; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0013543 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0013543
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr11:5179356..5180875
RNA-Seq ExpressionPI0013543
SyntenyPI0013543
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR040358 - Uncharacterized protein At4g22758-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606010.1 hypothetical protein SDJN03_03327, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-8388.77Show/hide
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XP_004145782.1 uncharacterized protein At4g22758 [Cucumis sativus]8.9e-9398.4Show/hide
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XP_008458628.1 PREDICTED: uncharacterized protein At4g22758 [Cucumis melo]1.1e-9097.34Show/hide
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XP_022958439.1 uncharacterized protein At4g22758 [Cucurbita moschata]1.3e-8388.77Show/hide
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XP_038902782.1 uncharacterized protein At4g22758 [Benincasa hispida]3.6e-8693.58Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KES9 Uncharacterized protein4.3e-9398.4Show/hide
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A0A1S3C8V7 uncharacterized protein At4g227585.2e-9197.34Show/hide
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A0A5A7SQA1 Uncharacterized protein5.2e-9197.34Show/hide
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A0A6J1H539 uncharacterized protein At4g227586.2e-8488.77Show/hide
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A0A6J1K3Z9 uncharacterized protein At4g22758-like1.4e-8388.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q56XJ7 Uncharacterized protein At4g227582.2e-0930.92Show/hide
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           V +Y KEGR P L     SAF+LH S FS++ L K E +  LGSR+F++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70780.1 unknown protein1.1e-0530Show/hide
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        K  ++L++VT+ GS GP++ +   +  VA ++   ++ Y +EGR P+L  +D + F L+      E+L+  + + +LG+RNF LC RK ++     ++  
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        S S    A+   K  S  +W
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AT2G27830.1 unknown protein2.8e-4456.52Show/hide
Query:  RSHRKGKLAEKSSSFHGE--SPTKTATTLRRPKTDPELLSFKNLGLSASAP-SLDGRPKMTKLLLNVTIQGSLGPVQVLMSPEMTVADLVSATVRQYLKE
        +SHR+ KL+EK+ SFHG   +P      LRRPKT PEL S    G S + P ++   P++TKLLLNVT+QGSLG VQ+++SPE TV+DL+ A VRQY+KE
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         RRP LP ++PS FDLHYSQFSLES+ ++EKLI+LGSRNFFLC RK +    +    SS SCSKEA++ AK  + F W KF+ F
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AT4G22758.1 unknown protein1.5e-1030.92Show/hide
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        P+   HR G+     + S   G   E  TK    L R +++     P LL+  +   S+         +  K++++V ++GS GPV+ ++     V + +
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           V +Y KEGR P L     SAF+LH S FS++ L K E +  LGSR+F++
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AT5G37730.1 unknown protein1.0e-0628.41Show/hide
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        K  KLL++V + GS+GP++ L + +  V+  ++ T++ Y ++GR P+L   D   F  +       +L+ +EK+ ++   NF +C ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCGAACCCTAGGTCTCACCGGAAGGGGAAACTTGCGGAGAAGTCGTCGTCGTTCCACGGAGAGAGTCCGACTAAGACGGCAACGACGCTCCGGAGGCCGAAGACGGA
TCCGGAATTGTTGTCCTTCAAGAATCTAGGTTTATCGGCGTCGGCGCCGTCGCTGGATGGACGACCGAAGATGACGAAATTACTCCTCAACGTGACGATTCAGGGCAGTC
TAGGTCCGGTGCAGGTGTTGATGTCGCCGGAGATGACCGTGGCTGATCTTGTATCGGCGACCGTTCGTCAATACTTGAAAGAAGGCCGCCGGCCGATTTTGCCTACTGCA
GATCCTTCCGCTTTCGATCTTCATTACTCGCAATTCAGCTTAGAAAGTTTAAACAAGGAAGAGAAGCTAATCGCCTTGGGATCTAGAAACTTCTTTCTGTGCCCTAGAAA
ATCAGACGATAACAACGATTTAATCGCTTCTTCTTCATCTTCTTCATGCTCGAAAGAAGCTAAAGAAAGCGCGAAGAGTTCCAGCAGTTTCAGTTGGTTCAAATTCATCG
ATTTTCGGATTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCAGAACGGTTCTACCTCTCGTCGTTTCTCTGCTAGACTATTCGCTGCCCTTAAACTGGGTCCCGACCGACGTCCGTCCGGCGACGGAAAATCCGAGAGTCCTAACAACT
CCGAAGCTCTCGATCTCCGCTTCCGGCGACTGAGGGGTATAACAAGAGGAGTACCATAGAGTACCTCATTTACCCTTTGATTCGTATTTAGGAACGATGCCGAACCCTAG
GTCTCACCGGAAGGGGAAACTTGCGGAGAAGTCGTCGTCGTTCCACGGAGAGAGTCCGACTAAGACGGCAACGACGCTCCGGAGGCCGAAGACGGATCCGGAATTGTTGT
CCTTCAAGAATCTAGGTTTATCGGCGTCGGCGCCGTCGCTGGATGGACGACCGAAGATGACGAAATTACTCCTCAACGTGACGATTCAGGGCAGTCTAGGTCCGGTGCAG
GTGTTGATGTCGCCGGAGATGACCGTGGCTGATCTTGTATCGGCGACCGTTCGTCAATACTTGAAAGAAGGCCGCCGGCCGATTTTGCCTACTGCAGATCCTTCCGCTTT
CGATCTTCATTACTCGCAATTCAGCTTAGAAAGTTTAAACAAGGAAGAGAAGCTAATCGCCTTGGGATCTAGAAACTTCTTTCTGTGCCCTAGAAAATCAGACGATAACA
ACGATTTAATCGCTTCTTCTTCATCTTCTTCATGCTCGAAAGAAGCTAAAGAAAGCGCGAAGAGTTCCAGCAGTTTCAGTTGGTTCAAATTCATCGATTTTCGGATTTAG
AAACCGCCATAAATCGAATCTATTCATACATACATATTCAATGCGCCACTGTGAAAAATCATTTTCAAATTTTCTAAGCCATATAAGTTTTCGAATTATCTTCAATTCCA
AGAACTTCTTAAAGCCAATTTGAAACATCAGAATTCGATCGTGCAAAGGAAAAGCGAAGATTATTTCTGGAATTCTGTTCTTCGTTTGCTTGCTCCGGATCGACACAGGG
AAAATTTTCAATATGTATATATAATATAGTTTTTGCGAGATTTCGCTTGGTTGAATAGAAATTATGTGAAATTTTTTTGTTGAATTCGTAGATCATTTTCTCATATTATG
AAATTTCCAGATTCGATGAACAGAGTCACGGCAGGAAAAATCCTGAGATTCCGTGAAGGTTAAAGAAAATTCGTGAAAATAAAGTGTGGTGGAAAGGAAACTGGCGGTTT
AGTTTTGATATGGAAAGAGATACGTTTGTGAAGAACACATTTATCGTAAAGTTCAATGTCTCTACCAACTTTTTCAGATATTGTTTTTACAATATTTAAATTTGAACAAC
CTTTTTTATTGCATACCCTAAATCTTATAACACACATCAATTTGTATTCTTATAACTTTATTCATTAAATATTTAAATTTTCAAGAATGATTCAATCTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPNPRSHRKGKLAEKSSSFHGESPTKTATTLRRPKTDPELLSFKNLGLSASAPSLDGRPKMTKLLLNVTIQGSLGPVQVLMSPEMTVADLVSATVRQYLKEGRRPILPTA
DPSAFDLHYSQFSLESLNKEEKLIALGSRNFFLCPRKSDDNNDLIASSSSSSCSKEAKESAKSSSSFSWFKFIDFRI