; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0015013 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0015013
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionlysine-rich arabinogalactan protein 18-like
Genome locationchr08:20001532..20003196
RNA-Seq ExpressionPI0015013
SyntenyPI0015013
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044981 - Lysine-rich arabinogalactan protein AGP9/17/18


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001267612.1 arabinogalactan protein precursor [Cucumis sativus]2.5e-9595.47Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAA YPPPAASPVS PTN SPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPP VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPV VPVSSPPVPTP ESPPAPESSPPAPVASPP EVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF
        PAGSEEGP+PSPSLEDKSGAEAL+ V GSLALGWAAVAVSIIF
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF

TYK12844.1 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like [Cucumis melo var. makuwa]8.8e-8598.16Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPP VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPS KKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDK
        PAGSEEGPSPSPSLEDK
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDK

XP_008440341.2 PREDICTED: lysine-rich arabinogalactan protein 18-like [Cucumis melo]2.9e-9697.12Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPP VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPS KKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF
        PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL+ V GSLALGWAAVAVSIIF
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF

XP_023003133.1 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like [Cucurbita maxima]2.2e-8083.59Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPA   PVAAKYPPPAASPV PPTNSSPAAAPQKP TPAPVSTPPA     VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPA---------ATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALL
        SSPPAASVP SSPPA         ATVPASSPPVPVP SSPPVPVP SSPPVPTP ESPPAPES+PPAPVASPPAEVP+PAPSKKKSKKH+APAPSPALL
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPA---------ATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALL

Query:  GPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF
        GPPAPPSEAP GSEEGPSP+PSL+DKSGAEAL      VVGSLALG++A   S +F
Subjt:  GPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF

XP_023517454.1 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-8085.83Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPA   PVAAKYPPPAASPV PPTNSSPAAAPQKP TPAPVST     PPVVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVP SSPP ATVPASSPPVPVP SSPPVPVP SSPPVPTP ESPPAPE++PPAPVASPPAEVP+PAPSKKKSKKH+APAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF
        P GSEEGPSP+PSL+DKSGAEAL      VVGSLALG++A   S +F
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B0X7 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like1.4e-9697.12Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPP VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPS KKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF
        PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL+ V GSLALGWAAVAVSIIF
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF

A0A5D3CP79 Lysine-rich arabinogalactan protein 18-like4.3e-8598.16Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPP VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPS KKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDK
        PAGSEEGPSPSPSLEDK
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDK

A0A6J1HFT1 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like2.0e-7985.02Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPA   PVAAK PPPAASPV PPTNSSPAAAPQKP TPAPVSTPPA     VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVP SSPP ATVPASSPPVPVP SSPPVPVP SSPPVPTP ESPPAPE++PPAPVASPPAEVP+PAPSKKKSKKH+APAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF
        P GSEEGP+P+PSL+DKSGAEAL      VVGSLALG++A   S +F
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF

A0A6J1KVL2 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like1.1e-8083.59Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPA   PVAAKYPPPAASPV PPTNSSPAAAPQKP TPAPVSTPPA     VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPA---------ATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALL
        SSPPAASVP SSPPA         ATVPASSPPVPVP SSPPVPVP SSPPVPTP ESPPAPES+PPAPVASPPAEVP+PAPSKKKSKKH+APAPSPALL
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPA---------ATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALL

Query:  GPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF
        GPPAPPSEAP GSEEGPSP+PSL+DKSGAEAL      VVGSLALG++A   S +F
Subjt:  GPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEAL----INVVGSLALGWAAVAVSIIF

Q9XIV1 Arabinogalactan protein1.2e-9595.47Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAA YPPPAASPVS PTN SPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPP VAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPV VPVSSPPVPTP ESPPAPESSPPAPVASPP EVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTP-ESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEA

Query:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF
        PAGSEEGP+PSPSLEDKSGAEAL+ V GSLALGWAAVAVSIIF
Subjt:  PAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C5S0 Classical arabinogalactan protein 91.9e-1043.53Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        M R   IA++ I  ++AGV GQ+P + PT TPA   P     PPPAA+P  PP ++           P PV+T P   PPV    A PPA+ PP    P 
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEAP
        SSPP AS PP++PP    P +SP  P PV+SPP   P + PPV TP         PPAP+ASPPA+VPAPAP+ K      +P+PSP+   PP P S+AP
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEAP

Query:  AGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALG
          S +  SP+PS  D +       +V SL  G
Subjt:  AGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALG

Q9FPQ6 Vegetative cell wall protein gp13.6e-0437.93Show/hide
Query:  SPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVS-------TPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPASSPPAASVPPSSPPA
        SPA    T P+ +PPV     PP+ +P  PP+ + P+ AP  P +PAP S       +PP+ APP  +P A PP+  PP+ + P+ +PP+   P   PP 
Subjt:  SPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVS-------TPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPASSPPAASVPPSSPPA

Query:  ATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPES-SPPAPVASPPAEV------PAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAP-PSEAPAGSEEGP
        +  P   P  P P ++P  P P S PP P P +PP P S SPP+PV   PA V      P+PAPS   S     P+PSP+    P+P PS +P+ S   P
Subjt:  ATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPES-SPPAPVASPPAEV------PAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAP-PSEAPAGSEEGP

Query:  SPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVS
        SP PS   K     +     ++ L WA  A++
Subjt:  SPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVS

Q9FPR2 Lysine-rich arabinogalactan protein 183.2e-2147.39Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        M R  ++ + LIC VVAGVGGQSP ++PT +P  T P A     P  SP   P  +SP        T AP  TP ASA    +PV SP +  P       
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSK-----KKSKKHR-APAPSPALLGPPA
               V  SSPP   VP SSPPVP P+    V  PVSSPPVP P +      SPPAPVA+P A+VPAPAPSK     KKSKKH+ APAP+P LLGPPA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSK-----KKSKKHR-APAPSPALLGPPA

Query:  PPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGA---EALINV-VGSLALGWAAVAVS
        PP+E+P  + +  SP PS +D+SGA     L NV VG++A  WA + ++
Subjt:  PPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGA---EALINV-VGSLALGWAAVAVS

Q9S740 Lysine-rich arabinogalactan protein 193.8e-0639.84Show/hide
Query:  MGRQSVI-ALVLICAVVA--GVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSP----AAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTP
        M   S+I +L+L  A+++   V  Q PAA+P T+    PP     PP  A+P  PPT ++P    A  P  P TP P  TP +   P VAPV SP    P
Subjt:  MGRQSVI-ALVLICAVVA--GVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSP----AAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTP

Query:  PTASVPASSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSP----PAPVASPPAEVPAPAPSKKKSK---KHRAPAPS
             P +S P  S PP SPP A  P S PP P   +SPP P P S PP P    PPAP S P    P+P++ PPA  PAP   K+K K    H APAP+
Subjt:  PTASVPASSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSP----PAPVASPPAEVPAPAPSKKKSK---KHRAPAPS

Query:  PALLGPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF
        P    PP+PPS       +  +P+PS  + +G  AL N +   A+ W    + I+F
Subjt:  PALLGPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G68725.1 arabinogalactan protein 192.7e-0739.84Show/hide
Query:  MGRQSVI-ALVLICAVVA--GVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSP----AAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTP
        M   S+I +L+L  A+++   V  Q PAA+P T+    PP     PP  A+P  PPT ++P    A  P  P TP P  TP +   P VAPV SP    P
Subjt:  MGRQSVI-ALVLICAVVA--GVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSP----AAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTP

Query:  PTASVPASSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSP----PAPVASPPAEVPAPAPSKKKSK---KHRAPAPS
             P +S P  S PP SPP A  P S PP P   +SPP P P S PP P    PPAP S P    P+P++ PPA  PAP   K+K K    H APAP+
Subjt:  PTASVPASSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSP----PAPVASPPAEVPAPAPSKKKSK---KHRAPAPS

Query:  PALLGPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF
        P    PP+PPS       +  +P+PS  + +G  AL N +   A+ W    + I+F
Subjt:  PALLGPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALGWAAVAVSIIF

AT2G14890.1 arabinogalactan protein 91.4e-1143.53Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        M R   IA++ I  ++AGV GQ+P + PT TPA   P     PPPAA+P  PP ++           P PV+T P   PPV    A PPA+ PP    P 
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEAP
        SSPP AS PP++PP    P +SP  P PV+SPP   P + PPV TP         PPAP+ASPPA+VPAPAP+ K      +P+PSP+   PP P S+AP
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEAP

Query:  AGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALG
          S +  SP+PS  D +       +V SL  G
Subjt:  AGSEEGPSPSPSLEDKSGAEALINVVGSLALG

AT2G14890.2 arabinogalactan protein 91.5e-1045.12Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        M R   IA++ I  ++AGV GQ+P + PT TPA   P     PPPAA+P  PP ++           P PV+T P   PPV    A PPA+ PP    P 
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEAP
        SSPP AS PP++PP    P +SP  P PV+SPP   P + PPV TP         PPAP+ASPPA+VPAPAP+ K      +P+PSP+   PP P S+AP
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEAP

Query:  AGSEEGPSPSPSLED
          S +  SP+PS  D
Subjt:  AGSEEGPSPSPSLED

AT4G37450.1 arabinogalactan protein 182.3e-2247.39Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA
        M R  ++ + LIC VVAGVGGQSP ++PT +P  T P A     P  SP   P  +SP        T AP  TP ASA    +PV SP +  P       
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSK-----KKSKKHR-APAPSPALLGPPA
               V  SSPP   VP SSPPVP P+    V  PVSSPPVP P +      SPPAPVA+P A+VPAPAPSK     KKSKKH+ APAP+P LLGPPA
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSK-----KKSKKHR-APAPSPALLGPPA

Query:  PPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGA---EALINV-VGSLALGWAAVAVS
        PP+E+P  + +  SP PS +D+SGA     L NV VG++A  WA + ++
Subjt:  PPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGA---EALINV-VGSLALGWAAVAVS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTAGACAATCCGTAATCGCACTCGTTCTCATCTGCGCCGTCGTCGCTGGTGTCGGTGGCCAGTCTCCGGCTGCTGCTCCCACTACCACTCCCGCCGCTACTCCCCC
AGTAGCAGCGAAGTATCCACCTCCAGCCGCATCTCCTGTATCTCCACCGACAAATTCATCTCCCGCCGCCGCTCCTCAAAAGCCGGCCACTCCAGCACCGGTCTCCACGC
CGCCTGCATCGGCGCCACCAGTAGTCGCTCCAGTAGCTTCTCCACCAGCCAGCACTCCTCCGACTGCTTCTGTTCCTGCTAGCTCTCCTCCGGCTGCTTCTGTTCCACCT
AGCTCTCCACCAGCTGCTACCGTTCCGGCCAGCTCTCCGCCTGTTCCAGTTCCGGTTAGTTCTCCACCAGTTCCAGTACCGGTGAGCTCTCCTCCAGTACCAACTCCGGA
ATCTCCTCCCGCTCCCGAAAGTTCTCCTCCTGCCCCAGTCGCGTCGCCTCCCGCTGAGGTTCCGGCGCCGGCACCTAGCAAGAAGAAGTCAAAGAAGCACAGAGCACCAG
CTCCTTCTCCGGCCTTGCTTGGTCCACCTGCGCCTCCTTCTGAAGCTCCTGCAGGAAGCGAGGAAGGTCCTTCGCCCAGCCCTTCACTGGAGGACAAGAGTGGAGCTGAA
GCATTGATAAACGTGGTCGGAAGTTTGGCTTTGGGATGGGCTGCCGTCGCCGTCAGCATCATCTTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACATTCACTTCATCATCTACTACACACACTCACACGGTAGAAATGGGTAGACAATCCGTAATCGCACTCGTTCTCATCTGCGCCGTCGTCGCTGGTGTCGGTGGCCAGTC
TCCGGCTGCTGCTCCCACTACCACTCCCGCCGCTACTCCCCCAGTAGCAGCGAAGTATCCACCTCCAGCCGCATCTCCTGTATCTCCACCGACAAATTCATCTCCCGCCG
CCGCTCCTCAAAAGCCGGCCACTCCAGCACCGGTCTCCACGCCGCCTGCATCGGCGCCACCAGTAGTCGCTCCAGTAGCTTCTCCACCAGCCAGCACTCCTCCGACTGCT
TCTGTTCCTGCTAGCTCTCCTCCGGCTGCTTCTGTTCCACCTAGCTCTCCACCAGCTGCTACCGTTCCGGCCAGCTCTCCGCCTGTTCCAGTTCCGGTTAGTTCTCCACC
AGTTCCAGTACCGGTGAGCTCTCCTCCAGTACCAACTCCGGAATCTCCTCCCGCTCCCGAAAGTTCTCCTCCTGCCCCAGTCGCGTCGCCTCCCGCTGAGGTTCCGGCGC
CGGCACCTAGCAAGAAGAAGTCAAAGAAGCACAGAGCACCAGCTCCTTCTCCGGCCTTGCTTGGTCCACCTGCGCCTCCTTCTGAAGCTCCTGCAGGAAGCGAGGAAGGT
CCTTCGCCCAGCCCTTCACTGGAGGACAAGAGTGGAGCTGAAGCATTGATAAACGTGGTCGGAAGTTTGGCTTTGGGATGGGCTGCCGTCGCCGTCAGCATCATCTTCTA
GAGAGAGATTTCATCGTTTATTTATATTTAATCTCTTTTATTTATTTTTGGTTAAAAATTTTCCCCCATTGTGTACTCCATATCATAAGAGGTGCTTTATTGATTGAATT
GATTTGATGAAATTTGTTTTAGAAATTTGAGCACTTTGTTGGGTATTTGCTTTGATGATGAACATTTTGGATCGGAGTATATGATTTGTTGTAATTCTTTCTGTGGAGGA
CTTGAGAGTGGGGAAAAATCTTTTATTACATTTGGATCCTTTTGTGTTCTGTAATTATTAATTCTCTTTCATTTCTGTTCCACTACATTTTTGTCAATTTACTTTTTACT
TCTTCTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRQSVIALVLICAVVAGVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPVVAPVASPPASTPPTASVPASSPPAASVPP
SSPPAATVPASSPPVPVPVSSPPVPVPVSSPPVPTPESPPAPESSPPAPVASPPAEVPAPAPSKKKSKKHRAPAPSPALLGPPAPPSEAPAGSEEGPSPSPSLEDKSGAE
ALINVVGSLALGWAAVAVSIIF