; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0014513 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0014513
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr11:12246648..12246875
RNA-Seq ExpressionPI0014513
SyntenyPI0014513
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043083.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold158G00210 [Cucumis melo var. makuwa]6.8e-1669.33Show/hide
Query:  MRVIQTKIHQEVVEDKIIR----------GGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
        ++VIQT+IHQEV ED IIR          GGMTKDRLNVIIVINS I+ GN EI+LKKMQI+LRKMKK+VI HCF
Subjt:  MRVIQTKIHQEVVEDKIIR----------GGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
KAA0058597.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-0863.79Show/hide
Query:  IHQEVVEDKIIRGGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
        I  +V +D+I+ GGMTKD LNVIIVIN  II GN EI+ KKMQ +L+ MKK+VI HCF
Subjt:  IHQEVVEDKIIRGGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
XP_031737535.1 uncharacterized protein LOC105435097 [Cucumis sativus]1.6e-0483.33Show/hide
Query:  TKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKK
        TKDRLNVIIVIN  II GN EI+LKKMQI+LRKMKK
Subjt:  TKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TIB1 Uncharacterized protein3.3e-1669.33Show/hide
Query:  MRVIQTKIHQEVVEDKIIR----------GGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
        ++VIQT+IHQEV ED IIR          GGMTKDRLNVIIVINS I+ GN EI+LKKMQI+LRKMKK+VI HCF
Subjt:  MRVIQTKIHQEVVEDKIIR----------GGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
A0A5A7UV40 Retrotransposon protein1.1e-0863.79Show/hide
Query:  IHQEVVEDKIIRGGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
        I  +V +D+I+ GGMTKD LNVIIVIN  II GN EI+ KKMQ +L+ MKK+VI HCF
Subjt:  IHQEVVEDKIIRGGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAGTAATTCAAACTAAAATTCATCAAGAGGTCGTGGAAGACAAAATTATTCGAGGAGGTATGACAAAAGACAGGTTGAATGTTATAATTGTCATAAATTCGACCAT
TATTCCTGGGAATGTAGAAATAAAGTTGAAGAAAATGCAAATTGTGCTAAGAAAGATGAAGAAATCGGTGATTAATCATTGCTTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAGTAATTCAAACTAAAATTCATCAAGAGGTCGTGGAAGACAAAATTATTCGAGGAGGTATGACAAAAGACAGGTTGAATGTTATAATTGTCATAAATTCGACCAT
TATTCCTGGGAATGTAGAAATAAAGTTGAAGAAAATGCAAATTGTGCTAAGAAAGATGAAGAAATCGGTGATTAATCATTGCTTCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRVIQTKIHQEVVEDKIIRGGMTKDRLNVIIVINSTIIPGNVEIKLKKMQIVLRKMKKSVINHCF