CuGenDBv2

Gene ID	PI0015628
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	AAA domain-containing protein
Genome location	chr07:6099894..6101371
RNA-Seq Expression	PI0015628
Synteny	PI0015628
Gene Ontology terms	GO:0006508 - proteolysis (biological process) GO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0004176 - ATP-dependent peptidase activity (molecular function) GO:0004222 - metalloendopeptidase activity (molecular function) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0044923.1 putative inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1 [Cucumis melo var. makuwa]

2.0e-119

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XP_011653221.1 probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic [Cucumis sativus]

9.3e-117

83.7

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XP_022136573.1 probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic [Momordica charantia]

3.0e-107

78.52

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XP_022931414.1 probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic [Cucurbita moschata]

3.0e-107

77.78

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XP_038877975.1 probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic [Benincasa hispida]

5.3e-120

85.56

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KYF2 AAA domain-containing protein

4.5e-117

83.7

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A0A5D3CXC4 Putative inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1

9.7e-120

85.19

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A0A6J1C7Y3 probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic

1.5e-107

78.52

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A0A6J1EU73 probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic

1.5e-107

77.78

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A0A6J1J7X9 probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic

9.4e-107

77.41

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        S KVKLLTSKE IA S+ + FRDFIVDL+EIPGEKSLQRTKWALRL ESEA+TVLEQYTGPQY+IET+T+
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O22993 Probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 1, chloroplastic

1.2e-53

46.69

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        MASID++  L  R  +P++    +   L H  T  F+     R     L R+    C   + SS   S     +  A DDFVTRVLKENPSQ+EPR    
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                         +  G F+F+ +  +S+KK++ +  E         E+VYL DILREYKGKLYVPEQVF  ELSEEEEF+++++ LPKMS EDF 
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        KA+E+DKVKLLTSKE    S+ + +R FIVDLKEIPG KSLQRTKW+++L+  EA+ +L++YTGPQY+IE H
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G23940.1 FtsH extracellular protease family

8.3e-55

46.69

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        MASID++  L  R  +P++    +   L H  T  F+     R     L R+    C   + SS   S     +  A DDFVTRVLKENPSQ+EPR    
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                         +  G F+F+ +  +S+KK++ +  E         E+VYL DILREYKGKLYVPEQVF  ELSEEEEF+++++ LPKMS EDF 
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        KA+E+DKVKLLTSKE    S+ + +R FIVDLKEIPG KSLQRTKW+++L+  EA+ +L++YTGPQY+IE H
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCTCCATTGATTCACTGTTATCTCCAAGGGCCTTCCTTCCAAAATCCTCCTTCAACCAACTCACTCCTCCTCTGAACCATCTACAAACTAAGCGTTTCAATTTCAC
TCGGAATCCCAGAACGCCATTTTTGTTTCTTCACCGAAACAGGTTTGCTTTCTGTTTGGCAGTTTCAAATTCTTCGGATTCACCGTCACAGTCCTCCGGTGGCGATAAAG
CTGCCCCAGATGATTTTGTAACCAGGGTTTTGAAGGAAAATCCCAGCCAATTGGAACCCAGAAAATCGGAGGTGGGTGTGTTTGATTTTGTGGTCAAGTGGTTGAATTCG
AGAAAGAAATCGAAGGAGGAGGGAATTGAGGGTCGTAATGTGGGTGGAAATAAGAGTGAGGCTGTGTATTTGAAAGACATTTTGAGAGAGTATAAAGGAAAGCTTTACGT
GCCTGAGCAGGTTTTCAATACAGAGTTATCGGAGGAAGAAGAATTTGATAGAAGTCTTGAGGCGTTGCCGAAAATGAGCTTTGAGGATTTTGTGAAAGCCTTGGAGAGCG
ACAAAGTAAAATTGTTAACTTCAAAGGAGAGTATAGCTACGTCTTTTGGCAACAGGTTCAGAGATTTTATTGTCGATTTAAAGGAAATTCCGGGTGAAAAGAGCTTGCAA
AGAACTAAATGGGCATTAAGGCTTGACGAGAGTGAAGCTCGAACAGTATTGGAGCAGTATACAGGTCCGCAATACCAAATCGAGACGCATACCTCGCTAGGATCTTTGGC
AAGGGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASIDSLLSPRAFLPKSSFNQLTPPLNHLQTKRFNFTRNPRTPFLFLHRNRFAFCLAVSNSSDSPSQSSGGDKAAPDDFVTRVLKENPSQLEPRKSEVGVFDFVVKWLNS
RKKSKEEGIEGRNVGGNKSEAVYLKDILREYKGKLYVPEQVFNTELSEEEEFDRSLEALPKMSFEDFVKALESDKVKLLTSKESIATSFGNRFRDFIVDLKEIPGEKSLQ
RTKWALRLDESEARTVLEQYTGPQYQIETHTSLGSLARD

PI0015628 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome