; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016767 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016767
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description30S ribosomal protein S11, chloroplastic
Genome locationtig00003626:1023923..1024339
RNA-Seq ExpressionPI0016767
SyntenyPI0016767
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR019981 - Ribosomal protein S11, bacterial-type
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AHM89651.1 ribosomal protein S11 [Lagenaria siceraria]8.0e-6795.65Show/hide
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YP_009751771.1 ribosomal protein S11 [Herpetospermum pedunculosum]6.2e-6796.38Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6B9M5Z9 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.0e-6796.38Show/hide
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A0A6H0EQE1 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.0e-6795.65Show/hide
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A0A6H0ES45 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.0e-6796.38Show/hide
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A0A6H0EWD9 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.0e-6795.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0ZZ68 30S ribosomal protein S11, chloroplastic9.9e-6892.75Show/hide
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Q0G9S9 30S ribosomal protein S11, chloroplastic8.4e-6791.3Show/hide
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Q0ZIY6 30S ribosomal protein S11, chloroplastic7.6e-6892.75Show/hide
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Q2L937 30S ribosomal protein S11, chloroplastic9.9e-6892.75Show/hide
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Q4VZK2 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.1e-6994.93Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31817.1 Ribosomal L18p/L5e family protein3.1e-0832.5Show/hide
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AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein5.6e-1033.63Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein5.6e-1033.63Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein4.3e-1034.51Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S112.1e-6589.86Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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