; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0015574 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0015574
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSmall VCP/p97-interacting protein
Genome locationchr03:971183..973292
RNA-Seq ExpressionPI0015574
SyntenyPI0015574
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR031632 - Small VCP/p97-interacting protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7020610.1 hypothetical protein SDJN02_17296 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-2794.81Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLDE QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSANANKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
XP_008444542.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487833 [Cucumis melo]1.8e-2897.4Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSAN NKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
XP_011649565.1 uncharacterized protein LOC101210682 [Cucumis sativus]2.0e-2796.1Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLD GQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSA ANKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
XP_022951067.1 uncharacterized protein LOC111454028 [Cucurbita moschata]1.6e-2794.81Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLDE QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSANANKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
XP_038886006.1 uncharacterized protein LOC120076314 [Benincasa hispida]4.1e-2896.1Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLDEG+KQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSAN NKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAJ0 uncharacterized protein LOC1034878338.9e-2997.4Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSAN NKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
A0A6J1GGM5 uncharacterized protein LOC1114540287.6e-2894.81Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLDE QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSANANKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
A0A6J1HEN1 uncharacterized protein LOC1114628433.8e-2793.51Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC SCLDEGQ+Q+RKEEERLASVEARAKAAEAAQ+RQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSAN NKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
A0A6J1K846 uncharacterized protein LOC1114920133.8e-2793.51Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC SCLDEGQ+Q+RKEEERLASVEARAKAAEAAQ+RQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSAN NKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
A0A6J1KLT2 uncharacterized protein LOC1114964247.6e-2894.81Show/hide
Query:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
        MGQC+SCLDE QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSANANKGEPVLKWSMG
Subjt:  MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G63905.1 unknown protein8.0e-2278.08Show/hide
Query:  CISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSM
        C SC D  QK+QRKEEER AS EARAKAAEAAQRR+E+F+KSAAGRAA+AQL   AKQSAN NKGEPVLKW M
Subjt:  CISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSM

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGCAATGCATAAGTTGTTTAGACGAAGGTCAAAAGCAACAGAGAAAAGAAGAAGAACGATTGGCGTCCGTCGAAGCTCGCGCCAAAGCTGCTGAAGCCGCTCAGAG
AAGGCAAGAAGAGTTTGAAAAATCTGCTGCAGGAAGGGCTGCACGTGCTCAGTTGGCAGCAAATGCAAAGCAATCTGCTAACGCTAACAAGGGCGAACCAGTTCTTAAGT
GGAGTATGGGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACGGTGTCAGATAAGGTTGGGTGTTGTAGACTCAATCCTAACCGTCCAATATAATTTTTGAATTACAAGAAAAGTCAAAATTCATAGTGAAAATACCAATTGAAGATCT
TCGGGGGAAAAAAAAACCTGCAACTGCAAGCAAAGCGATGGGGCAATGCATAAGTTGTTTAGACGAAGGTCAAAAGCAACAGAGAAAAGAAGAAGAACGATTGGCGTCCG
TCGAAGCTCGCGCCAAAGCTGCTGAAGCCGCTCAGAGAAGGCAAGAAGAGTTTGAAAAATCTGCTGCAGGAAGGGCTGCACGTGCTCAGTTGGCAGCAAATGCAAAGCAA
TCTGCTAACGCTAACAAGGGCGAACCAGTTCTTAAGTGGAGTATGGGGTGAGGTCGTGCTCTATTGTCAGCTTTCACTTCTTTTTCACTTATTTTAATGAAAGGAAAAGA
TTGTGTATTTATCCGCATTCCTTGGCTCCGCTCATGCCAGGCAACCTGTCTATATTTCCAAGTCTCCCAAGGCAGAAGTCATTGAATGGAGCTGCAGTCGTGTATTTGTT
ATTCATGAATCCAGGAAACAATAAGTGTGCGAACTTTTATTTCTCGACAATGCTTTTCCGTGTAAATTTTACCCTTAACTTGTTATGTCTCAGTCAACTTACAGTTCATC
CATATTCAATTACTGTATAGACACTTTCCCTGCACCAGCTCCATGTTTGGCTCTGTTGACAAAACTGCCCAATGATATTTGCTAAGACATGCCACTCTGCTTAACTTTGA
CATACAATTAAGATGTCGATTTTTTCTTTTTAAAGAAATTATTTAGCATGTTGCTGCAAGAATACTCTATATTGTTGCAGAGAATATGTCAAGTTGAAATGCTTTCACTG
TTGTTTTAGATATTTTTTGTCTTCACTTTCAATAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGQCISCLDEGQKQQRKEEERLASVEARAKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQLAANAKQSANANKGEPVLKWSMG