; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0014851 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0014851
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationchr04:3711596..3712813
RNA-Seq ExpressionPI0014851
SyntenyPI0014851
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025673.1 RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-10197.37Show/hide
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KAG6603909.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-7576.04Show/hide
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XP_011658497.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHA2B [Cucumis sativus]4.1e-10297.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KKP7 RING-type domain-containing protein7.0e-11697.17Show/hide
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A0A1S3B2S4 RING-H2 finger protein ATL72-like2.0e-10297.38Show/hide
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A0A5D3CLV8 RING-H2 finger protein ATL72-like9.8e-10297.37Show/hide
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A0A6J1GEN4 RING-H2 finger protein ATL74-like1.6e-7576.04Show/hide
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A0A6J1IJG4 RING-H2 finger protein ATL74-like3.0e-7475.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL642.0e-1140.86Show/hide
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Q8GW38 RING-H2 finger protein ATL472.2e-1041.89Show/hide
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Q8H7N9 E3 ubiquitin-protein ligase Os03g01882002.2e-1032.59Show/hide
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Q9LZJ6 RING-H2 finger protein ATL51.3e-1041.57Show/hide
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        +S S  PL  T    +L  +P+++Y   +   P            C +CL+EFE  DE RVLP C HVFH  CID W   RS  CPLCR
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Q9SJJ7 RING-H2 finger protein ATL571.0e-1037.5Show/hide
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        SQ + ++PVY Y  ++             + +CVICL++FE G+ ++V+P+C HVFH  C+D WL    + CPLCR + +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23980.1 RING/U-box superfamily protein1.6e-1141.89Show/hide
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        L+  +PV++Y +              E  +C +CL EF   D+LR+LPNC H FH  CID WL L +  CPLCR
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AT1G63840.1 RING/U-box superfamily protein5.4e-1240.26Show/hide
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AT2G27940.1 RING/U-box superfamily protein7.1e-1237.5Show/hide
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AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-1240.86Show/hide
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AT3G62690.1 AtL59.3e-1241.57Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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