; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0017171 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0017171
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionras-related protein RABC2a-like
Genome locationchr03:7317781..7321606
RNA-Seq ExpressionPI0017171
SyntenyPI0017171
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150373.1 ras-related protein RABC2a [Cucumis sativus]1.3e-10893.52Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGK+LKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL++VWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGS+RAVTTEEGMEVAK+HKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSK++EVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCCH
        +ARKE +  ND GCCH
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCCH

XP_008456546.1 PREDICTED: ras-related protein RABC2a-like [Cucumis melo]1.6e-10993.98Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL+++WAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKSLFLECSARTRENVDRCF+ELSSKILEVPSLLENGS+VVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCCH
        RA KE +  ND GCCH
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCCH

XP_022952871.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita moschata]2.5e-10794.42Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLMDVWAKEVE+YLTN ECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCC
        RARKE   +NDGGCC
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCC

XP_022990456.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita maxima]1.1e-10593.49Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLM VWAKEVE+YLTN ECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCC
        RA KE   +NDGGCC
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCC

XP_038885704.1 ras-related protein RABC2a-like [Benincasa hispida]2.2e-11196.3Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLMDVWAKEVE+YLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCF+ELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILD T
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCCH
        RARKE   +ND GCCH
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCCH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN27 Uncharacterized protein6.4e-10993.52Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGK+LKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL++VWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGS+RAVTTEEGMEVAK+HKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSK++EVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCCH
        +ARKE +  ND GCCH
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCCH

A0A1S3C3K9 ras-related protein RABC2a-like7.6e-11093.98Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL+++WAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKSLFLECSARTRENVDRCF+ELSSKILEVPSLLENGS+VVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCCH
        RA KE +  ND GCCH
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCCH

A0A5D3BLP5 Ras-related protein RABC2a-like1.5e-10277.1Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI-----------------------------------------------GVDFKI
        MGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI                                               GVDFKI
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTI-----------------------------------------------GVDFKI

Query:  KMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKS
        KMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNL+++WAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKS
Subjt:  KMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKS

Query:  LFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARKEDLSSNDGGCCH
        LFLECSARTRENVDRCF+ELSSKILEVPSLLENGS+VVKQKILDKTRA KE +  ND GCCH
Subjt:  LFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARKEDLSSNDGGCCH

A0A6J1GLE8 ras-related protein RABC2a-like1.2e-10794.42Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLMDVWAKEVE+YLTN ECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCC
        RARKE   +NDGGCC
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCC

A0A6J1JMZ9 ras-related protein RABC2a-like5.1e-10693.49Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLM VWAKEVE+YLTN ECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEDLSSNDGGCC
        RA KE   +NDGGCC
Subjt:  RARKEDLSSNDGGCC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC11.8e-7164.95Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+   +DY FK+LLIGDSGVGKSS+LLS+ SN   DLSPTIGVDFK+K +T+G K+LKL IWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII+VYDVTRR+
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL D+WAKE++LY TN++CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG++ A+E+  LFLECSA+TR NV++CF+EL  KILE PSL   GS   K+ I  +  
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
        A+    SS+   CC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC

O49841 Ras-related protein RABC2a3.5e-8071.5Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+L+S+IS+ V DL+PTIGVDFKIK +TVGGKRLKLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GIILVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL+DVW KE+ELY TN+EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+ +AKE   +FLECSARTR+NV++CF+EL+ KI+EVPSLLE GS  VK+ IL   +
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
         + E  ++   GCC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC

P36862 GTP-binding protein yptV31.7e-5057.22Show/hide
Query:  SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVW
        S+DY+FK+LL+GDSGVGKS IL  + S  F    + TIGVDFK+K +T  GKR KLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII VYDVTRR+TF +L   W
Subjt:  SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVW

Query:  AKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSV
         +E ++Y T    IK++V NKVD  ++R V++EEG + A+ H  LF+E SAR    V + F+EL  KIL+ P LLE  +V
Subjt:  AKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSV

Q6DHC1 Ras-related protein Rab-18-B5.2e-4754.91Show/hide
Query:  SFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEV
        + KIL+IG+SGVGKSS+LL +  + F  +L+ TIGVDFK+K + + G R KL IWDTAGQERF TLT SYYRGA G+ILVYDVT+R+TFT L + W  E+
Subjt:  SFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEV

Query:  ELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLEN
        E Y T  + +K+LVGNK+D+   R V   EG++ A++H  LF+E SA+TR+ V   F+EL  KIL+ P L E+
Subjt:  ELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLEN

Q9SF92 Ras-related protein RABC2b5.9e-7569.63Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TN +CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF+EL+ KI+EVPSLLE GS  VK        
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
         RK D  ++ G CC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B181.3e-7264.95Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+   +DY FK+LLIGDSGVGKSS+LLS+ SN   DLSPTIGVDFK+K +T+G K+LKL IWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII+VYDVTRR+
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL D+WAKE++LY TN++CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG++ A+E+  LFLECSA+TR NV++CF+EL  KILE PSL   GS   K+ I  +  
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
        A+    SS+   CC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC

AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B4.2e-7669.63Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TN +CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF+EL+ KI+EVPSLLE GS  VK        
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
         RK D  ++ G CC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC

AT3G09910.2 RAB GTPase homolog C2B4.2e-7669.63Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TN +CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF+EL+ KI+EVPSLLE GS  VK        
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
         RK D  ++ G CC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC

AT3G09910.3 RAB GTPase homolog C2B4.2e-7669.63Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TN +CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF+EL+ KI+EVPSLLE GS  VK        
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
         RK D  ++ G CC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A2.5e-8171.5Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+L+S+IS+ V DL+PTIGVDFKIK +TVGGKRLKLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GIILVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL+DVW KE+ELY TN+EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+ +AKE   +FLECSARTR+NV++CF+EL+ KI+EVPSLLE GS  VK+ IL   +
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEDLSSNDGGCC
         + E  ++   GCC
Subjt:  ARKEDLSSNDGGCC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTACTCTTTCAAGATTTTGCTGATTGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTTAGCTACAT
CTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCTACCATCGGTGTGGATTTCAAGATCAAGATGGTAACAGTTGGTGGAAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGAC
AAGAGAGATTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGCGCACATGGAATCATCCTAGTGTACGATGTTACCCGACGGGAGACATTTACAAACTTGATGGACGTATGG
GCAAAGGAAGTAGAGCTGTACTTAACCAATCGTGAGTGCATAAAGATTCTAGTTGGAAATAAAGTCGATCGGGGTAGTGAAAGAGCAGTAACAACAGAAGAAGGCATGGA
AGTTGCCAAGGAGCATAAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGCGCTCGAACTCGAGAAAATGTCGATAGATGCTTTAAAGAACTCTCTTCAAAGATTCTGGAAGTTCCAAGTC
TACTGGAAAATGGATCTGTTGTTGTGAAACAGAAAATTTTGGACAAAACACGAGCACGCAAAGAAGATCTAAGTTCCAACGACGGGGGTTGTTGCCACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAATGGGTGTTGTTGCAGGCCATAGAAGTAAACAAAAAGCGGAGAGCCCATCGATGATTAATTGTACACACGTACACTACCGGCTCTCGCCAGCTCCTTCACTGTTACA
CTTCCATTTTTCTCAAAACGAATTCTTTCTCTCTTTTCCCAATGATTTTGATTTCTTCTTCTTTCTGAAAAAGGGTTATTCTCACTTTAGAAGGGGTGGAACAGAAAAAG
GTTGCTCGTTTTGCTTGTTTGTGAGTCGTGAGGTAGTAGTAGAAGAAGAAAAATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTACTCTTTCAAGATTT
TGCTGATTGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTTAGCTACATCTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCTACCATCGGTGTGGATTTCAAGATCAAGATG
GTAACAGTTGGTGGAAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGACAAGAGAGATTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGCGCACATGGAATCATCCT
AGTGTACGATGTTACCCGACGGGAGACATTTACAAACTTGATGGACGTATGGGCAAAGGAAGTAGAGCTGTACTTAACCAATCGTGAGTGCATAAAGATTCTAGTTGGAA
ATAAAGTCGATCGGGGTAGTGAAAGAGCAGTAACAACAGAAGAAGGCATGGAAGTTGCCAAGGAGCATAAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGCGCTCGAACTCGAGAAAAT
GTCGATAGATGCTTTAAAGAACTCTCTTCAAAGATTCTGGAAGTTCCAAGTCTACTGGAAAATGGATCTGTTGTTGTGAAACAGAAAATTTTGGACAAAACACGAGCACG
CAAAGAAGATCTAAGTTCCAACGACGGGGGTTGTTGCCACTGAGACAACCGTGTAACAGCACAAAACAGAACTTACAGAAACAGATTTAGAAGATCTAAAGATACTGCTG
ATGGAAATTATTGATCAGAACAGCCCAAGAAAATACACAAAAGGGAAGATTACATGATCTTTTGCAATTCCATTTTGGCTATCACTGTTTCCATCAGTTTTCTTTTTCTA
TCTTAAAAAGGGAATAAAAATGCATTTCAATAGTATCTTTGAGATCACTGTATATGGTTGGTTATATTTTGGGCTGTTTGAGGACTTGCAAAAAATGAGTTGCTGAATTT
TGTTGAGACAAAGATTTTGAGTGAAAAAAATGTAATAAGATCTCTGTAGATAATGTGAATACAGTTTATTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATATATTGATAAGGGCT
ATTATGTTGTAGAAGCTTCCTTATACTTTGGTCTTAAATCTATAGAATGGTTTAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVW
AKEVELYLTNRECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFKELSSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARKEDLSSNDGGCCH