; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0014813 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0014813
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationchr01:4275987..4276373
RNA-Seq ExpressionPI0014813
SyntenyPI0014813
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0016192 - vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0030121 - AP-1 adaptor complex (cellular component)
GO:0035615 - clathrin adaptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050549.1 AP-1 complex subunit sigma-2 [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-2987.65Show/hide
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KAE8645705.1 hypothetical protein Csa_020389 [Cucumis sativus]3.3e-3894.51Show/hide
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KAG4907342.1 hypothetical protein JHK86_055826 [Glycine max]5.1e-2350.41Show/hide
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        +C+  + + TIVF TC+ IPL +LK A+ASMF + S  T  M      P    L V R+E+L+   C  G ++EICS+CL E+ GE  VS+L RC HVFH
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        L CI+ W+ RNQF+CPLCRSF+F
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KAG4998727.1 hypothetical protein JHK85_030166 [Glycine max]6.6e-2352.03Show/hide
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        +C+  + + TIVF TC+ IPL QLK A+ASM  + S  T  M      P    L V RFE+L+   C    +EEICS+CL E+ GE  VS+L RC HVFH
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        L CIE W+ RNQF+CPLCRSF+F
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TKY50666.1 RING-H2 finger protein ATL18 [Spatholobus suberectus]2.3e-2349.63Show/hide
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        MI + +CR  + + TIVF TC+ IP  QLK A+ SMF  L    S  T  M      P    L V R+E+L+    VG E    +EICS+CL E+ GE  
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        VS+L RC HVFHL CIE W+ RNQF+CPLCRSF+F
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K513 RING-type domain-containing protein1.2e-6296.09Show/hide
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        MIGMALCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAI+SMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQ +VGSEEEICSVCLTEFT EHLVSQLHRCSHV
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        FHLECIESWLQRNQFTCPLCRSFIFQ L
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A0A0B2QNV8 RING-H2 finger protein ATL182.5e-2350.41Show/hide
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        +C+  + + TIVF TC+ IPL +LK A+ASMF + S  T  M      P    L V R+E+L+   C  G ++EICS+CL E+ GE  VS+L RC HVFH
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Query:  LECIESWLQRNQFTCPLCRSFIF
        L CI+ W+ RNQF+CPLCRSF+F
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A0A5D3D5G1 AP-1 complex subunit sigma-21.3e-2987.65Show/hide
Query:  MSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQCSVGSEEEICSVCLTEFTGEHLV
        MSMAT+VFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTC MLTT  +PCEVKLLVCRFEELQ  VGSEEEICS+CLTEFT EHL+
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A0A6P6AC29 RING-H2 finger protein ATL18-like4.2e-2344.93Show/hide
Query:  MIGMALCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDIL-----SGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQCSVGSE--------EEICSVCLTEFTG
        MI +      +S A ++F TCVWIP  QLK A+  +   +     +  +CQ++        V L V RFE+L+ S GS         EE+CS+CL EF  
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        E +VSQLH+C H+FH+ CIE WL R+QFTCPLCRSF+F
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K7N2N2 RING-type domain-containing protein2.5e-2350.41Show/hide
Query:  LCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQ---CSVGSEEEICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFH
        +C+  + + TIVF TC+ IPL +LK A+ASMF + S  T  M      P    L V R+E+L+   C  G ++EICS+CL E+ GE  VS+L RC HVFH
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Query:  LECIESWLQRNQFTCPLCRSFIF
        L CI+ W+ RNQF+CPLCRSF+F
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8RX29 RING-H2 finger protein ATL704.3e-0951.11Show/hide
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        C++CL ++ G+HL+ QL  C+H+FHL+CI++WL+ N  TCP+CR+
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Q9FHG8 Putative RING-H2 finger protein ATL509.6e-0959.09Show/hide
Query:  CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCR
        C+VCL EFT E  +  L +CSH FH+ECI++WL  N  TCPLCR
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Q9FL07 RING-H2 finger protein ATL461.3e-0854.17Show/hide
Query:  CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRSFIF
        C+VCL EF+ +  +  L  CSH FHL CI++WLQ N  TCPLCR  +F
Subjt:  CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRSFIF

Q9SZL4 RING-H2 finger protein ATL181.7e-1340Show/hide
Query:  MIGMALCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQCSVGSEEEI-CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSH
        MI M   R  +  A IVF TCV IPL +LK                    A       L+   F + +     EEEI C +CL EF  E  V+ L RC+H
Subjt:  MIGMALCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQCSVGSEEEI-CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSH

Query:  VFHLECIESWLQRNQFTCPLCRSFI
        +FH+ CIE WL R   TCPLCRSF+
Subjt:  VFHLECIESWLQRNQFTCPLCRSFI

Q9XF92 Brassinosteroid-responsive RING protein 11.3e-1046.88Show/hide
Query:  LLVCRFEELQCSVGSEEEICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRS
        L V +FEEL  S     E C+VCL EF GE  +  L  C H+FH  C++ W+  +Q TCPLCR+
Subjt:  LLVCRFEELQCSVGSEEEICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24580.1 RING/U-box superfamily protein5.2e-1032.11Show/hide
Query:  IPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLP----CEVKLLVCRFEELQCSVGSEEE----ICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQF
        + ++ LK  + S+F I++  T   +     P       ++ + +F+ L  ++  EEE     C VCL  F  E  VS+L  C H FH  C+++W   N  
Subjt:  IPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLP----CEVKLLVCRFEELQCSVGSEEE----ICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQF

Query:  TCPLCRSFI
        TCPLCRS +
Subjt:  TCPLCRSFI

AT2G35910.1 RING/U-box superfamily protein3.1e-1051.11Show/hide
Query:  CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRS
        C++CL ++ G+HL+ QL  C+H+FHL+CI++WL+ N  TCP+CR+
Subjt:  CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRS

AT3G61460.1 brassinosteroid-responsive RING-H29.5e-1246.88Show/hide
Query:  LLVCRFEELQCSVGSEEEICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRS
        L V +FEEL  S     E C+VCL EF GE  +  L  C H+FH  C++ W+  +Q TCPLCR+
Subjt:  LLVCRFEELQCSVGSEEEICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCRS

AT4G38140.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-1440Show/hide
Query:  MIGMALCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQCSVGSEEEI-CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSH
        MI M   R  +  A IVF TCV IPL +LK                    A       L+   F + +     EEEI C +CL EF  E  V+ L RC+H
Subjt:  MIGMALCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQCSVGSEEEI-CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSH

Query:  VFHLECIESWLQRNQFTCPLCRSFI
        +FH+ CIE WL R   TCPLCRSF+
Subjt:  VFHLECIESWLQRNQFTCPLCRSFI

AT5G57750.1 RING/U-box superfamily protein6.8e-1059.09Show/hide
Query:  CSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWLQRNQFTCPLCR
        C+VCL EFT E  +  L +CSH FH+ECI++WL  N  TCPLCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAGGCATGGCATTATGTAGAGGTTCAATGTCCATGGCCACCATTGTCTTCTTAACTTGTGTGTGGATCCCTTTGAGCCAACTGAAGGCAGCCATTGCGAGCATGTT
CGACATTCTATCGGGTCGGACATGTCAGATGCTCACGACAGCGTCGCTGCCTTGTGAGGTAAAACTTCTGGTTTGTAGGTTTGAAGAGCTGCAGTGCAGTGTTGGATCGG
AGGAGGAAATTTGCTCCGTTTGCTTGACGGAGTTCACCGGAGAACATTTGGTGAGCCAATTGCATAGATGTAGCCATGTTTTCCATCTAGAATGTATTGAGAGTTGGCTA
CAAAGAAACCAATTTACCTGCCCTCTCTGCAGATCCTTCATCTTCCAAGCATTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATAGGCATGGCATTATGTAGAGGTTCAATGTCCATGGCCACCATTGTCTTCTTAACTTGTGTGTGGATCCCTTTGAGCCAACTGAAGGCAGCCATTGCGAGCATGTT
CGACATTCTATCGGGTCGGACATGTCAGATGCTCACGACAGCGTCGCTGCCTTGTGAGGTAAAACTTCTGGTTTGTAGGTTTGAAGAGCTGCAGTGCAGTGTTGGATCGG
AGGAGGAAATTTGCTCCGTTTGCTTGACGGAGTTCACCGGAGAACATTTGGTGAGCCAATTGCATAGATGTAGCCATGTTTTCCATCTAGAATGTATTGAGAGTTGGCTA
CAAAGAAACCAATTTACCTGCCCTCTCTGCAGATCCTTCATCTTCCAAGCATTGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIGMALCRGSMSMATIVFLTCVWIPLSQLKAAIASMFDILSGRTCQMLTTASLPCEVKLLVCRFEELQCSVGSEEEICSVCLTEFTGEHLVSQLHRCSHVFHLECIESWL
QRNQFTCPLCRSFIFQAL