; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0017157 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0017157
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL74-like
Genome locationchr03:24281266..24285051
RNA-Seq ExpressionPI0017157
SyntenyPI0017157
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052006.1 RING-H2 finger protein ATL72 [Cucumis melo var. makuwa]6.6e-9896.34Show/hide
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KAG7016045.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.4e-9390.16Show/hide
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XP_011656436.1 RING-H2 finger protein ATL72 [Cucumis sativus]6.1e-9694.79Show/hide
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XP_023550807.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.4e-9390.16Show/hide
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XP_038885444.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Benincasa hispida]4.3e-9793.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAH2 RING-type domain-containing protein1.7e-9694.3Show/hide
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A0A5D3BXT6 RING-H2 finger protein ATL723.2e-9896.34Show/hide
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A0A6J1BZW4 RING-H2 finger protein ATL742.4e-9089.06Show/hide
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A0A6J1FF16 RING-H2 finger protein ATL74-like9.0e-9389.64Show/hide
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A0A6J1JVF4 RING-H2 finger protein ATL74-like1.2e-9289.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0C034 RING-H2 finger protein ATL106.1e-3044.22Show/hide
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        +LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E  Q+ + +  +A++
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Q6NQG7 RING-H2 finger protein ATL782.7e-3854.89Show/hide
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        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F+A E++K
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Query:  VLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++
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Q9FLC6 RING-H2 finger protein ATL734.8e-4359.06Show/hide
Query:  TTALPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCP
        T A P     + ++  N A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C 
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        ICLGDF+ GE ++VLPKCNHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+
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Q9LZV8 RING-H2 finger protein ATL745.9e-4155.19Show/hide
Query:  HRLLLDADTTALPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGL
        HRLLL++      ++GS   + Y  + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   +
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Query:  EIRETDCPICLGDFIAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +I  T+C ICLG+F  GE+++VLP CNH FH+ CIDTWL SHSSCP CR SL+E
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Q9SG96 RING-H2 finger protein ATL722.5e-4459.51Show/hide
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        RLLL+    A P+N +       N+  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
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Query:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFIAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ
        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK++VLPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49220.1 RING/U-box superfamily protein4.3e-3144.22Show/hide
Query:  NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTAT---GLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFIAGEKIK
        +E N   N++++L+ L+C +IC LGL+ I+RCALR S RF       + S    +   G+KK ALR  PV  Y  E  L   + +C ICL DF++GE+++
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Query:  VLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE--QQSVSESGEAEA
        +LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E  Q+ + +  +A++
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AT1G49230.1 RING/U-box superfamily protein1.9e-3954.89Show/hide
Query:  YNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGT-ASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFIAGEKIK
        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F+A E++K
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Query:  VLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++
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AT3G10910.1 RING/U-box superfamily protein1.8e-4559.51Show/hide
Query:  RLLLDADTTALPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV
        RLLL+    A P+N +       N+  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
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Query:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFIAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ
        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK++VLPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
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AT5G01880.1 RING/U-box superfamily protein4.2e-4255.19Show/hide
Query:  HRLLLDADTTALPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGL
        HRLLL++      ++GS   + Y  + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   +
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Query:  EIRETDCPICLGDFIAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +I  T+C ICLG+F  GE+++VLP CNH FH+ CIDTWL SHSSCP CR SL+E
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AT5G05280.1 RING/U-box superfamily protein3.4e-4459.06Show/hide
Query:  TTALPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCP
        T A P     + ++  N A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C 
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Query:  ICLGDFIAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS
        ICLGDF+ GE ++VLPKCNHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGATGGAGTCCAATCACCACCGTCCGCGTCCCCATCGCCTCCTCCTCGACGCCGACACGACAGCACTACCATCCAATGGAAGCAGAACGCGAAATTCATATAACAA
CGAAGCCAATTTCGATACAAACATGGTGATAATTCTTGCCGCGTTACTCTGCGCACTGATTTGCGCTCTAGGATTGAATTCAATCGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCC
GACGGTTCGCCTTCGAAACAGGCGGCGGCACAGCCTCGCGTCTCACCGCTACAGGGCTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATTCCGGTCGCCGTCTATGGCTCGGAAACA
GGTCTAGAGATTCGAGAAACGGATTGCCCTATCTGCCTTGGAGATTTCATCGCCGGCGAGAAAATCAAAGTACTCCCCAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTAT
CGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCGTCGTGTCCCACATGTCGTCAATCCCTGCTGGAACAACAGTCGGTTTCTGAATCGGGGGAAGCTGAGGCCGGTAACCGACCCGCCG
GAAATTCATCGGCTAGCGGCCAAGGACAACAGACAGAAACACAAAAACACAAAAGAAAGAAAAACAATGAATTGAAAACCATCAAAATGAAGAGCAGAGTCCTTCCATGG
AGATGGTCTTCCACCCACATCGCTCAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTAATTATTGTCTACCCCCATCCCTCCCTCTTTAGGCTTTATGTATAATATACCCATTCTTTTGATGTTAATTTTCTTGTCCATATTCTAAATTCTACTCAAATCTCTC
TTTTACTTCTATTCAAATACCCCCCCACCTCCCTCTCAATAATTTTCTTCTTCCTCTCTTGTTTGGCCAGAGGAAAAATCTTTCTTGGGAGTTCTTGGTTTCTAACAGGG
GCTTGGGTTTTGTGAGGCTAAGAGATTTTCAGTTCTTTGATGTTTTATCCTGGTTCTTCTCAGAAGATCCTCCATGGGAAACCAAGCTTTTTGCAGCCATGGATACTGTT
CTTTGACATGCTCTTGTATTTTGGTTTTTTGAGTGACTGGTAAGATGCTTTGAAACTTCCTTAGAATCCTAAAAGCTGTTTGATTTAACTCTCAAAGAATCATCATTCAT
CATCCTTTCTAGTTGAAGGCAGATCGGGAAGAATCAAAACAAAGCCCCCCTTTTTACAATTGAGCTTTGATTAAGGTCCAGAGAAGAGAGAGCTAGAAGGTGTGAACAGA
GAACACAAGGGTTTTATTGGTACATGAGTGGATATGAAATTTCTACTTTAAGTCTCTATTATGAATCGATTCAGTCATCAAAGAATTATAGGGTTCTGAATTATCAAGTT
TCACTGTGGAATTTCATCAAACAGGCTCAAGATCTAAAAGTGAATTACCTGACAGAATCAATCCCGTTGTTGCTTTGAAGTAATTAGCAGCTCCTATGACGATGGAGTCC
AATCACCACCGTCCGCGTCCCCATCGCCTCCTCCTCGACGCCGACACGACAGCACTACCATCCAATGGAAGCAGAACGCGAAATTCATATAACAACGAAGCCAATTTCGA
TACAAACATGGTGATAATTCTTGCCGCGTTACTCTGCGCACTGATTTGCGCTCTAGGATTGAATTCAATCGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCCGACGGTTCGCCTTCG
AAACAGGCGGCGGCACAGCCTCGCGTCTCACCGCTACAGGGCTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATTCCGGTCGCCGTCTATGGCTCGGAAACAGGTCTAGAGATTCGA
GAAACGGATTGCCCTATCTGCCTTGGAGATTTCATCGCCGGCGAGAAAATCAAAGTACTCCCCAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTATCGATACCTGGTTAGC
TTCCCACTCGTCGTGTCCCACATGTCGTCAATCCCTGCTGGAACAACAGTCGGTTTCTGAATCGGGGGAAGCTGAGGCCGGTAACCGACCCGCCGGAAATTCATCGGCTA
GCGGCCAAGGACAACAGACAGAAACACAAAAACACAAAAGAAAGAAAAACAATGAATTGAAAACCATCAAAATGAAGAGCAGAGTCCTTCCATGGAGATGGTCTTCCACC
CACATCGCTCAATAATGAAATCCACACAAACATCAGTAGCTAACTTATCCACAACAAAATTACACCTATCTTATCAAAAATAGTAATATTAGAAGTTATGTCTTTCTTCA
ATTACCAGATATAAAATTTTTATATTTATCATTTACGAAATAAAACATAACTTATTATTATTATTTTAATCATTATTATTAGACTACTGAATAATTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTMESNHHRPRPHRLLLDADTTALPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSET
GLEIRETDCPICLGDFIAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESGEAEAGNRPAGNSSASGQGQQTETQKHKRKKNNELKTIKMKSRVLPW
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