; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0015995 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0015995
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionprotein SRC1
Genome locationchr04:7847560..7848944
RNA-Seq ExpressionPI0015995
SyntenyPI0015995
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR039285 - Dehydrin HIRD11-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596975.1 Protein SRC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-2274.07Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGD-HDEKGEKKKKKE-KKKGEHGHKHEGG-D
        M+G +EKIGEKLHIGGDHKGE    HKGEHH+  K EH  E KKH +K EHHGEGHKEG+++KIKDKIHGD HD+KGEKKKKKE KKKGEH   HEGG  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGD-HDEKGEKKKKKE-KKKGEHGHKHEGG-D

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

XP_008443295.1 PREDICTED: protein SRC1 [Cucumis melo]3.1e-3484.26Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIH---GDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD
        MSGFIEKIGEKLHIGGD        HKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGII+KIKDKIH   G HDEKGEKKKK++KKKGEHGH+H GGD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIH---GDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

XP_011652200.1 protein SRC1 [Cucumis sativus]8.9e-3486.11Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEG-HKEGIIDKIKDKIHG--DHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGE    HKGEHHDEHKKH   EEHHGEG HKEGI+DKIKDKIHG   H+EKGEKKKK++KKKGEHGHKHEGGD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEG-HKEGIIDKIKDKIHG--DHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

XP_022942109.1 protein SRC1-like [Cucurbita moschata]2.7e-2274.07Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGD-HDEKGEKKKKKE-KKKGEHGHKHEGG-D
        M+G +EKIGEKLHIGGDHKGE    HKGEHH+  K EH    KKH +K EHHGEGHKEG+++KIKDKIHGD HDEKGEKKKKKE KKKGEH   HEGG  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGD-HDEKGEKKKKKE-KKKGEHGHKHEGG-D

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

XP_038903205.1 protein SRC1 [Benincasa hispida]2.7e-3079.63Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKK---KKKEKKKGEHGHKHEGGD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDH       +KGEHHD HKGEHHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+I+KIKDKIHGDHDEKGEKK   KK++KKKGEH H H+GG 
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKK---KKKEKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0B2SHK1 Uncharacterized protein4.2e-2167.96Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGDSSS
        MSG I KI E LH+GG  K EH   H GEH   HKGEHH EHK   K E+HHGE HKEG++DKIKDKIHGD  +KGEKKKKK+KKK EHGH H G  SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGDSSS

Query:  DSD
        DSD
Subjt:  DSD

A0A0R0FQD3 Uncharacterized protein4.2e-2167.96Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGDSSS
        MSG I KI E LH+GG  K EH   H GEH   HKGEHH EHK   K E+HHGE HKEG++DKIKDKIHGD  +KGEKKKKK+KKK EHGH H G  SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGDSSS

Query:  DSD
        DSD
Subjt:  DSD

A0A1S3B8E4 protein SRC11.5e-3484.26Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIH---GDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD
        MSGFIEKIGEKLHIGGD        HKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGII+KIKDKIH   G HDEKGEKKKK++KKKGEHGH+H GGD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIH---GDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

A0A5A7UF86 Zinc transporter ZIP61.5e-3484.26Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIH---GDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD
        MSGFIEKIGEKLHIGGD        HKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGII+KIKDKIH   G HDEKGEKKKK++KKKGEHGH+H GGD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIH---GDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

A0A6J1FQD3 protein SRC1-like1.3e-2274.07Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGD-HDEKGEKKKKKE-KKKGEHGHKHEGG-D
        M+G +EKIGEKLHIGGDHKGE    HKGEHH+  K EH    KKH +K EHHGEGHKEG+++KIKDKIHGD HDEKGEKKKKKE KKKGEH   HEGG  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGD-HDEKGEKKKKKE-KKKGEHGHKHEGG-D

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04132 Protein SRC11.1e-2367.96Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGDSSS
        MSG I KI E LH+GG  K EH   H GEH   HKGEHH EHK   K E+HHGE HKEG++DKIKDKIHGD  +KGEKKKKK+KKK EHGH H G  SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGDSSS

Query:  DSD
        DSD
Subjt:  DSD

Q9SLJ2 Dehydrin HIRD113.0e-0849.12Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHG----DHD-----EKGEKKKKKEKKKGEHGH
        M+G I KIG+ LHIGG +K       +GEH      +  +EHKKH   +EH    HKEGI+DKIKDKIHG     HD       GEKKKKK+KK+ +H  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHG----DHD-----EKGEKKKKKEKKKGEHGH

Query:  KHEGGDSSSDSDSD
         H+ G  SS SDSD
Subjt:  KHEGGDSSSDSDSD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54410.1 dehydrin family protein2.1e-0949.12Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHG----DHD-----EKGEKKKKKEKKKGEHGH
        M+G I KIG+ LHIGG +K       +GEH      +  +EHKKH   +EH    HKEGI+DKIKDKIHG     HD       GEKKKKK+KK+ +H  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHG----DHD-----EKGEKKKKKEKKKGEHGH

Query:  KHEGGDSSSDSDSD
         H+ G  SS SDSD
Subjt:  KHEGGDSSSDSDSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGGATTCATCGAGAAAATCGGCGAGAAGCTCCACATTGGAGGCGATCACAAGGGAGAGCATCACGACGCTCACAAAGGCGAGCACCACGATGCCCACAAAGGTGA
GCATCACGATGAACACAAGAAGCACGAGAAGAAAGAGGAGCACCATGGAGAAGGGCACAAGGAAGGGATAATTGACAAGATCAAGGATAAGATCCATGGCGATCATGATG
AGAAAGGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGCACGGCCACAAACACGAGGGCGGAGATAGCAGCAGCGATAGCGATAGCGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGAAAACAAAAAAAAACGTAAAAATAGAATTAAATAGTAACTAAAAAAAAAGACGTGGTGGAGAGCGCGTGACACGTGGTGTTTCCGCGTAAACGAATCACAAAAAAGGA
TAAAAAAAAAACGCAATTATTAAAGCAATAAGATAACGTCAATCGAAATCAACGGATATATTTTGGATAAACTGAATTTATTCGTTTCAATTCACCTTTCCCCTCCCCTC
CCCTCCCCTCCCCTCCCCATCTATAAATTCCCCTTCTTTCCTTCCCCATTTTCCACAAACACACATCCTCAAAATCCATTCAGATTCAACCAAATTCATCATCAAAATAT
GTCGGGATTCATCGAGAAAATCGGCGAGAAGCTCCACATTGGAGGCGATCACAAGGGAGAGCATCACGACGCTCACAAAGGCGAGCACCACGATGCCCACAAAGGTGAGC
ATCACGATGAACACAAGAAGCACGAGAAGAAAGAGGAGCACCATGGAGAAGGGCACAAGGAAGGGATAATTGACAAGATCAAGGATAAGATCCATGGCGATCATGATGAG
AAAGGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGCACGGCCACAAACACGAGGGCGGAGATAGCAGCAGCGATAGCGATAGCGATTGATTAGATCAGAATCA
TTGGAGGTAGATGGTGTTCCGATGGCGTGTTGTGTGGTTAATAAACTCACTCTTTTGGTTTAATCCCTCTGTTTCTGATCTTTGTTTTTCTATCAGTGTTTTTGTTTTTA
ATGTCGTAAGATGCTGTATTGTATGTGTGGTGTATAATAAAGATTAAGAGATGTTAAATGATCTTTACTAATTTTACTTTCAACAACCAAAATTTATGTTTTGTTATTAA
TCTCTCTCTCATCTTACCTTCAATTAGGGAAGAAGATCGGAAAATCACTTTTAAGTTTACTTGGAGAAACAAGAAAAATGCATAAAAATTGGTGTCCCACAAAGAAAAGA
AGTACTAAAAGGTCATTTGTTGGGACTCTAAAAAAAATTATCAAAATAGTTTCATCATTCAATTGTTCACAATTTAAAATTTTTTAGTCCAATGTGGACCTTCAGCCTCC
CATGAAAATTCTGAATGTTGATATAAATTTGTATTTTCACCAAAATTTTAATTTAAATAGAATGGACAAAATTTAAAATATGAAGTAAGTTTGTAGATTCTCAACGATCC
ATTGTGACAAATGGGTTCAATGATTTTTCTAAAAAAAAAAGAAATAAATAACCTTAAATTTCACTTTTCTTTGGAAAGCTTTAAATTTTTAAATATCTGACATAAATGAA
ACTGTCTCCTAAACATATTGAGAATGAAGTTTCCACCAAAGAAAATTAATTTGTATTCTATTTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIDKIKDKIHGDHDEKGEKKKKKEKKKGEHGHKHEGGDSSSDSDSD