; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016630 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016630
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionpectinesterase 3
Genome locationchr12:392164..393241
RNA-Seq ExpressionPI0016630
SyntenyPI0016630
Gene Ontology termsGO:0043086 - negative regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0030599 - pectinesterase activity (molecular function)
GO:0046910 - pectinesterase inhibitor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006501 - Pectinesterase inhibitor domain
IPR035513 - Invertase/pectin methylesterase inhibitor domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652503.1 hypothetical protein Csa_013672 [Cucumis sativus]9.4e-11189.29Show/hide
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XP_008440324.1 PREDICTED: pectinesterase 3 [Cucumis melo]3.2e-11189.68Show/hide
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XP_023519544.1 pectinesterase 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.4e-9076.42Show/hide
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        G+EEMDSTSF EVK RM++S EYVSN LAIVANIHVIL+KF MPLH
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XP_038895980.1 pectinesterase 3 [Benincasa hispida]1.9e-9579.92Show/hide
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        EEMDSTSF+EVK RMK+SIEYVSNSLAIVANIHVIL  F+MPLH
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVF4 PMEI domain-containing protein4.6e-11189.29Show/hide
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A0A1S3B0W1 pectinesterase 31.6e-11189.68Show/hide
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A0A5A7T3U1 Pectinesterase 31.6e-11189.68Show/hide
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A0A6J1EDL6 pectinesterase 35.8e-9076.42Show/hide
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A0A6J1KR63 pectinesterase 37.6e-9075.1Show/hide
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         SLNSSP+PDPELIL LSLQVSLNELSN+SR L+TL A+G+   GG ALKDC+SQIEDAIS VN+S AEM+ G GEKTLTESKIGNIQTWMSSAMT +ES
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        CLDG+EEMDSTSF EVK RM++S EYVSN LAIVANIHVIL+KF MPLH
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q43111 Pectinesterase 32.4e-3234.24Show/hide
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        MD I   KGYGK+  L+   Q     K   ++            A+S+++L A+II+ + G  IHN  +++  SS+S        A ++  VC+ TRYP+
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        SCF+SI SL  S   DPEL+  LSL+V+++ELS+  S+     + +     A+  C S   DA+ ++N+S++ + G    +  + + + N++TW+S+A+T
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        ++++CLD V E++ST    + +E++  M+ S E+ SNSLAIV  I  +L +F  P+H
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Q43867 Pectinesterase 11.1e-2933.59Show/hide
Query:  MDQINGLKGYGKLTHLDLEHQIPPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIH----NSTADNKSSSNSAHTISIVCNVTRYPNSCFT
        MD +N  KGYGK   +D    +    K   ++            +IS ++L A+II+ ++   +H     ST         + ++  +C+VTR+P SC +
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Query:  SIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETLDAEGEG---GAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNE
        SI  L SS   DPE +  LSL+V ++EL ++S   E L  E E     +AL+ C   IEDA+ ++N++V+ +   E +KTL+ SKI +++TW+S+ +T+ 
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Query:  ESCLDGVEEM--------DSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
        E+C D ++E+        +ST  + +K  M RS E+ SNSLAIV+ I   L    +P+H
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Q8GX86 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 216.1e-1223.15Show/hide
Query:  ISALLLTALIISLIIGAYIHNSTADNKSSSN---SAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLET---LDAEGE
        IS++LL ++++++ +G  ++    D+K  +    S   +  VC  T Y  +C  ++   N     DP  ++  +  V++ ++++ ++  +T   L  +  
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Query:  GGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEEMDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVILDKF
           AL  C+  ++ A+ +++ S  E+  G+ E  L +  + N++ W+S+A+++EE+CL+G +     + E +K+ +K +IE   N LAI++ +   + + 
Subjt:  GGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEEMDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVILDKF

Query:  NMP
         +P
Subjt:  NMP

Q9LUL8 Putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 262.4e-2433.98Show/hide
Query:  MDQINGL-KGYGKLTHLDLEHQIPPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIHNSTADNKSSSNS-------AHTISIVCNVTRYPN
        MD +  + KGYGK   +D    +    K   ++         +   IS  +L A+IIS  +   IH+   ++   + S       A ++  VC+VT YP 
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Query:  SCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNM----SRWLETLDAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSS
        SCF+SI  L  S   DPE+I  LSLQV ++EL+++     +  E  D EG   +AL  C+  ++ AI +VNE+V+ M+  +G+K L  + I ++ TW+S+
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Query:  AMTNEESCLDGVEEMDSTSFE---EVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
        A+T   +CLD ++E+  T+     ++K  M  S E+ SNSLAIVA I   +  F +P+H
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Q9SB38 Pectinesterase inhibitor 45.9e-1529.23Show/hide
Query:  LLTALIISLIIGAYIHNS----TADNKSSSNSAHT--ISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETL-----DAEG
        +L  +++SL +  +I++S    TA     +   HT  +   CN T YP  C+  + S +S+ + DP  +   SL +++    N +  +  L      A+ 
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Query:  EGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEE--MDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVAN
           + LKDC  +++D I ++ ++VAEMK   G    TE  + N++TW+SSA+T+E +C DG EE  ++  + ++VK+ +    +  SN+LA++ +
Subjt:  EGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEE--MDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVAN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53840.1 pectin methylesterase 17.9e-3133.59Show/hide
Query:  MDQINGLKGYGKLTHLDLEHQIPPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIH----NSTADNKSSSNSAHTISIVCNVTRYPNSCFT
        MD +N  KGYGK   +D    +    K   ++            +IS ++L A+II+ ++   +H     ST         + ++  +C+VTR+P SC +
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Query:  SIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETLDAEGEG---GAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNE
        SI  L SS   DPE +  LSL+V ++EL ++S   E L  E E     +AL+ C   IEDA+ ++N++V+ +   E +KTL+ SKI +++TW+S+ +T+ 
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Query:  ESCLDGVEEM--------DSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
        E+C D ++E+        +ST  + +K  M RS E+ SNSLAIV+ I   L    +P+H
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AT2G01610.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein6.5e-1730.73Show/hide
Query:  NKSSSNSAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETL---------DAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNES
        N +++N    I   CN T YP+ CFTS+    S+ Q  P  +  L++ VSL++  + + +L  L         D      A ++DC S +EDA+ ++  S
Subjt:  NKSSSNSAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETL---------DAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNES

Query:  VAEMK------GGEGEKTLTES---KIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEEMDSTSF--EEVKRRMKRSIEYVSNSLAIV
        + +++      GG   +   E+   ++ N+QTWMS+A+T+E++C DG E+MD        V  R++      SN+LA+V
Subjt:  VAEMK------GGEGEKTLTES---KIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEEMDSTSF--EEVKRRMKRSIEYVSNSLAIV

AT3G14300.1 pectinesterase family protein1.7e-2533.98Show/hide
Query:  MDQINGL-KGYGKLTHLDLEHQIPPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIHNSTADNKSSSNS-------AHTISIVCNVTRYPN
        MD +  + KGYGK   +D    +    K   ++         +   IS  +L A+IIS  +   IH+   ++   + S       A ++  VC+VT YP 
Subjt:  MDQINGL-KGYGKLTHLDLEHQIPPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIHNSTADNKSSSNS-------AHTISIVCNVTRYPN

Query:  SCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNM----SRWLETLDAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSS
        SCF+SI  L  S   DPE+I  LSLQV ++EL+++     +  E  D EG   +AL  C+  ++ AI +VNE+V+ M+  +G+K L  + I ++ TW+S+
Subjt:  SCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNM----SRWLETLDAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSS

Query:  AMTNEESCLDGVEEMDSTSFE---EVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
        A+T   +CLD ++E+  T+     ++K  M  S E+ SNSLAIVA I   +  F +P+H
Subjt:  AMTNEESCLDGVEEMDSTSFE---EVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH

AT3G47670.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein5.6e-2937.8Show/hide
Query:  MDQINGLKGYGKLTHLDLEHQI-----PPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIHNSTADNKSSSNSAHTISIVCNVTRYPNSCF
        M+ IN LKGY K++  D E+QI      P  KP+S     +   L    ++ +LLL   +++L  GA+ H+       SS S   +  +C+VTRYP +CF
Subjt:  MDQINGLKGYGKLTHLDLEHQI-----PPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIHNSTADNKSSSNSAHTISIVCNVTRYPNSCF

Query:  TSI-FSLNSSPQP-DPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETLDAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEM---KGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAM
         S+  SLN S    +PE IL LSL+V+  E+SN+S    +++   E  AA+ DC     DA+SQ+N+S+ E+   K   G   LTE  +G+++TW+S+AM
Subjt:  TSI-FSLNSSPQP-DPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETLDAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEM---KGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAM

Query:  TNEESCLDGVEEMDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVIL
        T+ E+C DG+EEM +    E+K++M+ + + +S SLAIV+ +  +L
Subjt:  TNEESCLDGVEEMDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVANIHVIL

AT4G25250.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein4.2e-1629.23Show/hide
Query:  LLTALIISLIIGAYIHNS----TADNKSSSNSAHT--ISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETL-----DAEG
        +L  +++SL +  +I++S    TA     +   HT  +   CN T YP  C+  + S +S+ + DP  +   SL +++    N +  +  L      A+ 
Subjt:  LLTALIISLIIGAYIHNS----TADNKSSSNSAHT--ISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLETL-----DAEG

Query:  EGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEE--MDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVAN
           + LKDC  +++D I ++ ++VAEMK   G    TE  + N++TW+SSA+T+E +C DG EE  ++  + ++VK+ +    +  SN+LA++ +
Subjt:  EGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEE--MDSTSFEEVKRRMKRSIEYVSNSLAIVAN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCAAATCAATGGTCTCAAAGGCTATGGCAAACTCACTCACCTCGACCTCGAACATCAAATTCCTCCACCCTCCAAACCAAACTCCAAAATCCCCAACCACAATTC
TCTCCCACTCCGCTTCGCCGCCGCCATCTCCGCCCTCCTCCTCACCGCTCTAATCATCAGTCTGATCATCGGAGCCTACATCCACAACTCCACCGCCGACAACAAATCAT
CATCCAATTCTGCCCACACAATCAGCATCGTCTGCAACGTAACTCGTTACCCTAATTCCTGCTTCACCTCAATCTTTTCTCTCAATTCCTCTCCTCAACCCGATCCCGAA
CTCATTTTAAACCTCTCTCTCCAAGTTTCCCTGAACGAACTCTCGAATATGTCCCGATGGCTAGAAACCCTAGACGCAGAGGGCGAGGGGGGAGCAGCTTTGAAGGACTG
CCAGAGTCAAATCGAAGACGCAATTAGCCAAGTCAATGAGTCGGTGGCAGAAATGAAAGGCGGCGAAGGGGAGAAGACGTTGACGGAGAGTAAGATCGGGAACATTCAGA
CGTGGATGAGCAGTGCGATGACGAACGAAGAAAGTTGTTTGGATGGAGTGGAGGAGATGGATTCGACGTCGTTTGAAGAGGTGAAGAGGAGGATGAAAAGGTCCATAGAA
TACGTAAGCAACAGCTTGGCCATTGTGGCTAATATCCACGTCATTCTTGACAAATTTAATATGCCACTTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCAACTCAGGCCCAAATCTAACCATCTCATTGGGAACTTAAAAGAAGAAAAAAAAAATTAAATCCCCACGTTGATGAGTAGAATAAATGAAAACGGTGGGTTTATCTTT
GACTTTGACTTTGCCTTCCCCCTTGCAAACTTGGAACTTCCTTCATCCTCTAAATTTGAACAGAAACAGAACAAACACAAAATCAATTTGGTGCAATCATGGATCAAATC
AATGGTCTCAAAGGCTATGGCAAACTCACTCACCTCGACCTCGAACATCAAATTCCTCCACCCTCCAAACCAAACTCCAAAATCCCCAACCACAATTCTCTCCCACTCCG
CTTCGCCGCCGCCATCTCCGCCCTCCTCCTCACCGCTCTAATCATCAGTCTGATCATCGGAGCCTACATCCACAACTCCACCGCCGACAACAAATCATCATCCAATTCTG
CCCACACAATCAGCATCGTCTGCAACGTAACTCGTTACCCTAATTCCTGCTTCACCTCAATCTTTTCTCTCAATTCCTCTCCTCAACCCGATCCCGAACTCATTTTAAAC
CTCTCTCTCCAAGTTTCCCTGAACGAACTCTCGAATATGTCCCGATGGCTAGAAACCCTAGACGCAGAGGGCGAGGGGGGAGCAGCTTTGAAGGACTGCCAGAGTCAAAT
CGAAGACGCAATTAGCCAAGTCAATGAGTCGGTGGCAGAAATGAAAGGCGGCGAAGGGGAGAAGACGTTGACGGAGAGTAAGATCGGGAACATTCAGACGTGGATGAGCA
GTGCGATGACGAACGAAGAAAGTTGTTTGGATGGAGTGGAGGAGATGGATTCGACGTCGTTTGAAGAGGTGAAGAGGAGGATGAAAAGGTCCATAGAATACGTAAGCAAC
AGCTTGGCCATTGTGGCTAATATCCACGTCATTCTTGACAAATTTAATATGCCACTTCACTAAATCAATTTTAAATGTAATGATGTTCAATACAAAAATACGCGTTCTTT
TGTTGGTATTTGGAATTTGTATTTTATTTCAAAATATGTGAGCTTCTGCTTCTCACAATTGCTTAATGTTATCATTTTTTTCTGACCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDQINGLKGYGKLTHLDLEHQIPPPSKPNSKIPNHNSLPLRFAAAISALLLTALIISLIIGAYIHNSTADNKSSSNSAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPE
LILNLSLQVSLNELSNMSRWLETLDAEGEGGAALKDCQSQIEDAISQVNESVAEMKGGEGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLDGVEEMDSTSFEEVKRRMKRSIE
YVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH