CuGenDBv2

Gene ID	PI0014483
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	mitochondrial acidic protein mam33
Genome location	chr11:12885054..12899801
RNA-Seq Expression	PI0014483
Synteny	PI0014483
Gene Ontology terms	GO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component)
InterPro domains	IPR003428 - Mitochondrial glycoprotein IPR036561 - Mitochondrial glycoprotein superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

XP_004139944.1 mitochondrial acidic protein mam33 [Cucumis sativus]

5.7e-101

91.58

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XP_008448290.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490527 isoform X1 [Cucumis melo]

7.4e-93

88.14

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XP_022928687.1 uncharacterized protein LOC111435528 [Cucurbita moschata]

1.5e-88

82.67

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XP_022967898.1 uncharacterized protein LOC111467274 [Cucurbita maxima]

9.4e-88

82.18

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         K
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XP_023544221.1 uncharacterized protein LOC111803860 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.5e-88

82.67

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BK83 uncharacterized protein LOC103490527 isoform X1

3.6e-93

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A0A5A7V534 Mitochondrial acidic protein mam33

2.1e-72

87.66

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A0A6J1DM07 mitochondrial acidic protein mam33

5.2e-84

79.21

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        M RA QIFRK+RKA HDL+LLKILQSEITHELSST  Q+ + +G S DF VEHDS KSQDVVLRRKL+SGEEV +SAL GP RFG EGAFPR+ILMKICV
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        SKPGV S+LQFDCGVSED HGGSPFK+YNAYYLQSS  LG SVYRGP FSSLDP+LQDALK+YLISRGVEESLT+FL +H+HKKE GQYLNWLQN+ES +
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         K
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A0A6J1EKM2 uncharacterized protein LOC111435528

7.0e-89

82.67

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        M RA QIFRK+RKA HDL+LLKILQSEI HELSSTP QN+E  GSS+DF VEHDSLKS+DVVLRRKL+SGEE+ ISAL GP  FG EGAF R+ILMKICV
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         K
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A0A6J1HWH3 uncharacterized protein LOC111467274

4.6e-88

82.18

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        M RA QIFRK+RKA HDL+LLKILQSEI HELSST  QN+E  GSS+DF VEHDSLKS+DVVLRRKL+SGEE+ ISAL GP  FG EGAF R+ILMKICV
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        SKPGV+SLLQFDCGVSEDGHGGSPFK+YNAYYLQSS CLGPSVYRGP FSSLDP+LQ ALK +LISRGVEESLT FL IHLHKKE GQYLNWLQNVES I
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         K
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O94675 Mitochondrial acidic protein mam33

9.7e-11

34.62

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Query:  EGAFPRDILMK-----ICVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGP----------SVYRGPSFSSLDPQLQDALKEYLISRGVEE
        E  FP + L +     I +SKPG  +L+ F+    +DG     F + N Y+ +  D L              Y GPSF  LDP+LQD    YL  R ++E
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Query:  SLTSFLFIHLHKKEHGQYLNWLQNVESSIK
        SL+SF+      KE  +Y+NWL++V   +K
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P40513 Mitochondrial acidic protein MAM33

6.9e-09

33.64

Show/hide

Query:  ILMKICVSKPGVSSLLQFDCGVSEDG----HGGSPFKLYNAYYLQSSDC--LGPSVYRGPSFSSLDPQLQDALKEYLISRGVEESLTSFLFIHLHKKEHG
        ++ K   S+P VS  L  +    ++G       +P+   +A   QS++       VY GP FS+LD +LQ++L+ YL SRGV E L SF+  +   KE+ 
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Query:  QYLNWLQNVE
        +Y++WL+ ++
Subjt:  QYLNWLQNVE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G41600.1 Mitochondrial glycoprotein family protein

3.4e-27

45.21

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        M +   + ++  KA  + +LLKILQSEI HE+S    Q  E  GS  DF ++ DS +SQD+VL+R+ DSGE+VV+SALL P     E    FPR+   K+
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Query:  CVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGPSVY
        C+ KPG+SS+LQF C V E G G S F + +AY+++S      S Y
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AT2G41600.2 Mitochondrial glycoprotein family protein

4.0e-28

43.21

Show/hide

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        M +   + ++  KA  + +LLKILQSEI HE+S    Q  E  GS  DF ++ DS +SQD+VL+R+ DSGE+VV+SALL P     E    FPR+   K+
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Query:  CVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGPSVYRGPSFSSLDPQLQDAL
        C+ KPG+SS+LQF C V E G G S F + +AY+++S      S Y    F S   Q   A+
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AT2G41600.3 Mitochondrial glycoprotein family protein

3.3e-46

47.52

Show/hide

Query:  MARATQIFRKSRKAFHDLNLLKILQSEITHELSSTPCQNYENNGSSNDFTVEHDSLKSQDVVLRRKLDSGEEVVISALLGPFRFGYEG--AFPRDILMKI
        M +   + ++  KA  + +LLKILQSEI HE+S    Q  E  GS  DF ++ DS +SQD+VL+R+ DSGE+VV+SALL P     E    FPR+   K+
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Query:  CVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGPSVYRGPSFSSLDPQLQDALKEYLISRGVEESLTSFLFIHLHKKEHGQYLNWLQNVES
        C+ KPG+SS+LQF C V E G G S F + +AY+++S      S Y    FS +DP+L  AL++YLIS+GV E LT+FL  HL+KKE  QY+NWL+ +ES
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Query:  SI
        ++
Subjt:  SI

AT2G41600.4 Mitochondrial glycoprotein family protein

3.4e-27

45.21

Show/hide

Query:  MARATQIFRKSRKAFHDLNLLKILQSEITHELSSTPCQNYENNGSSNDFTVEHDSLKSQDVVLRRKLDSGEEVVISALLGPFRFGYEG--AFPRDILMKI
        M +   + ++  KA  + +LLKILQSEI HE+S    Q  E  GS  DF ++ DS +SQD+VL+R+ DSGE+VV+SALL P     E    FPR+   K+
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Query:  CVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGPSVY
        C+ KPG+SS+LQF C V E G G S F + +AY+++S      S Y
Subjt:  CVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGPSVY

AT2G41600.5 Mitochondrial glycoprotein family protein

3.3e-46

47.52

Show/hide

Query:  MARATQIFRKSRKAFHDLNLLKILQSEITHELSSTPCQNYENNGSSNDFTVEHDSLKSQDVVLRRKLDSGEEVVISALLGPFRFGYEG--AFPRDILMKI
        M +   + ++  KA  + +LLKILQSEI HE+S    Q  E  GS  DF ++ DS +SQD+VL+R+ DSGE+VV+SALL P     E    FPR+   K+
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Query:  CVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGPSVYRGPSFSSLDPQLQDALKEYLISRGVEESLTSFLFIHLHKKEHGQYLNWLQNVES
        C+ KPG+SS+LQF C V E G G S F + +AY+++S      S Y    FS +DP+L  AL++YLIS+GV E LT+FL  HL+KKE  QY+NWL+ +ES
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Query:  SI
        ++
Subjt:  SI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCAGGGCTACTCAAATATTTCGCAAATCTCGTAAAGCCTTCCACGATCTCAACCTCCTCAAGATCTTGCAATCCGAGATAACCCACGAGCTTTCTTCAACCCCATG
TCAGAACTATGAGAACAATGGTAGTTCCAACGATTTCACTGTGGAACATGACTCGCTCAAGTCCCAAGACGTGGTGTTGCGGCGAAAATTGGATTCTGGTGAGGAGGTTG
TGATTTCTGCTCTATTGGGTCCTTTCAGATTTGGATATGAAGGGGCTTTTCCGAGGGACATTTTGATGAAGATTTGTGTGAGTAAGCCTGGAGTTAGCTCTCTTTTGCAG
TTTGATTGTGGGGTTTCAGAGGACGGTCATGGTGGGTCTCCTTTCAAACTCTACAATGCCTATTATCTTCAATCTTCTGATTGTTTGGGACCTTCTGTTTATAGAGGCCC
TTCGTTCAGCTCGTTAGATCCTCAGTTACAAGACGCGCTCAAGGAATACCTAATCAGTAGAGGTGTTGAAGAAAGCCTGACCAGCTTCCTTTTCATTCACCTGCATAAAA
AAGAGCATGGTCAGTATCTGAATTGGTTACAAAATGTTGAATCTTCAATCAAAAAGACAATCGAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAGATGGCGGTCATGATAATTTTAAACCAAGTAAAGGATGTTAGAAACTGAGAGAGGGCAACACCCAAAGAAGAAGACGAAGGGACGGTAGAATAATGGCCAGGGCTACT
CAAATATTTCGCAAATCTCGTAAAGCCTTCCACGATCTCAACCTCCTCAAGATCTTGCAATCCGAGATAACCCACGAGCTTTCTTCAACCCCATGTCAGAACTATGAGAA
CAATGGTAGTTCCAACGATTTCACTGTGGAACATGACTCGCTCAAGTCCCAAGACGTGGTGTTGCGGCGAAAATTGGATTCTGGTGAGGAGGTTGTGATTTCTGCTCTAT
TGGGTCCTTTCAGATTTGGATATGAAGGGGCTTTTCCGAGGGACATTTTGATGAAGATTTGTGTGAGTAAGCCTGGAGTTAGCTCTCTTTTGCAGTTTGATTGTGGGGTT
TCAGAGGACGGTCATGGTGGGTCTCCTTTCAAACTCTACAATGCCTATTATCTTCAATCTTCTGATTGTTTGGGACCTTCTGTTTATAGAGGCCCTTCGTTCAGCTCGTT
AGATCCTCAGTTACAAGACGCGCTCAAGGAATACCTAATCAGTAGAGGTGTTGAAGAAAGCCTGACCAGCTTCCTTTTCATTCACCTGCATAAAAAAGAGCATGGTCAGT
ATCTGAATTGGTTACAAAATGTTGAATCTTCAATCAAAAAGACAATCGAATGAACTTTAACTTCACATCGTACCCCGGATGCCTGATTTTCATATGGGAAGAGGAGGTCT
GACTTTAAGTGCAGGTTTAATATAACAAGAAGACAAAGTCGAGTCTCCAGACTTCCTCTTTCATTGGGAGTAAGGAGGTTCATTGTGCCATTTCTTCCGAGGTCCCAACA
GTCAAAGGTTGAGTCATAAGCAGATCGTGTCTTTCCATCTTGGCTTTTGACTCTCAATCTTGGGATTGTATCCTGCTTGAACCATGATTGGTCAACTAGCTCATTTACTC
ATTCAACAATCACGCTTTGTAGGACTTAAACCGAAAAGACCCAGCCTCCAGCTTCTTATTGCAGAC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MARATQIFRKSRKAFHDLNLLKILQSEITHELSSTPCQNYENNGSSNDFTVEHDSLKSQDVVLRRKLDSGEEVVISALLGPFRFGYEGAFPRDILMKICVSKPGVSSLLQ
FDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLQSSDCLGPSVYRGPSFSSLDPQLQDALKEYLISRGVEESLTSFLFIHLHKKEHGQYLNWLQNVESSIKKTIE

PI0014483 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome