; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0013754 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0013754
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSerine-rich protein-related
Genome locationchr02:20307074..20308001
RNA-Seq ExpressionPI0013754
SyntenyPI0013754
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8653030.1 hypothetical protein Csa_019924 [Cucumis sativus]2.1e-3585.42Show/hide
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XP_008443918.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487396 [Cucumis melo]4.2e-3982.73Show/hide
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XP_022921799.1 uncharacterized protein LOC111429944 [Cucurbita moschata]3.1e-3474.34Show/hide
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XP_022927032.1 uncharacterized protein LOC111433980 [Cucurbita moschata]3.1e-3474.34Show/hide
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XP_023515429.1 uncharacterized protein LOC111779591 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-3575.22Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYY6 Uncharacterized protein1.0e-4385.45Show/hide
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A0A1S3B8Q0 uncharacterized protein LOC1034873962.0e-3982.73Show/hide
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A0A5A7U6S1 Serine-rich protein-related2.0e-3982.73Show/hide
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A0A6J1E1K3 uncharacterized protein LOC1114299441.5e-3474.34Show/hide
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        CLMNNHGTGLAVS
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A0A6J1EG01 uncharacterized protein LOC1114339801.5e-3474.34Show/hide
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        CLMN HGTGLAVS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G13227.1 serine-rich protein-related5.5e-0547.17Show/hide
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        SKS S   N     CLC+PTTHPGSFRC +HR    +  +R +S  S++S++A
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related4.3e-1040Show/hide
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        SR+C+CSPTTHPGSFRCS H+N      +   S T      R S+ + S++    +E      +R  L  +I+PSS+ ++RR  + PRPSR  +M
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related8.2e-0940.2Show/hide
Query:  RKCLCSPTTHPGSFRCSFHRNRRKISSTRSSSSSI--------SVIATAELELAK---ANAL------------RAFLLQMIKPSSNDVQRRKNFHPRPS
        RKCLCSPTTHPGSFRCSFHR      S   +SS++        ++     L L K    N+L            R+    + KPSS    RR  F PR S
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Query:  RF
        RF
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related1.4e-0837.89Show/hide
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        R+C+CSPTTHPGSFRCS H+N      +   S T      R S+ + S++    +E      +R  L  +I+PSS+ ++RR  + PR SR   M+
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related1.4e-0837.89Show/hide
Query:  RKCLCSPTTHPGSFRCSFHRN------RRKISST------RSSSSSISVIATAELELAKANALRAFLLQMIKPSSNDVQRRKNFHPRPSRFCLMN
        R+C+CSPTTHPGSFRCS H+N      +   S T      R S+ + S++    +E      +R  L  +I+PSS+ ++RR  + PR SR   M+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTCAAAATCTGGATCCTTCCCGACCAACGGCGGTTCACGGAAGTGTCTTTGTTCTCCCACCACCCATCCCGGCTCTTTCCGCTGCAGTTTTCACCGGAACCGTCG
CAAGATCTCTTCCACTAGGTCTTCATCTTCATCCATTTCCGTCATTGCCACTGCGGAATTGGAGCTTGCAAAGGCTAATGCCTTGAGAGCATTTCTGCTGCAGATGATTA
AGCCGTCGAGTAACGATGTTCAACGTCGAAAGAATTTTCATCCTCGACCTTCCAGGTTTTGTTTGATGAACAATCATGGAACTGGATTGGCTGTTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAAAACACCAATCTTGTTCCACAAGTTTTCCCTAAAAATCAGTCCACAAAAAATAATCACTCCCAAATTTTCATTTCAATGGCCTCAAAATCTGGATCCTTCCCGACCA
ACGGCGGTTCACGGAAGTGTCTTTGTTCTCCCACCACCCATCCCGGCTCTTTCCGCTGCAGTTTTCACCGGAACCGTCGCAAGATCTCTTCCACTAGGTCTTCATCTTCA
TCCATTTCCGTCATTGCCACTGCGGAATTGGAGCTTGCAAAGGCTAATGCCTTGAGAGCATTTCTGCTGCAGATGATTAAGCCGTCGAGTAACGATGTTCAACGTCGAAA
GAATTTTCATCCTCGACCTTCCAGGTTTTGTTTGATGAACAATCATGGAACTGGATTGGCTGTTTCTTGAAATCGATTTTTTAGTTGGTTAACCAGTCGTACGTAGTAGA
TCTGGATGTCTGTTTTTGTTCGTGATTTCGATCTTCTTCCTTCGCTGAATTTCCAGATGAGTTTGTAGATACAGTACTCTGTTTGTGTACAGATCATTTCGAGAGGACAT
TGGATCTTGATGATTCTACAAGTCTTTCTTGAAATAGAATTAGTTTTTTTTTCTTTCCTTTGCATCTTTTCCTCTGTTTCTTCTTCTCTGATTCTTGCAACTGGAAAATG
CAAGCGAAGTCGTAATAAACGGATGATGATGATTCATTACATCTTGAAATGTTTTCTTGATTTCTTTATCAAGAACTGCCACAAATATGTTCTTAGGAATTAATTCCAAT
CTTTTTGGGAATCTTTCTCTGTTTTTGATAGAGATTTTGGAGTATGGTTGCATTCAATGTATCCTTCAATGGAATCATACTATAATTTGATATTGTTGAATACTATTAAT
TTCGCATTTAAATTTACTTTGCTTAAGCTTTAAGCAAGATTTGTTGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASKSGSFPTNGGSRKCLCSPTTHPGSFRCSFHRNRRKISSTRSSSSSISVIATAELELAKANALRAFLLQMIKPSSNDVQRRKNFHPRPSRFCLMNNHGTGLAVS