; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016040 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016040
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr08:1521766..1522068
RNA-Seq ExpressionPI0016040
SyntenyPI0016040
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TXW1 Retrotransposon protein2.9e-4084Show/hide
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A0A5A7U9H2 Retrotransposon protein1.7e-4084Show/hide
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A0A5A7UGH9 Retrotransposon protein2.9e-4084Show/hide
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A0A5D3BDX0 Retrotransposon protein2.9e-4084Show/hide
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A0A5D3DG22 Retrotransposon protein2.9e-4083Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G19120.1 PIF / Ping-Pong family of plant transposases2.6e-0450Show/hide
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AT5G12010.1 unknown protein2.0e-0437.7Show/hide
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AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)5.5e-0730.43Show/hide
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AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)1.0e-0539.22Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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