; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016731 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016731
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionprotein MET1, chloroplastic
Genome locationchr05:22979650..23000953
RNA-Seq ExpressionPI0016731
SyntenyPI0016731
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001478 - PDZ domain
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR036034 - PDZ superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149641.1 protein MET1, chloroplastic [Cucumis sativus]1.4e-16897.78Show/hide
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XP_008449894.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491636 isoform X1 [Cucumis melo]2.7e-16496.52Show/hide
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XP_022996247.1 protein MET1, chloroplastic [Cucurbita maxima]5.6e-13879.88Show/hide
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XP_023532558.1 protein MET1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-13880.18Show/hide
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XP_038902944.1 protein MET1, chloroplastic [Benincasa hispida]2.6e-15192.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWR6 Uncharacterized protein6.7e-16997.78Show/hide
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A0A1S3BMG9 uncharacterized protein LOC103491636 isoform X11.3e-16496.52Show/hide
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A0A5D3DEH5 Putative tyrosine phosphatase1.3e-16496.52Show/hide
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A0A6J1H5N2 protein MET1, chloroplastic3.0e-13784.57Show/hide
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        INAIKSLFGFK
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A0A6J1K1D9 protein MET1, chloroplastic2.7e-13879.88Show/hide
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        P +L+   +S +   + SSS       SSF LC    SHPKL       HL F+TSFS+ HSLKPS F++RASD +S  D        QPYEEYEVEL+Q
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q94BS2 Protein MET1, chloroplastic8.0e-11167.08Show/hide
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        +Q    N S  T SSF       S   L     S S   +H  K     L+AS+TES  K +   D   ++ YE YE+E++QPYGLKF KGRDGGTYIDA
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        I PGG ADKTG FTVGD+VIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLM+M+KR GK +  GELTEKEIIRAERN+G +S+++REIQ+QN L+ KEQ
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        KA+RE DLR+GL+  KN KYEEALE+FESVLGSKPTP+EASVASYNVACCYS+LNQ++AGLSALE+AL++G+EDFKR+R+DPDL  LR  ++F+PL+K+F
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        DESFINE+AINAIKSLFGF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55480.1 protein containing PDZ domain, a K-box domain, and a TPR region5.7e-11267.08Show/hide
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        +Q    N S  T SSF       S   L     S S   +H  K     L+AS+TES  K +   D   ++ YE YE+E++QPYGLKF KGRDGGTYIDA
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Query:  IAPGGFADKTGLFTVGDKVIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLMKMQKRYGKTDSFGELTEKEIIRAERNSGVVSNKVREIQLQNALRMKEQ
        I PGG ADKTG FTVGD+VIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLM+M+KR GK +  GELTEKEIIRAERN+G +S+++REIQ+QN L+ KEQ
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        KA+RE DLR+GL+  KN KYEEALE+FESVLGSKPTP+EASVASYNVACCYS+LNQ++AGLSALE+AL++G+EDFKR+R+DPDL  LR  ++F+PL+K+F
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Query:  DESFINENAINAIKSLFGF
        DESFINE+AINAIKSLFGF
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AT3G01510.1 like SEX4 17.9e-0526.04Show/hide
Query:  TDSDDPNQQPYEEYEVELQQPYGLKFAKGRDGGTYIDAIAPGGFADKTGLFTVGDKVIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLMKMQKRY
        + S  P +    EY V L++P G++FA   DG  ++ AI  G  A+K  +  VGD +   S   G  +    ++G T   + ++ G   + +++ +
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AT5G17170.1 rubredoxin family protein1.3e-0741.43Show/hide
Query:  EVELQQPYGLKFAKGRDGGTYIDAIAPGGFADKTGLFTVGDKVIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQR
        EVE+ +P GL   + + GG  I  +  GG A K GL + GD+V+ TS+ FG E+WPA + G T   I+ +
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AT5G17170.2 rubredoxin family protein1.3e-0741.43Show/hide
Query:  EVELQQPYGLKFAKGRDGGTYIDAIAPGGFADKTGLFTVGDKVIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQR
        EVE+ +P GL   + + GG  I  +  GG A K GL + GD+V+ TS+ FG E+WPA + G T   I+ +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAATAAGAATGAAAAGTGGGACAGCTCCCCATTATCTCTATTCTTCACACTTACTTCCCAAAATTGCCCTCCTAACCATTCCTCTTCCACTTCCTCTTCCTTCAC
TCTATGCTCTCGATCCCATTCCCATCCCAAACTCTCTCATCTACCTTTCTCCACTTCCTTTTCAACTTCTCATTCCCTTAAACCCTCACCTTTCATCCTCAGAGCATCCG
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ATCAAGTCGCTATTCGGCTTCAAAACATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AAAATACTTTTGGCTGCACTTAGTATTTTATTTCTCTATTATGCTTCCGCTAGTTGTTAAGTATAAGGGTCAGCAATTATCGTTGAGAAGAGGATGATATTAGTTGACTT
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TAAATATATTTCTTTAAAATTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RRENDLRQGLRLYKNAKYEEALEKFESVLGSKPTPDEASVASYNVACCYSQLNQLKAGLSALEDALEAGFEDFKRVRTDPDLSNLRTLEEFEPLVKRFDESFINENAINA
IKSLFGFKT