| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| XP_004142576.2 polygalacturonase [Cucumis sativus] | 2.8e-107 | 75.91 | Show/hide |
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FL+AWTSACSS TRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKN ITFLLNGTLVAPL I+ +++ G+ F K T + + +
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SITFNWANN+I+SGLTSINSQQTH+VIN CNNVVVKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSSTNVTITG+T KTGDDCISIGDGTK LF SDIKCGPGHGVSIGS
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LGKE NENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFV+HV+FQNI+M NV++PILIDQNYC N+QSCSLQ+
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| XP_008460791.1 PREDICTED: polygalacturonase-like [Cucumis melo] | 1.3e-104 | 74.82 | Show/hide |
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FL+AW SACSSLTRSTINVPKGRFLLT ITFRGPCK NNI FLLNGTLVAPL I+ ++ G+ F + T + + +
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+SITFNWA+N+IISGLTSINS+QTHIVIN CNNVVVKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSST VTI+GTT KTGDDCISIGDGTK LF SDIKCGPGHGVSIG
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SLGKE+NENGVENVTL+NAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHV+F+NIIMN+V+HPILIDQNYC NNQ CS+Q
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| XP_022927937.1 polygalacturonase-like [Cucurbita moschata] | 5.4e-95 | 67.15 | Show/hide |
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FL+AWTSACSS T STINVPKGRFLL PITFRGPC N ITF LNGTLVAPL I+ +++ + F + + + +
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SITFNWANN+I+SGLTS+NS+Q+HI IN CNNV+VKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSST+VTITGTT +TGDDCISIGDGTK LF + IKCGPGHGVSIGS
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LGKE +E GV+NVTL+NAVFTKSDNGVRIKTW P NGFVKHV+FQNI+MNNV++PI+IDQNYC +N+ C Q+
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| XP_031736043.1 polygalacturonase-like [Cucumis sativus] | 2.8e-107 | 75.91 | Show/hide |
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FL+AWTSACSS TRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKN ITFLLNGTLVAPL I+ +++ G+ F K T + + +
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SITFNWANN+I+SGLTSINSQQTH+VIN CNNVVVKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSSTNVTITG+T KTGDDCISIGDGTK LF SDIKCGPGHGVSIGS
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LGKE NENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFV+HV+FQNI+M NV++PILIDQNYC N+QSCSLQ+
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| XP_038876456.1 polygalacturonase-like [Benincasa hispida] | 4.9e-104 | 73.72 | Show/hide |
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F++AW SACSSLT S INVPKGRFLLTPITFRGPCKN ITF LNGTLVAPL I+ +++ G+ F K T + + +
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SITFNWANN+IISGLTSINSQQ+H+VIN CNNVVVKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSSTNVTI G+T KTGDDCISIGDGTK LF ++IKCGPGHGVSIGS
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LGKE+NENGVENVTL+NAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHV+FQNIIMNNV++PILIDQNYC NNQ C LQ+
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0M0F3 Uncharacterized protein | 1.3e-107 | 75.91 | Show/hide |
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FL+AWTSACSS TRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKN ITFLLNGTLVAPL I+ +++ G+ F K T + + +
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SITFNWANN+I+SGLTSINSQQTH+VIN CNNVVVKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSSTNVTITG+T KTGDDCISIGDGTK LF SDIKCGPGHGVSIGS
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LGKE NENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFV+HV+FQNI+M NV++PILIDQNYC N+QSCSLQ+
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| A0A1S3CD98 polygalacturonase-like | 6.2e-105 | 74.82 | Show/hide |
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FL+AW SACSSLTRSTINVPKGRFLLT ITFRGPCK NNI FLLNGTLVAPL I+ ++ G+ F + T + + +
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+SITFNWA+N+IISGLTSINS+QTHIVIN CNNVVVKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSST VTI+GTT KTGDDCISIGDGTK LF SDIKCGPGHGVSIG
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SLGKE+NENGVENVTL+NAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHV+F+NIIMN+V+HPILIDQNYC NNQ CS+Q
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| A0A5A7VB33 Polygalacturonase-like | 6.2e-105 | 74.82 | Show/hide |
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+SITFNWA+N+IISGLTSINS+QTHIVIN CNNVVVKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSST VTI+GTT KTGDDCISIGDGTK LF SDIKCGPGHGVSIG
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SLGKE+NENGVENVTL+NAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHV+F+NIIMN+V+HPILIDQNYC NNQ CS+Q
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| A0A6J1EIK0 polygalacturonase-like | 2.6e-95 | 67.15 | Show/hide |
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FL+AWTSACSS T STINVPKGRFLL PITFRGPC N ITF LNGTLVAPL I+ +++ + F + + + +
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SITFNWANN+I+SGLTS+NS+Q+HI IN CNNV+VKNVKI+APDQSPNTDGIHVQSST+VTITGTT +TGDDCISIGDGTK LF + IKCGPGHGVSIGS
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LGKE +E GV+NVTL+NAVFTKSDNGVRIKTW P NGFVKHV+FQNI+MNNV++PI+IDQNYC +N+ C Q+
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| A0A6J1EMF9 polygalacturonase-like | 2.6e-95 | 67.15 | Show/hide |
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FL+AWTSACSS T STINVPKGRFLL PITFRGPC N ITF LNGTLVAPL I+ +++ + F + + + +
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LGKE +E GV+NVTL+NAVFTKSDNGVRIKTW P NGFVKHV+FQNI+MNNV++PI+IDQNYC +N+ C Q+
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O22818 Probable polygalacturonase At2g43860 | 1.0e-51 | 42.96 | Show/hide |
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FL AW AC+S +TI VPKGRFL+ + F G CK I+ + G++VAP + + I G G ++ T
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Query: LMEKSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGV
KS+ F+ +NN+ ISGLTSINSQ+ HIVI+ NNV + VK+ A + SPNTDGIHV+SS +V IT + TGDDCISIG G+ +F I+CGPGHG+
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Query: SIGSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSCSLQAPPNFSSPSLKSLH
SIGSLG+ E GV+NVT+ N F ++NGVRIKTW SN F ++++FQ+I M V++PI+IDQ+YC + ++ S+ + +H
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|
|
| P24548 Exopolygalacturonase (Fragment) | 2.0e-47 | 40.79 | Show/hide |
Query: AWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAPLTIVPLEILGIGFCS----SKLTVF--------------------LSLVAILM
AW AC+S + STI VPKG F + IT GPCK++I L GTL AP P +I G+G+ + LT+F + +
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Query: EKSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSI
++ N I+ +T+++S+ H+ + GC N+ + KI A + S NTDGIH+ S V I T KTGDDCIS+GDG+K + ++I CGPGHG+S+
Subjt: EKSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSI
Query: GSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSCSLQAP
GSLG+ NE V + + N T S NGVRIKTWP G + FQ+I MN+V PILIDQ YC NQ C+ + P
Subjt: GSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSCSLQAP
|
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| P48979 Polygalacturonase | 4.7e-57 | 45.59 | Show/hide |
Query: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNN-ITFLLNGTLVAPLT----------IVPLEILGI----GFCSSKLTVFLSLVAILMEK----
FL AW AC+S+ I VP G F L + F GPCKNN ITF + GTLVAP I + G+ G + T + A E
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Query: --SITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSI
++ F+ +NN+++SGL S+NSQ HIVIN NV ++ V++ SPNTDGIHVQ S+ VTI + TGDDC+SIG GT L+ + CGPGHG+SI
Subjt: --SITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSI
Query: GSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSC
GSLGKE E GV+NVT+ F+ + NG+RIK+W PS GF ++++FQ+ M NVE+PI+IDQ+YC +N+ C
Subjt: GSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSC
|
|
| Q39766 Polygalacturonase | 3.5e-52 | 41.61 | Show/hide |
Query: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAP--------------LTIVPLEILGIGFCSSKLTV-----------FLSLV
FL+AW AC+S+T ST+ +PKG +LL+ + GPCK I + GT+ AP ++ ++ G G + ++ F S +
Subjt: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAP--------------LTIVPLEILGIGFCSSKLTV-----------FLSLV
Query: AILMEKSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGH
+ +I F++ N +I +TS +S+ HI + C N+ ++ +KI APD+SPNTDGIH+ S V I + KTGDDCISIGDGTK + +I CGPGH
Subjt: AILMEKSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGH
Query: GVSIGSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQ
G+SIGSLGK NE VE + + N T + NG RIKTWP G V + F++I MNNV PILIDQ YC N+
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|
| Q39786 Polygalacturonase | 4.5e-52 | 41.61 | Show/hide |
Query: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAP--------------LTIVPLEILGIGFCSSKLTV-----------FLSLV
FL+AW AC+S+T ST+ +PKG +LL+ + GPCK I + GT+ AP ++ ++ G G + ++ F S +
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Query: AILMEKSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGH
+ +I F++ N +I +TS +S+ HI + C N+ ++ +KI APD+SPNTDGIH+ S V I + KTGDDCISIGDGTK + +I CGPGH
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Query: GVSIGSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQ
G+SIGSLGK NE VE + + N T + NG RIKTWP G V + F++I MNNV PILIDQ YC N+
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| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G05650.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 6.9e-72 | 52.03 | Show/hide |
Query: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAPLTIVPLEILGIGFCSSKLTVFLSLVAILME--------------------
FL+AW AC S +T+ VP G FLL ITF GPCK+ ITF + GT+VAP G +K+ F SLV +
Subjt: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAPLTIVPLEILGIGFCSSKLTVFLSLVAILME--------------------
Query: KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSIG
+SI+FN A +VIISG+ S+NSQ +H+ +NGC NV V+N+++VAP SPNTDG VQ ST VT+TG+T +TGDDC++IG GT+ S + CGPGHGVSIG
Subjt: KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSIG
Query: SLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSC
SL K++NE+GVENVT+ ++VFT S NGVRIK+W PS GFV++V FQN+IM NV++PI+IDQNYC +NQ C
Subjt: SLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSC
|
|
| AT1G05660.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 2.1e-73 | 53.14 | Show/hide |
Query: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAPLTIVPLEILGIGFCSSKLTVFLSLVAILME--------------------
FL+AW AC S + +T+ VPKG FLL ITF GPCK+ ITF + GT++AP G +K+ F SLV +
Subjt: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAPLTIVPLEILGIGFCSSKLTVFLSLVAILME--------------------
Query: KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSIG
+SI+FN A +VIISG+ S+NSQ TH+ +NGC NVVV+NVK+VAP SPNTDG HVQ ST VT TG+T +TGDDC++IG GT+ L + + CGPGHGVSIG
Subjt: KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSIG
Query: SLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSC
SL KE+ E+GVENVT+ ++VFT S NGVRIK+W PSNGFV+ V FQ+++M NVE+PI+IDQNYC ++ C
Subjt: SLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSC
|
|
| AT2G43870.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 7.6e-63 | 49.81 | Show/hide |
Query: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRG-PCK-NNITFLLNGTLVAP--LTIVPLEILGIGFCS-SKLTVFLSLV----AILME-----------
F+ W +AC+S TI VPKGRFLL +TF G CK +TF ++GTLVAP ++ E I F +TV+ ++ A L +
Subjt: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRG-PCK-NNITFLLNGTLVAP--LTIVPLEILGIGFCS-SKLTVFLSLV----AILME-----------
Query: -KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSI
+I F ++NV++SGLTS+NSQ H+VINGCNNV ++ VK++A SPNTDGIHVQSS++V+I T TGDDC+SIG GT L+ ++ CGPGHG+SI
Subjt: -KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSI
Query: GSLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNN
GSLGK+ E+GV+NVT+ FT +DNGVRIK+W PS+GF K++ FQ+ +MNNVE+PI+IDQNYC ++
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| AT2G43880.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 6.0e-68 | 47.64 | Show/hide |
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FL AW+ AC S R+ + VP+G +L+ + F GPCKN ITF +GTLVAP + G +K+ +S+ ++
Subjt: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAPLTIVPLEILGIGFCSSKLTVFLSLVAILME--------------------
Query: KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSIG
+SI+F+W NNV++SGL+S NSQ H+ ++ +NV ++NV+I AP SPNTDGIHVQSS+ VTI+G T TGDDCI++ G++ ++ + CGPGHG+SIG
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SLG NE GV+NVT+ ++VFTK+ NGVRIKTW PS GFV +V+F+N+IMNNVE+P++IDQNYC N + C Q+
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| AT2G43890.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 1.1e-80 | 54.74 | Show/hide |
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FL AW +AC S T+ VP+G FLL P+ FRGPC++ ITF + GT+VAP L G K+ +S++ ++
Subjt: FLEAWTSACSSLTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNNITFLLNGTLVAPLTIVPLEILGIGFCSSKLTVFLSLVAILME--------------------
Query: KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSIG
+S+TFNWAN+V++SGLTSINSQ TH+VIN CNNV+V+ VK+VAPDQSPNTDG+HVQ S VT+T T TGDDCISIG GT+ L+ S + CGPGHG+SIG
Subjt: KSITFNWANNVIISGLTSINSQQTHIVINGCNNVVVKNVKIVAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGTTTKTGDDCISIGDGTKYLFTSDIKCGPGHGVSIG
Query: SLGKEINENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVKHVMFQNIIMNNVEHPILIDQNYCSNNQSCSLQ
SLG++ NE GVEN+TLIN+VF+ SDNGVRIKTW S GFV++V+FQN+IM NV++PI++DQNYC +NQ C Q
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