; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0013702 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0013702
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationchr12:12695334..12695600
RNA-Seq ExpressionPI0013702
SyntenyPI0013702
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039561.1 hypothetical protein E6C27_scaffold744G00310 [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-1456.1Show/hide
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KAA0047014.1 hypothetical protein E6C27_scaffold230G002160 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-1561.9Show/hide
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        G  R+ R+ GRQV   V   R AN+A+ S KISSNP ++  QNVEESMF+ FAQR+ DH MP   TVDKRF IERLKALGA TF
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KAA0054080.1 hypothetical protein E6C27_scaffold1371G00020 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-1361.64Show/hide
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        QV  +V +I SAN+A+  D++SSNP +   QNVEESMFN FAQRVADHL+P    V+KR +IER+KALGAT F
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KAE8648186.1 hypothetical protein Csa_018470 [Cucumis sativus]7.3e-1360Show/hide
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        G QV   VST   AN+ARESD++SSNP +   QN EES+F+ FAQR  DH +     VDKRF IERLKAL ATTF
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TYK27664.1 uncharacterized protein E5676_scaffold93G00280 [Cucumis melo var. makuwa]6.6e-1461.64Show/hide
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        QV  +V +I SAN+A+  D++SSNP +   QNVEESMFN FA+RVADHL+P    V+KR +IER+KALGATTF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TVM1 Uncharacterized protein9.9e-1661.9Show/hide
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A0A5A7UFQ1 Uncharacterized protein5.4e-1461.64Show/hide
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A0A5D3BUF6 Uncharacterized protein8.4e-1556.1Show/hide
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        PR+  ++ RQV   V    SANK +ES++IS+NP +  +QN E+SMF+ F QR+ DH MPT   VDKRF+IERL+ALGATTF
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A0A5D3DVY7 Uncharacterized protein3.2e-1461.64Show/hide
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A0A5D3DWI1 Uncharacterized protein1.0e-1260.87Show/hide
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        QV  DV T RSAN+ + S+++S NP N TEQNVEESMFN+F QRV DH MP +  V KRF IER K+ G
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAGTAATCCACGTAACGCCACTGAGCAAAACGTGGAAGAAAGTATGTTTAACTTCTTTGCTCAGAGGGTAGCAGATCACCTTATGCCTACACACCTTACGGTAGATAAGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCACTACGAGGAAGACCGAGGCAAGGCAGGCAAGTAGGCAGGCAAGTAGTAGCGGATGTCTCAACTATAAGGAGTGCTAATAAAGCGCGAGAATCAGACAAGATATC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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