; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016912 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016912
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationchr03:7553150..7556162
RNA-Seq ExpressionPI0016912
SyntenyPI0016912
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.3e-4589.11Show/hide
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XP_011649873.1 uncharacterized protein LOC101216688 [Cucumis sativus]4.4e-4693.07Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]1.8e-4488.12Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-4489.11Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein2.1e-4693.07Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial6.6e-4896.04Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S146.6e-4896.04Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067332.0e-4488.12Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449968.9e-4588.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1Z780 30S ribosomal protein S149.6e-2052.17Show/hide
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P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.4e-3368.37Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.7e-3569.39Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial6.0e-3067.02Show/hide
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        I D+ RR L AK+E+KR  +KAIC D +LPN +R E+ +KLSKLPRNSS TR+RNRCIFTGRPR VY+LFR+SRIVFRELA+KG ++G+ KS W
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.9e-3266.33Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S144.5e-3364.65Show/hide
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        G KRN  D+ RR LAA+FE++R L+KA C DP LP+++R+++RYKLSKLPRNS+F R+RNRC+FTGR R V  LFR+SRIVFR LA+KG +MG+ KSSW
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S141.0e-0840Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAACGATGTTCGTGAGGAGCATCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCAAGAAATAGTTCGTTCACTCGATTGAGGAATCGCTGCATTTTTACCGGTCGACCTAGGGGTGTCT
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ACGCTTGAAGGTCAAGCGAAATGTCGGGGGACAAGCGAAACATTCTTGATAATTATCGCCGACAGCTTGCTGCCAAGTTTGAGGTGAAGCGGAATCTTTTCAAAGCCATT
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TGGTACGAAATTATTCTTCACTATACTCTTATCCAAAAACAAAAGTTCTTCATTATGCAGTTTTAGGGTATGAAAATGAAGGCAATGATCGTATATATATGTGTGTATGT
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TGGTTCATTACTCACTGTGCAAAACAGTAACATTGGAGTCTGTTAGCTTAGCCGTTCTTAATAGAAGCTGCATATTTTTCTTTAAAAGATTAAGGTTCAGTTGCTGGGTA
GATTTGTGTTTGCGGACTTTCAGTTTTAACTAGTTAGGTTCAGTAGTAAGTAGAGCGATATTTGCTAGTTCAAATCTACAGATTTGGGTTTCTCTGTAGTTCTCTCCCAC
CATAGCACTAGAAGTAAGTATCATACAATATTCTTAAAGCTTTTATTTTTAAGATATATACGAACGAGCTGTTAGTGTATGTATAACTTGGTTCCAATATTCTTTATATT
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ACTAAAAGAAAGATGTCTCACCCTCTTTAATTTTTACTTTTCTTTGTTGTCATTTAGGGTATTTGGCTGGAGCCTAATAATACTGTAATGGGATCTTTGGTTGAGAGGTT
GTGTAGCTGAGGTTTAGATTTATTGCCTCCCTTTGAGTGTGCATCACTAGGTCTTTTTGTAATTACGATCTTGGTTTGATTTTGTTGGATTGGATTTTTTTTATGTAGTT
TGTTCTTGGGCTTCTTCTTTTTCTTGGGTTCATTCTTTTTAGAAAAATACTTAGGTGCATTCCCGGGCACATATATCTTTGTGCATCCCACCAAATTGTCCTATCATAAT
GTGACATGTGGAAAAATTTTAAAATATATATATTTTTTTTGGGTGCGGGCGATAGGGGAGGGAAGCATAGAGATGGGTGCATCTTGGGATGCACCTACTTGTCCTTCTTT
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ATTGTAAGTTCCTTGGACATGATTCATGCCAAAGAAGAGTAAAGGCTTTACTTTTGCTATTCAATAAGTGTTTTATCTTAGACAGTTACCGATGGTGTTGTATTTTCTGA
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ATAAAATATTCACGTCACCTTGACCGTCCATCAAGGATTCAAAATCTTATGAGTTTATCTGATAACCAATATCTTAGGGTCCATGGGAATGGTTTAAGCAAGTTGATCCA
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