; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0017402 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0017402
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionphylloplanin-like
Genome locationchr06:5091342..5092680
RNA-Seq ExpressionPI0017402
SyntenyPI0017402
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013783 - Immunoglobulin-like fold
IPR040404 - Phylloplanin-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004134491.2 phylloplanin [Cucumis sativus]1.1e-5168.99Show/hide
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XP_008438895.1 PREDICTED: phylloplanin-like [Cucumis melo]1.3e-4767.72Show/hide
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XP_022937971.1 phylloplanin-like [Cucurbita moschata]6.7e-4162.66Show/hide
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XP_023522114.1 phylloplanin-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.9e-4163.29Show/hide
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XP_038903470.1 phylloplanin-like [Benincasa hispida]4.9e-4465.41Show/hide
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         + ++C  VV TPLSNCNVTLPSTG L S L +V + +  GIL I N+    F F+PSL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L595 Uncharacterized protein5.3e-5268.99Show/hide
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A0A1S3AXJ8 phylloplanin-like6.1e-4867.72Show/hide
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A0A5D3CZ16 Phylloplanin-like6.1e-4867.72Show/hide
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A0A6J1C7T1 phylloplanin-like7.2e-4162.18Show/hide
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        S+LNNC +VVKTPLSNCN +LPSTG L S LQ+V K +  G+L I NL    F  +
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A0A6J1FBV3 phylloplanin-like3.2e-4162.66Show/hide
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        S+ +NC +VV TPLS+CN TLPS G L S L  V  +   G+L ITN+    F F PS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q56S59 Phylloplanin1.7e-1541.35Show/hide
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        ++ ++ AL A P    A    +   L    I G VFC+ NGN+   N  +  VFPNA+VQL+CG  N++S+T TN  G FS+ +N    L      NC L
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Query:  VVKTPLSNCNVTLPSTGFLTSPLQYVQKLVTGG
        VV TPLS CN TL S G L S L+ V   +  G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G16660.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.7e-2144.96Show/hide
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        G +G +L L  I G VFC+ NG    + ++TP F NA V+LQCG  N +VST TTN  G FS+  + I+ LLS+LL++C +VV TPLS CN  LPS G L
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         S L  +   +T G+L I ++    F  +
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AT3G16670.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.5e-1739.87Show/hide
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        +K ++   ++++  +  +P M  AQ G  G  + +  I G +FCT NG    N +  P F NA VQLQCGN N +V+ T TN  G F+   N I+  L +
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        LLN+C +VV TP S+C+ TLPSTG L S L  V  +V+ G+L I  +      FIP++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTGAAATCAAATTTGTTTGTTATGGTGATGGTTATTGGTGCTTTGGGAGCAGCTCCATTAATGGTGGAAGCTCAGCTTGGGAATATTGGGAATCTCCTTCGACT
TTTCGAAATCGGAGGAACTGTTTTTTGCACTGCCAATGGCAACATTTTCACCAATGCCTCTACCACCCCTGTTTTTCCAAATGCAGCAGTACAACTGCAATGCGGAAATG
GAAACATCGTGTCAACTACAACAACAAACAACGACGGAACCTTTTCAATGTTGTTGAATCCTATAGAATCCCTACTTTCCTCACTCTTAAACAATTGCATGCTCGTGGTG
AAGACTCCATTGTCCAATTGTAATGTGACGTTACCATCTACTGGATTTCTGACGTCGCCATTGCAATACGTTCAAAAACTTGTAACGGGTGGCATCTTGGAGATCACAAA
CTTAACCGCCAAATCATTCGCATTCATTCCATCCCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTAAAGTCAGAAAAATGTGGTGCAACTTGGGCTTAGTTCTTGCCTATATATGGGAGTGTGAGTTTGTAAAAGCAGATTAGAAGAGGAAATAAAAAAAGAAAAAGAAAAA
GAAAAAGAATGGGTTTGAAATCAAATTTGTTTGTTATGGTGATGGTTATTGGTGCTTTGGGAGCAGCTCCATTAATGGTGGAAGCTCAGCTTGGGAATATTGGGAATCTC
CTTCGACTTTTCGAAATCGGAGGAACTGTTTTTTGCACTGCCAATGGCAACATTTTCACCAATGCCTCTACCACCCCTGTTTTTCCAAATGCAGCAGTACAACTGCAATG
CGGAAATGGAAACATCGTGTCAACTACAACAACAAACAACGACGGAACCTTTTCAATGTTGTTGAATCCTATAGAATCCCTACTTTCCTCACTCTTAAACAATTGCATGC
TCGTGGTGAAGACTCCATTGTCCAATTGTAATGTGACGTTACCATCTACTGGATTTCTGACGTCGCCATTGCAATACGTTCAAAAACTTGTAACGGGTGGCATCTTGGAG
ATCACAAACTTAACCGCCAAATCATTCGCATTCATTCCATCCCTGTAAAATGCAAGTTGTGGGCTAAATATATTCACCAAAGGGGAAAAGGAATAATAAGATCAGAGTAA
TACGTATTTGAGTTTTTAGTACTTGTAATGTATGAGTTCTCTCTCAAATTTGATTGAGTACTTATGTTGTTTGTTTGTTGTTTGTTGTCTTGTTTATGCATGTGTTTGTT
GTTGTTGATTTCAAAAATAAAAGGTTGTATGCTTCTTGTTCTTGTAGTTATTTCAAGGACATGGAGTACTTAATGTAAAACTATTATAATTTAAAAGATATATATATATA
GTTTGTTTGAGTGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KTPLSNCNVTLPSTGFLTSPLQYVQKLVTGGILEITNLTAKSFAFIPSL