CuGenDBv2

Gene ID	PI0014718
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Exportin-T
Genome location	chr05:8511771..8512218
RNA-Seq Expression	PI0014718
Synteny	PI0014718
Gene Ontology terms	GO:0071528 - tRNA re-export from nucleus (biological process) GO:0005643 - nuclear pore (cellular component) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0016363 - nuclear matrix (cellular component) GO:0000049 - tRNA binding (molecular function) GO:0031267 - small GTPase binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6575443.1 Exportin-T, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.3e-20

83.33

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFI+EGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

XP_022953461.1 exportin-T-like [Cucurbita moschata]

2.3e-20

83.33

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFI+EGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

XP_022992085.1 exportin-T-like [Cucurbita maxima]

2.3e-20

83.33

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFI+EGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

XP_023548548.1 exportin-T-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.3e-20

83.33

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFI+EGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

XP_038898562.1 exportin-T [Benincasa hispida]

1.0e-20

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K6Z9 Exportin-T

1.5e-20

83.33

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELH AN++
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

A0A6J1D5T7 Exportin-T

3.3e-20

81.67

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWC RP GEE+V GFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

A0A6J1GNA6 Exportin-T

1.1e-20

83.33

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFI+EGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

A0A6J1JUQ6 Exportin-T

1.1e-20

83.33

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFIKLIKDWCARP GEEKV GFQSFI+EGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

A0A6J1KCZ5 Exportin-T

6.2e-19

81.67

Show/hide

Query:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV
        L+ +  VQIFI+LIKDWC RP GEEKV GFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELH ANT+
Subjt:  LLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTV

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q7PC79 Exportin-T

1.0e-18

73.68

Show/hide

Query:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY
        VQIFIKLIKDWCA P  EEKV GFQ+F+IE FATNCCLYSVLDKSF    ANT  ++
Subjt:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY

Q8H3A7 Exportin-T

1.3e-10

50.88

Show/hide

Query:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY
        VQ F+ LIKDWC+    E+K+ GF+ F+IE FAT CCL SVLDKSF      ++ ++
Subjt:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G72560.1 ARM repeat superfamily protein

7.2e-20

73.68

Show/hide

Query:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY
        VQIFIKLIKDWCA P  EEKV GFQ+F+IE FATNCCLYSVLDKSF    ANT  ++
Subjt:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY

AT1G72560.2 ARM repeat superfamily protein

7.2e-20

73.68

Show/hide

Query:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY
        VQIFIKLIKDWCA P  EEKV GFQ+F+IE FATNCCLYSVLDKSF    ANT  ++
Subjt:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY

AT1G72560.3 ARM repeat superfamily protein

7.2e-20

73.68

Show/hide

Query:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY
        VQIFIKLIKDWCA P  EEKV GFQ+F+IE FATNCCLYSVLDKSF    ANT  ++
Subjt:  VQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIY

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTCTTGTTAGAAAGGCGTTATGTACAGATATTCATTAAATTAATTAAAGACTGGTGTGCCCGGCCTTTAGGAGAAGAAAAGGTGCTTGGCTTTCAAAGTTTTATAAT
CGAAGGCTTTGCAACAAACTGTTGCTTGTACAGTGTACTTGATAAATCATTTGAATTACATGGTGCAAATACTGTGAGGATATACTATTCAGAATTCTGTTTCATTTATT
ATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFLLERRYVQIFIKLIKDWCARPLGEEKVLGFQSFIIEGFATNCCLYSVLDKSFELHGANTVRIYYSEFCFIYY

PI0014718 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome