; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016078 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016078
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptiontranscription factor MYB44-like
Genome locationchr03:1555371..1556177
RNA-Seq ExpressionPI0016078
SyntenyPI0016078
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
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InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033571.1 transcription factor MYB44-like [Cucumis melo var. makuwa]9.1e-12797.91Show/hide
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KAE8652097.1 hypothetical protein Csa_022277 [Cucumis sativus]1.0e-12296.68Show/hide
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XP_008444647.1 PREDICTED: transcription factor MYB44-like [Cucumis melo]2.4e-12797.9Show/hide
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XP_038885826.1 transcription factor MYB25-like [Benincasa hispida]3.4e-11392.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKY3 Uncharacterized protein5.1e-12396.68Show/hide
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A0A1S3BAB9 transcription factor MYB44-like1.2e-12797.9Show/hide
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A0A5A7SVX1 Transcription factor MYB44-like4.4e-12797.91Show/hide
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A0A6J1CRX2 transcription factor MYB1-like6.9e-10485Show/hide
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A0A6J1KMR9 transcription factor MYB44-like5.6e-9881.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04192 Transcription factor MYB252.9e-3544.57Show/hide
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O23160 Transcription factor MYB731.0e-4373.64Show/hide
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Q42575 Transcription factor MYB12.0e-3966.07Show/hide
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Q9FDW1 Transcription factor MYB443.8e-4376.92Show/hide
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Q9SN12 Transcription factor MYB777.7e-4475.96Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23290.1 myb domain protein 702.1e-4471.43Show/hide
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AT3G09230.1 myb domain protein 11.4e-4066.07Show/hide
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AT3G50060.1 myb domain protein 775.5e-4575.96Show/hide
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AT4G37260.1 myb domain protein 737.1e-4573.64Show/hide
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AT5G67300.1 myb domain protein r12.7e-4476.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGAGAAGTTCGTCTTCTAATTCCTCCTCCTCCGATTCCACGTCATCTGATTCTTCCTTCTCCGGCAAGGGATTGCGACGCCCGGAGAAGATTAAAGGGCCATGGAG
TGCGGAGGAGGATCGGATTTTAACTCAGCTTGTGGATCGTTATGGGGCGAGAAATTGGTCGTTGATTAGCCGTTACATTAAAGGCCGGTCTGGAAAATCGTGCCGGCTTC
GATGGTGTAACCAGTTGAGTCCGAATGTTGAGCATCGCCCGTTTTCTCCCACGGAGGATGAGACGATTTTAGCGGCTCATGCCCGGTTTGGGAACCGGTGGGCCACCATT
GCTCGGTTGCTTCCCGGTCGGACCGATAATGCCGTTAAGAATCACTGGAACTCAACGCTAAAACGACGGGCGAGGGAACAACAGCAGCAACAATTAGTAATGGACGGAAT
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AGGGAGGTGAGGGAATACATGACGACGACGTTTATGGAAAATCCGGAGTTTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTCATCCATCTCTCACTCCTCTTTTCACACTCTCCACATAATACCCCTTTTCTCTTTTTTCCCATTTCTGTTTTAATTTGCAGTTACAATGATGAGAAGTTCGTCTTC
TAATTCCTCCTCCTCCGATTCCACGTCATCTGATTCTTCCTTCTCCGGCAAGGGATTGCGACGCCCGGAGAAGATTAAAGGGCCATGGAGTGCGGAGGAGGATCGGATTT
TAACTCAGCTTGTGGATCGTTATGGGGCGAGAAATTGGTCGTTGATTAGCCGTTACATTAAAGGCCGGTCTGGAAAATCGTGCCGGCTTCGATGGTGTAACCAGTTGAGT
CCGAATGTTGAGCATCGCCCGTTTTCTCCCACGGAGGATGAGACGATTTTAGCGGCTCATGCCCGGTTTGGGAACCGGTGGGCCACCATTGCTCGGTTGCTTCCCGGTCG
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GCATTAATAATAATAATAATGCTGTGAACATTGCTAGTGATTTGAAGCTGTCCGTGTCCGTACCTCTGGAGGACGATCCATTGACCGCGTTGACTCTAGCGCCGCCGGGA
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GACGACGACGTTTATGGAAAATCCGGAGTTTCACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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