVNM+Y
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERKFSLLR----------------RKLRRKHKVNMIY

A0A5D3BST1 Gag/pol protein5.6e-0880.43Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEANVATT+K+FI GSS KTKV PSQMKKK +G LPR+VRERK
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

A0A5D3CXH7 Gag/pol protein2.4e-0671.74Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEANVATTEK+F++G SSKTKV PSQMKKKGKG  P+  + +K
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

A0A5D3E1U5 Gag/pol protein2.6e-0565.22Show/hide
Query:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK
        GKEVEAN+ATTEK+ + GSSSKT+V PSQ+KKKGKG  P+  + +K
Subjt:  GKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAAGGAAGTGGAAGCAAATGTTGCTACCACTGAGAAAAAGTTTATAAAAGGATCGTCCTCTAAAACTAAAGTTGAGCCTTCACAAATGAAAAAGAAGGGAAAGGG
GTCACTCCCAAGAATGGTAAGGGAAAGAAAGTTTTCCTTGCTGAGAAGAAAGCTGAGAAGGAAGCACAAGGTAAATATGATTTACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGAAGGAAGTGGAAGCAAATGTTGCTACCACTGAGAAAAAGTTTATAAAAGGATCGTCCTCTAAAACTAAAGTTGAGCCTTCACAAATGAAAAAGAAGGGAAAGGG
GTCACTCCCAAGAATGGTAAGGGAAAGAAAGTTTTCCTTGCTGAGAAGAAAGCTGAGAAGGAAGCACAAGGTAAATATGATTTACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGKEVEANVATTEKKFIKGSSSKTKVEPSQMKKKGKGSLPRMVRERKFSLLRRKLRRKHKVNMIY