; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016294 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016294
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionreceptor-like protein 12
Genome locationchr01:3980086..3980502
RNA-Seq ExpressionPI0016294
SyntenyPI0016294
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001611 - Leucine-rich repeat
IPR032675 - Leucine-rich repeat domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0059199.1 receptor-like protein 12 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-3691.3Show/hide
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KAG6572227.1 Receptor-like protein 9DC3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-5990.91Show/hide
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XP_022953006.1 receptor-like protein 12 [Cucurbita moschata]4.7e-5990.91Show/hide
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XP_022968886.1 receptor-like protein 12 [Cucurbita maxima]3.1e-5889.39Show/hide
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XP_023511641.1 receptor-like protein 12 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-5890.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V066 Receptor-like protein 127.2e-3791.3Show/hide
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A0A5D3E634 Receptor-like protein 123.1e-3259.54Show/hide
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A0A6J1C3L9 receptor-like protein 121.0e-3562.99Show/hide
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A0A6J1GLT5 receptor-like protein 122.3e-5990.91Show/hide
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A0A6J1HW40 receptor-like protein 121.5e-5889.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4J8G2 Receptor-like protein 333.3e-2350.45Show/hide
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Q9LJW7 Receptor-like protein 439.7e-2350.46Show/hide
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Q9M9X0 Receptor-like protein 322.5e-2353.47Show/hide
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Q9ZUK3 Receptor-like protein 192.3e-2452.25Show/hide
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Q9ZUK7 Receptor-like protein 181.3e-2250.45Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G15080.1 receptor like protein 191.6e-2552.25Show/hide
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AT2G15080.2 receptor like protein 191.6e-2552.25Show/hide
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AT3G05650.1 receptor like protein 321.8e-2453.47Show/hide
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AT3G05660.1 receptor like protein 332.4e-2450.45Show/hide
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AT3G28890.1 receptor like protein 436.9e-2450.46Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATAATCAATAAAGGCTATGAAAGAAGCTTCTCCAAGATTCAAGAGGCTTTCACCAGTATGGATCTCTCAAGCAACAGATTCGAAGGCGAAATCCCAGATGAAATCGGCG
AATTAAAGGGTCTACATTCTCTCAATCTGTCTCACAATGCACTTAGAGGTCGAATCCCACCGTCGTTAGGGAACATAACACAGCTTGAATCTTTGGATCTTTCAAACAAC
AAGCTTTCAGGGGAGATTCCAGAAACATTGGCCCAGCTCACTTTCCTTGCAACTTTTAATGTCTCTCAAATAAACTCTCGGGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGATTATTACTATCCCAACTACCAAATCAACATATATGAAAGCAAATAGTACATGTTTCTTTTTTGCAAATTATGCTTGGGCACTTGAGTATTATTACTCGATCAC
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AAGCTTTCAGGGGAGATTCCAGAAACATTGGCCCAGCTCACTTTCCTTGCAACTTTTAATGTCTCTCAAATAAACTCTCGGGTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKIITIPTTKSTYMKANSTCFFFANYAWALEYYYSITIINKGYERSFSKIQEAFTSMDLSSNRFEGEIPDEIGELKGLHSLNLSHNALRGRIPPSLGNITQLESLDLSNN
KLSGEIPETLAQLTFLATFNVSQINSRV