; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0015931 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0015931
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptiontetrapyrrole-binding protein, chloroplastic
Genome locationchr03:19694423..19695478
RNA-Seq ExpressionPI0015931
SyntenyPI0015931
Gene Ontology termsGO:0010019 - chloroplast-nucleus signaling pathway (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0046906 - tetrapyrrole binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008629 - GUN4-like
IPR037215 - GUN4-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140886.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis sativus]3.0e-12393.08Show/hide
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XP_008445737.1 PREDICTED: tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis melo]2.1e-12996.89Show/hide
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XP_022953248.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]4.3e-10680.93Show/hide
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XP_023547651.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-10681.15Show/hide
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XP_038884158.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Benincasa hispida]1.2e-12191.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD2 GUN4 domain-containing protein1.4e-12393.08Show/hide
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A0A1S3BE43 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic1.0e-12996.89Show/hide
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A0A5A7SPC7 Tetrapyrrole-binding protein1.0e-12996.89Show/hide
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A0A6J1GMW2 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like2.1e-10680.93Show/hide
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A0A6J1JPI7 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like6.1e-10680.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O19887 Uncharacterized protein ycf534.4e-2133.8Show/hide
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        ++ L+ LL+A +F +A++ T+++L+ LAG+ + +R ++YF++V  I  + +  ++ LW+ +S G FG+S+QK+I+  VNK++ K + K+GW+        
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Query:  QYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGIQLMSNILNH
           +  +P EF+W +    P GHLPL N LRG+ ++  I ++
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P51202 Uncharacterized protein ycf536.2e-2338.16Show/hide
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        ++  + + +L  LL   +   AD+ T++ LI LAG     R ++YF++++ I  EDL+ ID LW  HS GKFG+ VQ+QI+  + K++ + + K+GW   
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           EI +   R +P EF W  T   P+GHLPL N LRG+Q++S + +H A++
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P72583 Ycf53-like protein7.3e-2439.62Show/hide
Query:  GSFSLSSDTSSAISFDELDRLLAAKDFRQADEETRRLLIALAGDGALKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKQIFEKVNKDFTKLF
        G F L S  +  I +  L   L ++DF  ADE TR  L  LAG GA +R ++YF+EV+   A DL  I+ LW  HS+G FG+SVQ++++    K+FTKL+
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Query:  MKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGIQLMSNILNHPAF
         K+GW            +  +P  F W+L+   P+GHLPL N LRG+++  ++  HP +
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Q1XDT5 Uncharacterized protein ycf531.0e-2540.79Show/hide
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        ++  +++ +L  LL  +D  +AD+ T++ LI LAG  A  R ++YF++++ I A+DL+ ID LW  HS GKFG  VQ+QI+  V KD+ K + K+GW   
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Query:  LDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGIQLMSNILNHPAFE
           E+++   R +P EF W      P GHLPL N LRG+Q++S +  H A+E
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Q9LX31 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic2.8e-5550Show/hide
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        HS PS  H      R NL   S+   ++L LK PTS A  +   +A+++S S  A  + S ++ ++    +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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        ++G+ A+KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPL
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        TNALRG QL+  +L+HPAF   A +  GE +   +    + K    +   +R+FK +YSF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G59400.1 enzyme binding;tetrapyrrole binding2.0e-5650Show/hide
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        HS PS  H      R NL   S+   ++L LK PTS A  +   +A+++S S  A  + S ++ ++    +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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Query:  LAGDGALKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKQIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPL
        ++G+ A+KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPL
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        TNALRG QL+  +L+HPAF   A +  GE +   +    + K    +   +R+FK +YSF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGCCACTCTCTCCGCCATCCTCAACGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTACTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACC
AACTTCCACCGCCGCCGTCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCTCTT
TCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGCCGCCAAAGACTTCCGACAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTCGCCGGCGACGGCGCCCTGAAAAGAGGGTAC
GTCTATTTCTCCGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATCTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAAACAAAT
TTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTATGAAACTTGGGTGGATGAAGAAGCTGGATACGGAAATTGAGCAGTACAATTACAGGGCATTTCCGACGGAGT
TTATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCTGAAGGGCATCTGCCATTGACGAATGCTTTGAGAGGGATACAGTTAATGAGCAATATTTTGAACCATCCGGCATTTGAGGTG
GACGCCATTGAAGAGAAAGGGGAAGAAAAAATTGCAGGGGATGAAAATGGAGGATTGAAGAAGGGATTGAAGTCGATTACTGAGAGGCTTTTCAAAAGGGATTATAGCTT
TTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTCAATCAAAATTCTCTCAAAACCCCTCTTTTTCACATTTTCAATTTTCATTAACTTTCTCTCTCTCTCACTCTCTCTCCCCCATGGCAGCTTCCCACTCTCTCCCATC
TCTCCGCCACTCTCTCCGCCATCCTCAACGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTACTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACCAACTTCCACCGCCGCCGTCACCACCA
CCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCTCTTTCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGCC
GCCAAAGACTTCCGACAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTCGCCGGCGACGGCGCCCTGAAAAGAGGGTACGTCTATTTCTCCGAAGTTCAATTCAT
TGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATCTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAAACAAATTTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCA
CGAAATTGTTTATGAAACTTGGGTGGATGAAGAAGCTGGATACGGAAATTGAGCAGTACAATTACAGGGCATTTCCGACGGAGTTTATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACG
CCTGAAGGGCATCTGCCATTGACGAATGCTTTGAGAGGGATACAGTTAATGAGCAATATTTTGAACCATCCGGCATTTGAGGTGGACGCCATTGAAGAGAAAGGGGAAGA
AAAAATTGCAGGGGATGAAAATGGAGGATTGAAGAAGGGATTGAAGTCGATTACTGAGAGGCTTTTCAAAAGGGATTATAGCTTTTGAAATTGGGGATTTTGGAGAGTAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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