; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0013044 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0013044
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 39-like
Genome locationchr05:1131943..1134263
RNA-Seq ExpressionPI0013044
SyntenyPI0013044
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000571 - Zinc finger, CCCH-type
IPR036855 - Zinc finger, CCCH-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599412.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-17888.18Show/hide
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KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-17888.18Show/hide
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A0A0A0LKX6 Uncharacterized protein4.1e-19896.25Show/hide
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A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.2e-20097.69Show/hide
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A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.2e-20097.69Show/hide
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A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like9.5e-17988.47Show/hide
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A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like7.5e-17687.03Show/hide
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Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 281.1e-1931.48Show/hide
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        GP KI+R+Y DW+DD+
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Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 311.3e-1034.19Show/hide
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         C FGDKCHFAHG+ EL
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Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 562.9e-4735.55Show/hide
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        N   ++ I  +FFKT++C KF+ G C    +CNFAHG+E++R+PPPNWQEIV   E+       +    +                         K + C
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        +KFY  E CPYGD C FLH       D+  + RES AIS+    +P + G         + A + SAS A       +PS WKT++C KWE+TG+CPFG 
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Subjt:  D

Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 122.3e-4433.33Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDASA---------CWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPFKRARNSEENPSSPISYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD++           W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +    ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDASA---------CWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPFKRARNSEENPSSPISYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDALRTNGN-----------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY
         D++ R RES AIS+G  G     G  S      S     S+S+ +   G            ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  +
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDALRTNGN-----------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY

Query:  -------IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
                G++G     +      N K L          V   A +S  T V    A      KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  -------IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 398.2e-7949.71Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPFKRARNSEENPSSPI------SYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +P   PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPFKRARNSEENPSSPI------SYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYM
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ +
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYM

Query:  EPSRATSCSASDALRTNGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-
        E +R  S      +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T     SS L 
Subjt:  EPSRATSCSASDALRTNGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-

Query:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
         EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein1.6e-4533.33Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDASA---------CWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPFKRARNSEENPSSPISYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD++           W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +    ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDASA---------CWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPFKRARNSEENPSSPISYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDALRTNGN-----------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY
         D++ R RES AIS+G  G     G  S      S     S+S+ +   G            ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  +
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDALRTNGN-----------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY

Query:  -------IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
                G++G     +      N K L          V   A +S  T V    A      KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  -------IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT1G66810.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein5.6e-0632Show/hide
Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDA-----LRTNGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ
        R++  R     +IS+ + G   +N    +S ++ S+ +S S S +     ++T G          R    KT+LC KW+ TG C +GD C FAHG  EL+
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDA-----LRTNGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ

AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein2.8e-0526.17Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G  C FAHG++++R    + +                       K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein8.0e-2131.48Show/hide
Query:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDALRTNGNVRPSFW
        K KLC KF  G  CPY    C+F H           P  +++   ++ R RES A+S+G  G                     + +  L++        W
Subjt:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSCSASDALRTNGNVRPSFW

Query:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIG------------------REGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWK
        KT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SEL  + G                  + G+V T    V P + +   SS++T         P G    +  KWK
Subjt:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIG------------------REGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWK

Query:  GPKKINRIYADWLDDL
        GP KI+R+Y DW+DD+
Subjt:  GPKKINRIYADWLDDL

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein5.8e-8049.71Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPFKRARNSEENPSSPI------SYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +P   PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPFKRARNSEENPSSPI------SYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYM
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ +
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYM

Query:  EPSRATSCSASDALRTNGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-
        E +R  S      +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T     SS L 
Subjt:  EPSRATSCSASDALRTNGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-

Query:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
         EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTCAATGATATGAGAGCCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTAATGGCGATGCGTCTGCTTGCTGGTCTCAGTTTCCTAGGAATGATCCATT
TGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTTTAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCTAGTCCCATCTCTTATTCAAATCCCCCCTTGAATTCTA
GGGGGCACCCACAAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATCTTTTTCAAGACAAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTCGAAATGGTGCTAGTTGT
AACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAA
GATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCTAAGTTTAGAGATGATT
CAGGTAGGTTTAGGGAAAGTTCAGCTATAAGTATTGGAACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTCTTCTAGTTATATGGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGT
TCTGCTTCTGATGCTCTTCGAACTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTG
CCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTCAATGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAAGCATCTT
CGAGTTTGACGACCAGTGTACTTCCATCCTCTGCCTTACCAGAGGGCCAAGCGAAGCCAAGTTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCCGAT
TGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAAGCAAAATGGAGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAAAATTCCATTGTGGCGATTCAGAAGATTCCATGGTTTTGGCCTTCCTCAATTCTCCGATTTTCATTAGGGTTTTTATTTCTCCTTGGCGGCTAGGGTTTTGATTCTT
CATTCACTTTGTTGTTTTTTCTTTTCAACCTCTTATTATAAATATATAACTATAACTCTTTCACTTTCGCCATTGTTTTGATTCCTTCTTCCATTGATCTTCATTCCGCT
GTTTTTAGATTGATATTTCAAACACCCTTTTGTTTATTTATCCAACTCAACTTTAATTTGCCTACTTTTCTTGTTCTTCATTCCGCTGTTTTTAATTTTCCTACTTTTCT
TGTTTTCTTGTTCTCTTGTTTTCTTGTTCTTCTTGCCAATTGTTGGTATAAGGGAGGATGATCACATCGATTGATTGAAATTTTTATTGGGTGGAAACATTGTTCGTTGT
TGATTCATTGTTCTGATTGATTAAAGAGAACTGGGTTTTGTTTTAGAAGATGAGTTTCAATGATATGAGAGCCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTA
ATGGCGATGCGTCTGCTTGCTGGTCTCAGTTTCCTAGGAATGATCCATTTGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTTTAAAAGAGCTAGAAATTCTGAA
GAAAACCCATCTAGTCCCATCTCTTATTCAAATCCCCCCTTGAATTCTAGGGGGCACCCACAAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATCTTTTTCAAGACAAG
GATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTCGAAATGGTGCTAGTTGTAACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTG
GTATAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAAGATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGA
GATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCTAAGTTTAGAGATGATTCAGGTAGGTTTAGGGAAAGTTCAGCTATAAGTATTGGAACTACAGGAACTCCATTGATGAA
TGGAAGTGATTCTTCTAGTTATATGGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGTTCTGCTTCTGATGCTCTTCGAACTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGT
TATGCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTGCCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCT
ACTGCTGCCCTCAATGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAAGCATCTTCGAGTTTGACGACCAGTGTACTTCCATCCTCTGCCTTACCAGAGGGCCAAGCGAAGCCAAG
TTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCCGATTGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAAGCAAAATGGAGGGTTGACCCTTTT
TTTTCAGCTGAAGTCAGTTTTTGAAGTTGGTTTGCCGAGGATTCAATTGATTAGTTACAATATGGGAGTTGGGTTGGTGGTGGTTTTTCTGAATTAGATGAAAGGAGTGT
AAAAAAGTTTTGGTGAGAATTAATTGGGAATATGGATAGAAGAAGAGAGAGTGAGAGATATACCCTATTGTTTGTTCTGTATTGTTCATTTATTTTGTTACTTCATATTT
GTTCATATCCCATAGAAAAACTAGTTTGGATTTTTAATGTAATTCAATATATTTGAGCATTTCTTTCTGACAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFNDMRASVIPPPLHSYGSNGDASACWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPFKRARNSEENPSSPISYSNPPLNSRGHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASC
NFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYMEPSRATSC
SASDALRTNGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYAD
WLDDLPLSPSSTSKMEG