; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0016936 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0016936
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-CH-type domain-containing protein
Genome locationchr09:5084616..5088099
RNA-Seq ExpressionPI0016936
SyntenyPI0016936
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR011016 - Zinc finger, RING-CH-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR022143 - Protein of unknown function DUF3675
IPR033275 - E3 ubiquitin-protein ligase MARCH-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046318.1 DUF3675 domain-containing protein/RINGv domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-14296.31Show/hide
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XP_008467137.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504564 isoform X2 [Cucumis melo]1.8e-14296.31Show/hide
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XP_011655462.1 uncharacterized protein LOC101213226 isoform X1 [Cucumis sativus]3.3e-14195.2Show/hide
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XP_038906751.1 uncharacterized protein LOC120092674 isoform X2 [Benincasa hispida]4.5e-13090.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CST5 uncharacterized protein LOC103504564 isoform X28.6e-14396.31Show/hide
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A0A1S3CST7 uncharacterized protein LOC103504564 isoform X18.6e-14396.31Show/hide
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A0A1S4DSC9 uncharacterized protein LOC103504564 isoform X33.6e-12596.19Show/hide
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A0A5A7TTY1 DUF3675 domain-containing protein/RINGv domain-containing protein8.6e-14396.31Show/hide
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A0A6J1DFQ6 uncharacterized protein LOC111020033 isoform X16.8e-12484.93Show/hide
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        SGDYSFP+LL+ICLRTFGIFLPIYVMFKVV  V+RRRLL+  SP    S+S+I RSS+S  PQ QPY+IRVR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6NNE9 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF111.5e-0640Show/hide
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        C+IC    E   +  PC C GS++Y H+ C+ KW +E+G   CE+C  +Y
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Q5I0I2 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF21.5e-0630.26Show/hide
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        + +P     CRIC +     N+ +PC C G+L   H+ C++KW +    + CE+C  ++      P PL E  + P
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Q5T0T0 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF81.1e-0638.98Show/hide
Query:  PSPKKIVECRICQDE-DEDTNMETPCSCCGSLKYAHRRCIQKWCNEKGDTICEICRQQY
        PS + I  CRIC  E D+++ + TPC C GSL + H+ C+Q+W        CE+C+ ++
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Q8CBH7 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF111.5e-0640Show/hide
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        C+IC    E   +  PC C GS++Y H+ C+ KW +E+G   CE+C  +Y
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Q9DBD2 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF81.5e-0639.22Show/hide
Query:  CRICQDE-DEDTNMETPCSCCGSLKYAHRRCIQKWCNEKGDTICEICRQQY
        CRIC  E D+++ + TPC C GSL + H+ C+Q+W        CE+C+ ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G01275.1 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein1.3e-6651.29Show/hide
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        MGDHFVLLVDRL+TEST+EAAI+SR Q  +A     + +  D  + +M  +   S   + ECRIC DED D+NMETPCSC GS+KYAHRRC+Q+WCNEKG
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Query:  DTICEICRQQYKPGYTAPPPLFEMGRIPMNFRGNWEISRRNLDSPSYIAMVSSNRNVADSGYDEFSASAATSVLCCHSVAIIFMVLLVLRHSLPLIFNES
        DT CEIC Q++KP YTAPPPL E+G +P++FRGNW IS+R      +I +V ++    D  Y     S+ TS +CC S+ +IFM LL+LRH+LPL+   S
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Query:  GDYSFPLLLTICLRTFGIFLPIYVMFKVVFAVYRRRLLLATSPSSLISSSSIARSSTSQSPQPQPYIIRVR
          + FPL   + LR  GI LPIYV+ K V    R    L TSPS     SS   + + + PQ Q YII VR
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AT2G01275.2 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein1.3e-6651.29Show/hide
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        MGDHFVLLVDRL+TEST+EAAI+SR Q  +A     + +  D  + +M  +   S   + ECRIC DED D+NMETPCSC GS+KYAHRRC+Q+WCNEKG
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Query:  DTICEICRQQYKPGYTAPPPLFEMGRIPMNFRGNWEISRRNLDSPSYIAMVSSNRNVADSGYDEFSASAATSVLCCHSVAIIFMVLLVLRHSLPLIFNES
        DT CEIC Q++KP YTAPPPL E+G +P++FRGNW IS+R      +I +V ++    D  Y     S+ TS +CC S+ +IFM LL+LRH+LPL+   S
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Query:  GDYSFPLLLTICLRTFGIFLPIYVMFKVVFAVYRRRLLLATSPSSLISSSSIARSSTSQSPQPQPYIIRVR
          + FPL   + LR  GI LPIYV+ K V    R    L TSPS     SS   + + + PQ Q YII VR
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AT2G02960.2 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein3.5e-4037.5Show/hide
Query:  ESRKQSTEATSSAMDGSKRDRSSPDMGFDNIPSPKKIV-ECRICQDEDEDTNMETPCSCCGSLKYAHRRCIQKWCNEKGDTICEICRQQYKPGYTAPPPL
        E R +S      A+D S  D        D+   P  +  ECRIC DE    N+E+PC+C GSLKYAHR+C+Q+WCNEKG+ ICEIC Q Y+PGYTAPPP 
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Query:  FEMGRIPMNFRGNWEISRRNLDSPSYIAMVSSNRNVADSGYDEFSASAATSVLCCHSVAIIFMVLLVLRHSLPLIFNESGDYSFP--LLLTICLRTFGIF
         +     ++  G W IS  ++  P  +A+  + R   +S Y E++AS+A+    C S A+I M LL+LRH+L +  +  G+   P  +L  + LR  G  
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Query:  LPIYVMFKVVFAVYRRR--------------LLLATSPSSL-------ISSSSIARSSTSQSPQ
        LP Y+M   +  + RRR              +L +  P ++       ISSS++A ++TS   Q
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AT2G02960.4 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein3.5e-4037.5Show/hide
Query:  ESRKQSTEATSSAMDGSKRDRSSPDMGFDNIPSPKKIV-ECRICQDEDEDTNMETPCSCCGSLKYAHRRCIQKWCNEKGDTICEICRQQYKPGYTAPPPL
        E R +S      A+D S  D        D+   P  +  ECRIC DE    N+E+PC+C GSLKYAHR+C+Q+WCNEKG+ ICEIC Q Y+PGYTAPPP 
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Query:  FEMGRIPMNFRGNWEISRRNLDSPSYIAMVSSNRNVADSGYDEFSASAATSVLCCHSVAIIFMVLLVLRHSLPLIFNESGDYSFP--LLLTICLRTFGIF
         +     ++  G W IS  ++  P  +A+  + R   +S Y E++AS+A+    C S A+I M LL+LRH+L +  +  G+   P  +L  + LR  G  
Subjt:  FEMGRIPMNFRGNWEISRRNLDSPSYIAMVSSNRNVADSGYDEFSASAATSVLCCHSVAIIFMVLLVLRHSLPLIFNESGDYSFP--LLLTICLRTFGIF

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        LP Y+M   +  + RRR              +L +  P ++       ISSS++A ++TS   Q
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AT5G38070.1 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein2.4e-5245.85Show/hide
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        MGDH VL+VDRL ++S L       +   +A S   DG     S+   G D   S  K V+CRIC DEDEDTNM+TPCSC G+LK+AH  C+Q+WCNEKG
Subjt:  MGDHFVLLVDRLLTESTLEAAIESRKQSTEATSSAMDGSKRDRSSPDMGFDNIPSPKKIVECRICQDEDEDTNMETPCSCCGSLKYAHRRCIQKWCNEKG

Query:  DTICEICRQQYKPGYTAPPPLFEMGRIPMNFRGNWEISRRNLDSPSYIAMVSSNRNVADSGYDEFSASAATSVLCCHSVAIIFMVLLVLRHSLPLIFNES
        DT+CEICRQQYKPGYTAP  LF    I MNF  +W I   +L +P ++         AD  +D +S  + TS++CC  +A++F++LL LRHSLP++    
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Query:  GDYSFPLLLTICLRTFGIFLPIYVMFKVVFAVYRRRLLLATSPSSLISSSSIA
         D+S  LL+   +RT GI L  YV FK    + R R    T  S   S    A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGTTCGAAGAGGGATAGGTCTTCCCCAGATATGGGATTTGATAACATACCATCTCCAAAGAAAATTGTGGAATGTAGAATATGCCAAGATGAGGATGAAGACACGAACA
TGGAAACACCCTGCTCGTGCTGTGGCAGCCTTAAGTATGCACATCGAAGATGCATACAGAAGTGGTGTAACGAGAAGGGTGACACAATTTGTGAAATATGCCGCCAGCAA
TATAAACCAGGTTACACAGCTCCTCCTCCATTATTCGAAATGGGGCGTATCCCAATGAACTTCAGGGGGAACTGGGAGATTTCTAGAAGGAACTTGGATAGTCCTAGCTA
TATAGCAATGGTTTCATCAAACCGTAATGTCGCTGATTCTGGCTATGATGAGTTCTCGGCATCTGCTGCAACCAGCGTGCTATGCTGCCATTCAGTTGCTATCATTTTCA
TGGTTCTTCTGGTTTTGAGACACTCTCTTCCCCTCATATTCAATGAAAGCGGTGATTACTCTTTCCCTCTGCTTCTGACAATATGCCTGCGAACTTTTGGGATCTTCTTA
CCGATATACGTTATGTTCAAAGTCGTCTTTGCAGTTTATCGCCGCCGACTTCTCCTGGCTACGTCTCCTAGTTCACTCATTAGTTCATCCAGTATTGCTCGGAGTTCGAC
ATCCCAATCGCCCCAACCTCAGCCTTACATTATCCGTGTTCGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCATGGCGGCCCCTCTTCCTCTCTCTCTATAAAATTTGCCGCTTAACATAAATTGGAAGATTTTGTAGCAATATATAACACGCACGCGAAGTGTTTGATGAAATGCCAAG
CTGAAAAATATGGGCAGAAACCCATTTTCATAGCTTCTTTTTCTTGGTTCTCTTGATGCCACAAAGCTTGGAATACATTCATCCATGTGTCACACCCACCCATTTATCTT
CTTCCCGAAAACTCTGGCTAATTTCATTCAGAAACATCGGAGGTGGAAAAAAGGGGCATACCAGTTTTCTTTGCTTCAACAAGATTCCATTCCCTTCTTTTTAAAGATTG
TGAAATAATTTTTTCCTGATATTGGGAGTTTTTGAGTATGGGGGATCACTTTGTTTTGCTGGTTGATCGGTTGTTGACGGAGTCGACATTAGAAGCAGCAATTGAGAGCC
GAAAGCAATCGACGGAAGCAACCTCCTCTGCCATGGATGGTTCGAAGAGGGATAGGTCTTCCCCAGATATGGGATTTGATAACATACCATCTCCAAAGAAAATTGTGGAA
TGTAGAATATGCCAAGATGAGGATGAAGACACGAACATGGAAACACCCTGCTCGTGCTGTGGCAGCCTTAAGTATGCACATCGAAGATGCATACAGAAGTGGTGTAACGA
GAAGGGTGACACAATTTGTGAAATATGCCGCCAGCAATATAAACCAGGTTACACAGCTCCTCCTCCATTATTCGAAATGGGGCGTATCCCAATGAACTTCAGGGGGAACT
GGGAGATTTCTAGAAGGAACTTGGATAGTCCTAGCTATATAGCAATGGTTTCATCAAACCGTAATGTCGCTGATTCTGGCTATGATGAGTTCTCGGCATCTGCTGCAACC
AGCGTGCTATGCTGCCATTCAGTTGCTATCATTTTCATGGTTCTTCTGGTTTTGAGACACTCTCTTCCCCTCATATTCAATGAAAGCGGTGATTACTCTTTCCCTCTGCT
TCTGACAATATGCCTGCGAACTTTTGGGATCTTCTTACCGATATACGTTATGTTCAAAGTCGTCTTTGCAGTTTATCGCCGCCGACTTCTCCTGGCTACGTCTCCTAGTT
CACTCATTAGTTCATCCAGTATTGCTCGGAGTTCGACATCCCAATCGCCCCAACCTCAGCCTTACATTATCCGTGTTCGGTAAGTATTATACGAGCTAGAAGAAATTTGA
TTTCGAGGCTGAAAAAGGGTGTAGCTATGGGGATATCTTAATTCAGAAAGTTTCATGGCTGTATCCTTGTCAGCTTCAAGTAAATATGGTGGAAAGACCAATTGTAAAGG
TTAGAAAAGAAAGAAATTGCTCGAAAAGGAAAAAAAAAGGGGGTTAGATGTTTGAAGCTGTAATGCAGTTGATTAGAATGATTGCTTGTGTTAGAGATTCTCTGTACAGA
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TAGAACAAAATATTAGGTGTGTATCTGAACTTATGATCTCTTGGTTGGGTACATGCTTTATGTCAGTTAAATTATATTCTGTTGGCTTATGTTTTAACTTCATTATGTCT
TTTATACGGATGACTTTCAAATGATGATCCAAATGAAATTTGGCCCACAATTCAAATTCTAATGTGTAACGGCCTGATGATGACATCAGTTGCCTGCAAATTTATCAAAA
CAACTTTATCTGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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