CuGenDBv2

Gene ID	PI0014464
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Beta-galactosidase
Genome location	chr10:6714013..6714626
RNA-Seq Expression	PI0014464
Synteny	PI0014464
Gene Ontology terms	GO:0008152 - metabolic process (biological process) GO:0000166 - nucleotide binding (molecular function) GO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0031941.1 Beta-galactosidase [Cucumis melo var. makuwa]

5.7e-55

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KAA0064801.1 Beta-galactosidase [Cucumis melo var. makuwa]

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TYJ99952.1 Beta-galactosidase [Cucumis melo var. makuwa]

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TYK08054.1 Beta-galactosidase [Cucumis melo var. makuwa]

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TYK13763.1 Beta-galactosidase [Cucumis melo var. makuwa]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A5A7VGG4 Beta-galactosidase

5.6e-56

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A0A5A7VLQ7 Beta-galactosidase

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A0A5D3BJK7 Beta-galactosidase

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A0A5D3C4T4 Beta-galactosidase

2.8e-55

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A0A5D3CPE0 Beta-galactosidase

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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ATGGATCTTTGCAGAGAACTTGTCTCGAGCAGTTCTCGTGATAGTATCCAGTACTCAAGGGTCGAAGAGATTGACAGGATTCATGACTTTCTGGCTGGTCTTAACTCTAA
GTTTGATATAGCCCGTGGGGGTATACTGGGTCAAATACTGATTCCCTCCCTTATAGAGGTTTGTTCTGAAGTTCGACTTGAGGAGGATCGTACAAATGCTATGAATGGTT
TGACAACCCCTTTTATTGACTCCGCTGCTTTTAGTGCGAGGTCCTCCACCAGTGGCAATGAAAAGAACAATGGAAAACCAGTTCCAGTCTGTGATCATTGCAAGAAACAG
TGGCACACCAAGGAGCAGTGTTGGAAGTTACATGGTCGTTCCTTGGGAGGTAAAAATCGTTCTTCCAATGACAAACATAATACAGGACGGGTATATGTGAGTGAGTCTAC
TGGAACTTCTCAACCACCTAATTTACCTGACAACCCGATCACTTCTAGTCCCACCACTCTAGGTGCCATTGCTCAATCAGAAAGCGTGGATTCTGGATTCTTGCGCTACA
AACCATTTGACTGGTTCCTCTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDLCRELVSSSSRDSIQYSRVEEIDRIHDFLAGLNSKFDIARGGILGQILIPSLIEVCSEVRLEEDRTNAMNGLTTPFIDSAAFSARSSTSGNEKNNGKPVPVCDHCKKQ
WHTKEQCWKLHGRSLGGKNRSSNDKHNTGRVYVSESTGTSQPPNLPDNPITSSPTTLGAIAQSESVDSGFLRYKPFDWFL

PI0014464 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome