; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016031 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016031
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionExtensin
Genome locationchr11:1577875..1579964
RNA-Seq ExpressionPI0016031
SyntenyPI0016031
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-20296.2Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]5.1e-20796.73Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.9e-17679.62Show/hide
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]5.5e-19392.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein2.5e-20796.73Show/hide
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A0A1S3CB81 extensin5.3e-20295.95Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin1.1e-20296.2Show/hide
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A0A6J1GPH0 formin-2-like7.2e-17579.15Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like1.4e-17078.57Show/hide
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        PLPPFPSF         PLPPLPPLPPVP+ P P+CP PPSLPFPFPPLPP FPS  SP   S PPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPP     P  P
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        RTWIPH PPSPPQG QNQKP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 39.9e-0436.89Show/hide
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        LS  P+      CG   S +  +  PL       P      F  P +L  P PP PP P +  PP PP       PP PP PP PP  + P P  P PP 
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Query:  LPFPFPPLPPLFPSPPSPSQSSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHLPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSP
         P  + P PP  P PP P  S  PPPPPP     P  + P   P    PPPP SP P  +   R   P  PP   PPPP F P  P  +  + PP   S 
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Query:  PPAFNPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP
        PP  +P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.5e-3649.65Show/hide
Query:  ITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMTFSANRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVP
        ITI+G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E +TFSANRTT+++G+Y++ I S+D   C D  ++ S CQASLIG    S   CN+P
Subjt:  ITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMTFSANRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVP

Query:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK
        G RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein7.0e-0536.89Show/hide
Query:  LSYRPMKKNESLCG---SKKEKIPDPLTSSKFFLP------FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPP------LPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS
        LS  P+      CG   S +  +  PL       P      F  P +L  P PP PP P +  PP PP       PP PP PP PP  + P P  P PP 
Subjt:  LSYRPMKKNESLCG---SKKEKIPDPLTSSKFFLP------FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPP------LPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS

Query:  LPFPFPPLPPLFPSPPSPSQSSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHLPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSP
         P  + P PP  P PP P  S  PPPPPP     P  + P   P    PPPP SP P  +   R   P  PP   PPPP F P  P  +  + PP   S 
Subjt:  LPFPFPPLPPLFPSPPSPSQSSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHLPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSP

Query:  PPAFNPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP
        PP  +P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  PPAFNPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein7.8e-0440.08Show/hide
Query:  PPYSLPFP-----FPPLPPFPSFPLPPLP-PLPPLPPLPPLP------PVPFFPLP--TCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP--SPSQSSTPP--PPPPFS
        PP ++P P      P  PP PS P P  P P PP P  PP P        P  P P  T P+PPS   P PPLPP+ PSPP   P+ SS PP  P P +S
Subjt:  PPYSLPFP-----FPPLPPFPSFPLPPLP-PLPPLPPLPPLP------PVPFFPLP--TCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP--SPSQSSTPP--PPPPFS

Query:  LSDPRTWIPYVSPF---SPPPPPPSSPPPFSLS------DPRTWIPHLPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSP---SPPPA---FNPRDPRTWIPRI
           P T  P   PF   SPP PPP  PP FS S       P+T+ P  PP  PPPP  + P  P    P+ PP SP   +PPP+   + P  P+   P  
Subjt:  LSDPRTWIPYVSPF---SPPPPPPSSPPPFSLS------DPRTWIPHLPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSP---SPPPA---FNPRDPRTWIPRI

Query:  P-PFF-----PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP
        P P++     PPPPP + L  P     ++ P PP  P +  P
Subjt:  P-PFF-----PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.3e-4743Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFT-SLFGR------TAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMTFSANRTTDKYGVYRLEI
        + LL LL L S  T    GR         +L   +RIT+VG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  S NRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFT-SLFGR------TAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMTFSANRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKIPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS+    C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+       K EK+      SKFF P
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKIPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQSSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSP
        +  PY  P+P+              P LPPLP LPP P  PF         PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  F P
Subjt:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQSSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.4e-3747.62Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMTFSANRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN
        I LLLLL L S   SL  + + A  +  +IT++G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E +TFSANRTT++ G+Y+L+I S++G+ 
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMTFSANRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN

Query:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG
        C       ++ + CQASLIG S + CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Subjt:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTCTTATGGATCCCACAATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTGTTTTAACATCTTTCTTCACTAGTTTGTTTGGCCGAACAGCTGAAGCTCTAACGTCGGTCACTCGAAT
CACAATAGTGGGCGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGGGTGGATGTTCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAA
TTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGACCTTCTCTGCCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGAT
GGAATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCAGAAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAAATATCAGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTATGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTATAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTGTGTGGGAGTAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCT
CCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTTCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTACCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCA
CTTCCTCCACTGCCTCCACTGCCCCCTGTTCCATTTTTTCCTCTCCCTACTTGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCTTTATTTCCTTC
ACCTCCAAGTCCATCTCAATCATCTACACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTCCACCGCCTC
CGCCATCATCACCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATCTTCCTCCACTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGA
ACCTGGATTCCCAATATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTAATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCGTATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACC
TCCATCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTCTTATGGATCCCACAATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTGTTTTAACATCTTTCTTCACTAGTTTGTTTGGCCGAACAGCTGAAGCTCTAACGTCGGTCACTCGAAT
CACAATAGTGGGCGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGGGTGGATGTTCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAA
TTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGACCTTCTCTGCCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGAT
GGAATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCAGAAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAAATATCAGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTATGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTATAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTGTGTGGGAGTAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCT
CCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTTCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTACCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCA
CTTCCTCCACTGCCTCCACTGCCCCCTGTTCCATTTTTTCCTCTCCCTACTTGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCTTTATTTCCTTC
ACCTCCAAGTCCATCTCAATCATCTACACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTCCACCGCCTC
CGCCATCATCACCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATCTTCCTCCACTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGA
ACCTGGATTCCCAATATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTAATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCGTATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACC
TCCATCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAATATTGTGCTTTGTTTTCCCTCC
TCTTTACCACTACAAATTTTCTTTCAATATGATATTGTTTGATGTGTGCTTATGTATTGTTCCGGTGCCCTGTCCATTCAGGCAAAACAACGAACACCTTGTGTGCCAAT
ATAATTCATGTACAGAAACCAAAAGGGGATTTGTCTGTTAATATGATAAATCAAGAAGCTGGATATCATCAATGTATTATTTCATTAATCTTCAAATTTGCAAGAAAAGT
TTACATTCTTAAGTCTTTAGAGAATGATACTAAAAGGAAAAGAAAGAAACTCATAGACCGTCAGTACCTTGCTTCCGGATAATAACACCGCAACAAAACAACCCCAAAAG
AAAAAATTAGAGAAGGAATTGAATTGCCTTCAATACAGAATACCTTTTCTACCTAATTTGAGCGGTGGCAATGGCGAATGAGATCATTCACTTCTTGTTTTTTTTTCCTT
CTTTTTCTGATTCTGATGCTTTTTTGATGTGATAATAAGAATTCATGATCCCAAACTAAATTCCCTTATAAAGTTGGTCTTCTAGCCTCTTCATGACTTCATCTATCTTC
TAAATGGATCACATTCTTCTCTGTAGAAATACAACTACTCCTCATCCAGCTCAACAGCCTAAAAAAGCAATCAATTGAAAAAAAGAATGGGATTCAAACCTATGGAGTTG
ATGGATGTAAGATTGTTGTTCTCTTCATTTAACAACCAATTAGACTTCACACTTATCAGACTCAATATATAGTTATTGCAGTTTGTAGACTCTTTATCCACTCCTTATAT
GAAACTCTTGAAACATACAACAATTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLMDPTISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMTFSANRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVD
GMTMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPP
LPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQSSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHLPPLSPPPPPAFDPRDPR
TWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP