; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0017374 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0017374
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionVQ motif containing protein
Genome locationchr12:5183122..5185124
RNA-Seq ExpressionPI0017374
SyntenyPI0017374
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056997.1 VQ motif-containing protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-13398.4Show/hide
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XP_008442679.1 PREDICTED: VQ motif-containing protein 4 isoform X2 [Cucumis melo]1.9e-13098.36Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]7.9e-12189.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV54 VQ domain-containing protein2.6e-13097.55Show/hide
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A0A1S3B685 VQ motif-containing protein 4 isoform X19.0e-13198.36Show/hide
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A0A1S3B6X5 VQ motif-containing protein 4 isoform X29.0e-13198.36Show/hide
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A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X21.1e-13398.4Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like2.6e-10984.05Show/hide
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        ME+SS+ Q+NP P     SSLLPSP++R+++STT+S+STS GL    P  +HLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASV 
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         A    NSDS SKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKLKINPVFPVFGS  HSGFSPRK EILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSY
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        LKNGN KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLL LFPMTSPR+PGSSS S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 134.2e-3248.73Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +  P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
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        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLLSLFPMT    P  S
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Q5M750 VQ motif-containing protein 41.8e-5958.37Show/hide
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        ++L+PSP    SN++   +S+S    P      +    TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K  P     D   + S   IP
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Query:  PIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEA
        PIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N S         +  A
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Query:  EEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRLPGSSSTS
        EEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLL LFP+TSPR+ GSSS S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 331.7e-3042.4Show/hide
Query:  LPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPG-VPNSDSHSKTHIPPIKSLP
        + +P   +S+        S   H Q  HL            NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP  V N++  S   IPPIK   
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Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPVFPVFGSGAHSG------FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  +G +S       FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
Subjt:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPVFPVFGSGAHSG------FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC

Query:  SYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LL LFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.4e-1133.7Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLN-KLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILS
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E    A+   A  +       KT I        +++   KL+ERR  +  KL+I      F     +  S   +  L 
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Query:  PSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRLPG
         S +  P+   S ++ +  +P       +C+         + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL+LFP+TSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 191.3e-3345.34Show/hide
Query:  SPPSSLLPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPP
        +PPSS         S+S+ +S+  +  LH   +H+     ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +  P  P+   +    IPP
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Query:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN
        IK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+           
Subjt:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN

Query:  GNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRL
                 EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LL LFP+TSPRL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.3e-6058.37Show/hide
Query:  SSLLPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ-ASVKSAPGVPNSD---SHSKTHIP
        ++L+PSP    SN++   +S+S    P      +    TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K  P     D   + S   IP
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Query:  PIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEA
        PIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N S         +  A
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Query:  EEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRLPGSSSTS
        EEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLL LFP+TSPR+ GSSS S
Subjt:  EEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRLPGSSSTS

AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.6e-5857.98Show/hide
Query:  SSLLPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ-ASVKSAPGVPNSD---SHSKTHIP
        ++L+PSP    SN++   +S+S    P      +    TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K  P     D   + S   IP
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Query:  PIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEA
        PIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N S         +  A
Subjt:  PIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEA

Query:  EEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRL
        EEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLL LFP+TSPR+
Subjt:  EEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRL

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein3.0e-3348.73Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSGAHS
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +  P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSGAHS

Query:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRLPGSS
        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLLSLFPMT    P  S
Subjt:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRLPGSS

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein9.2e-3545.34Show/hide
Query:  SPPSSLLPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPP
        +PPSS         S+S+ +S+  +  LH   +H+     ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +  P  P+   +    IPP
Subjt:  SPPSSLLPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIPP

Query:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN
        IK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+           
Subjt:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN

Query:  GNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRL
                 EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LL LFP+TSPRL
Subjt:  GNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRL

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein1.2e-3142.4Show/hide
Query:  LPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPG-VPNSDSHSKTHIPPIKSLP
        + +P   +S+        S   H Q  HL            NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP  V N++  S   IPPIK   
Subjt:  LPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPG-VPNSDSHSKTHIPPIKSLP

Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPVFPVFGSGAHSG------FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  +G +S       FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
Subjt:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPVFPVFGSGAHSG------FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC

Query:  SYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LL LFP+ SP
Subjt:  SYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLSLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCAGTTCACCAAGATAACCCATCTCCTCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCTCCAACCACTCGCGTCTCCAACAGCACTACCACCAGTACCAGCACCAGCAA
TGGCCTCCACCCTCAATTCAACCACTTACATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACCTTCGTTCAAGCTGATACTTCCTCTTTTA
AACAAGTTGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACGGCCAAGCAAGCCTCCGTCAAGTCTGCTCCCGGTGTTCCTAACTCTGATTCTCACTCCAAGACGCATATTCCT
CCCATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTATGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCCGTGTTTCCTGTTTTTGGTTCTGG
TGCTCATTCTGGGTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCTAGTATTTTGGATTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGCTGATTCCTGACCCGTTTG
ATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGGTAAGTTAGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCG
CCGACCACCACTCCTCGGGATTCTGAGCCTCGGTTGTTGTCTCTGTTCCCAATGACATCTCCTAGACTACCAGGTTCATCTTCCACTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGTTGATGATGAATGAATATTATGATTGAAAATTTGAAGGAAGAGAGAGTAAAAAAAAGAAAAAGAAAAGCTCCCCAACAAAACATTTCTTACCAAACCAAAAAAAACA
GAGGAGAGGCAGAGCAAGAAGAAGACAGTAAACAAATAACAATCTGAATCCATTTCTTCTTAATCTCATCTACCCCACTCTCACGCCTCTGTTTCTCAACACTTTCCCTT
CCTTTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAACCTCTTCACTGATCACAACCTCCATCAATGGAAACCTCT
TCAGTTCACCAAGATAACCCATCTCCTCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCTCCAACCACTCGCGTCTCCAACAGCACTACCACCAGTACCAGCACCAGCAATGGCCTCCACCC
TCAATTCAACCACTTACATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACCTTCGTTCAAGCTGATACTTCCTCTTTTAAACAAGTTGTTC
AAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACGGCCAAGCAAGCCTCCGTCAAGTCTGCTCCCGGTGTTCCTAACTCTGATTCTCACTCCAAGACGCATATTCCTCCCATTAAATCT
TTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTATGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCCGTGTTTCCTGTTTTTGGTTCTGGTGCTCATTCTGG
GTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCTAGTATTTTGGATTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGCTGATTCCTGACCCGTTTGATCGATCTGGGT
TGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGGTAAGTTAGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGACCACCACT
CCTCGGGATTCTGAGCCTCGGTTGTTGTCTCTGTTCCCAATGACATCTCCTAGACTACCAGGTTCATCTTCCACTTCATGAATTTCTCTTTTCTTTTATGAATTTTGTGG
GTTTTCTTTTTCCTTTTTTCTTTTTTCGATTTTATATGTTGCTGCTGGTTGATGGCATTTGATGATAATGAAAAAGGAGGCGAGAGTGATAAGGCTTGTAATGATATATT
TCCTGAGAATGATAGATTGTTGCTTCAATTGTAAAATCTGATGTTCTTATCCTTTCTTATGAAGAAGGAATAAAAATTAGCCCTCATTTTCTCCCTTGTTTGTTCTTAGA
AGAGATAAACTTCAAATTCAATTCTGTTTTCCCCTTCCTGAAGATTAATGATTGTTCAATCGATTTTCTTTTCCCTTCAAACCCATTACAGCTTACAAACGACAATAGGG
ATAATGATTCAGTGCAAATCCCCAGCCAATTCAAACACAAGGAAACTTCTTTCATATCTGATAAATTTTGTATAACCGATTGCTTTTCTTTTCCTTTTTGGTCATTATTA
CTGCTCGTTGTGTAGTCAACACTCACCACTCAATAAATGTAATAAATGCGAAGACTAATTGAATTAAGGGTCCGTTTTAGCATCGGCAAGGCAATTACTCAATTAGTGTG
GTGCAAGGTAATGAGGAAAAAGGAAAAGTGGCCTTATGTTGTGAGGGATGGTTATGAAAAGTGGCCTCAACCCTGGCCTAACTTTCAAAGATAGGAGAAAAATGGGTGTG
GAATCTTGACCTTTTGTTACCTTTTGTGTTGTATCTTGTAAGCTTTTGTCAATTGTAACTTTCTTTTTCTTCTCTCTTTTCCTTTGCCTTTTACTTGTTTTAGCAGATAT
TTTATGTACAATATTCCACCTTTCAGGTCTCTGAAGTAACTTGTGAACGATCATTTAGCATGATAGGATTAGAAAAATTCACCATTGGACATGTGAGATGAGATGTGACC
CCATCTGTGAAATTGATTCTGGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSVHQDNPSPPSSLLPSPTTRVSNSTTTSTSTSNGLHPQFNHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKSAPGVPNSDSHSKTHIP
PIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSGAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNGKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPS
PTTTPRDSEPRLLSLFPMTSPRLPGSSSTS