; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0017411 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0017411
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description30S ribosomal protein S1 isoform X1
Genome locationchr07:2568517..2574509
RNA-Seq ExpressionPI0017411
SyntenyPI0017411
Gene Ontology termsGO:0071840 - cellular component organization or biogenesis (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003029 - S1 domain
IPR012340 - Nucleic acid-binding, OB-fold
IPR022967 - RNA-binding domain, S1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044578.1 30S ribosomal protein S1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-17590.81Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
        MPIF+ATIASVS HSFLSLL+ST+DASST  SSSS ILPLKSPS+RPS F SRVSLSGKP+PIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI

Query:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVK-VIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV
        EGSNAGGLLVRFYSLM               EP KSIQDIAKSLTGSLISVK VIQADERNKKLIFSEKEA WSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV
Subjt:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVK-VIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV

Query:  HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDR--DKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLE
        HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDR  DKSRITLSI+QLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGL 
Subjt:  HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDR--DKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLE

Query:  TIIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        TIIEEL QEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPP+EKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  TIIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

XP_004152109.1 uncharacterized protein LOC101213559 isoform X2 [Cucumis sativus]3.0e-17489.68Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
        MPIFVATIASVSAHSFLSLL+ST+DASST  SSSSFILPLKSPS+R S F SRVSLSGKP+PIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI

Query:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH
        EGSNAGGLLVRFYSL+               EPYKSIQDIAKSL GSLISVKVIQADE+N+KLIFSEKEAA SKFSGQV VGDVYE KVGS+EDYGAFVH
Subjt:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH

Query:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII
        LR SDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINV+++KSRITLSI+QLEEDPLLETLDKVIPQ+SSAEPDSFGPK DSEIIPLPGLETII
Subjt:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII

Query:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

XP_008454000.1 PREDICTED: 30S ribosomal protein S1 isoform X1 [Cucumis melo]2.0e-17891.53Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
        MPIF+ATIASVS HSFLSLL+ST+DASST  SSSS ILPLKSPS+RPS F SRVSLSGKP+PIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI

Query:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH
        EGSNAGGLLVRFYSLM               EP KSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEA WSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH
Subjt:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH

Query:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII
        LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSI+QLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGL TII
Subjt:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII

Query:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        EEL QEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPP+EKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

XP_011653045.1 uncharacterized protein LOC101213559 isoform X1 [Cucumis sativus]1.7e-17288.74Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
        MPIFVATIASVSAHSFLSLL+ST+DASST  SSSSFILPLKSPS+R S F SRVSLSGKP+PIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI

Query:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH
        EGSNAGGLLVRFYSL+               EPYKSIQDIAKSL GSLISVKVIQADE+N+KLIFSEKEAA SKFSGQV VGDVYE KVGS+EDYGAFVH
Subjt:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH

Query:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII
        LR SDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINV+++KSRITLSI+QLEEDPLLETLDKVIPQ+SSAEPDSFGPK DSEIIPLPGLETII
Subjt:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII

Query:  EELLQEEG----IVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        EELLQEEG    IVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  EELLQEEG----IVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

XP_038897871.1 30S ribosomal protein S1 homolog B [Benincasa hispida]1.3e-17288.13Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASSTSSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDT---SPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGR
        MPIF AT+ SV AHSFLSLL+STTD +  SS+SFILP KSPS+RPSNF +RVSLSGKP+PIAGVLDT   SPES+RRARRSADWKAAREYLD+GFIYEGR
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASSTSSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDT---SPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGR

Query:  IEGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV
        IEGSNAGGLLVRFYSLM               EPYKSIQDIAKSL GSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFS QVGVGDVYEA+VGS+EDYGAFV
Subjt:  IEGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV

Query:  HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETI
        HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQ  SAEPDSFGPKSDSEI+PLPGLETI
Subjt:  HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETI

Query:  IEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        IEELLQE+GIVD+ VNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  IEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KTX2 Uncharacterized protein1.5e-17489.68Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
        MPIFVATIASVSAHSFLSLL+ST+DASST  SSSSFILPLKSPS+R S F SRVSLSGKP+PIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI

Query:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH
        EGSNAGGLLVRFYSL+               EPYKSIQDIAKSL GSLISVKVIQADE+N+KLIFSEKEAA SKFSGQV VGDVYE KVGS+EDYGAFVH
Subjt:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH

Query:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII
        LR SDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINV+++KSRITLSI+QLEEDPLLETLDKVIPQ+SSAEPDSFGPK DSEIIPLPGLETII
Subjt:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII

Query:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

A0A1S3BXL4 30S ribosomal protein S1 isoform X19.9e-17991.53Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
        MPIF+ATIASVS HSFLSLL+ST+DASST  SSSS ILPLKSPS+RPS F SRVSLSGKP+PIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI

Query:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH
        EGSNAGGLLVRFYSLM               EP KSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEA WSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH
Subjt:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVH

Query:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII
        LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSI+QLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGL TII
Subjt:  LRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETII

Query:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        EEL QEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPP+EKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  EELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

A0A5A7TNY0 30S ribosomal protein S1 isoform X17.8e-17690.81Show/hide
Query:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
        MPIF+ATIASVS HSFLSLL+ST+DASST  SSSS ILPLKSPS+RPS F SRVSLSGKP+PIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI
Subjt:  MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASST--SSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRI

Query:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVK-VIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV
        EGSNAGGLLVRFYSLM               EP KSIQDIAKSLTGSLISVK VIQADERNKKLIFSEKEA WSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV
Subjt:  EGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVK-VIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFV

Query:  HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDR--DKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLE
        HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDR  DKSRITLSI+QLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGL 
Subjt:  HLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDR--DKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLE

Query:  TIIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        TIIEEL QEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPP+EKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  TIIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

A0A6J1GVD7 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC1114575272.8e-16584.47Show/hide
Query:  MPIFVA-TIASVSAHSFLSLLSSTTDASSTSSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLD---TSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEG
        MPIF A T+ S+SAHSFLS LS++ DAS++ S+SF+L  KSPS+RPSNF++RVSLSGKPEPIAGVL+   +SPESVRRARRSADWK AREYLDSGFI++G
Subjt:  MPIFVA-TIASVSAHSFLSLLSSTTDASSTSSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLD---TSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEG

Query:  RIEGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAF
        RIEGSNAGGLLVRFYSL+               EPYKSIQDIAKSL GSLI VKVIQADE+NK LIFSEKEAAWSKFS +VGVGDVYEA+VGSLEDYGAF
Subjt:  RIEGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAF

Query:  VHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLET
        VHLRFSDGLYHLTGLVH+SEVSWDLVQDVRDILSEGDEV VKVI+VDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQD SAEPDSFGPKSDSEIIPLPGL+T
Subjt:  VHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLET

Query:  IIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        I EELLQEEGI DV +NRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  IIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

A0A6J1IUF3 uncharacterized protein LOC1114794067.3e-16684.74Show/hide
Query:  MPIFVA-TIASVSAHSFLSLLSSTTDASSTSSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLD---TSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEG
        MPIF A T+ S+SAHSFLSLL+S TDAS + SSSF+L  KSPS+RPSNF++RVSLSGKPEPIAGVL+   +SPESVRRARRSADWK AREYLDSGFI++G
Subjt:  MPIFVA-TIASVSAHSFLSLLSSTTDASSTSSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLD---TSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEG

Query:  RIEGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAF
        RIEGSNAGGLLVRFYSL+               EPYKSIQDIAKSL GSLI VKVIQADE+NK LIFSEKEAAWSKFS QVGVGDVYEA+VGS+EDYGAF
Subjt:  RIEGSNAGGLLVRFYSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAF

Query:  VHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLET
        VHLRFSDG YHLTGLVH+SEVSWDLVQDVRDILSEGDEV VKV++VDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQD SAEPDSFGPKSDSEIIPLPGL+T
Subjt:  VHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLET

Query:  IIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        I EELLQEEGI DV +NRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
Subjt:  IIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29344 30S ribosomal protein S1, chloroplastic4.9e-1830.73Show/hide
Query:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL--MEPYKSI--QDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD
        S+R+ +    W+  R+      + +G+I G+N GG++     L    P+  I  +  A+ L    I +K ++ DE   +L+ S ++ A +    Q+G+G 
Subjt:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL--MEPYKSI--QDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD

Query:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP
        V    V SL+ YGAF+ +        + GL+HVS++S D V D+  +L  GD + V +++ DR++ R++LS K+LE  P
Subjt:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP

P46228 30S ribosomal protein S16.0e-1628.49Show/hide
Query:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSLM----EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD
        S+RR      W+  R+           +  +N GG LVR   L       + S +   + L G  + +K ++ DE   +L+ S + A   +   ++ VG+
Subjt:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSLM----EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD

Query:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP
        V    V  ++ YGAF+ +        ++GL+H+SE+S D ++    + +  DEV V +I++D ++ RI+LS KQLE +P
Subjt:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP

P74142 30S ribosomal protein S1 homolog B1.3e-1527.89Show/hide
Query:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSLM----EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD
        S R+ +    W+   E  +SG   E  + G+N GG++     L       +   +D   +L G ++   +++A++ N KL+ +++    ++  G++  G+
Subjt:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSLM----EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD

Query:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP--LLETLDKVI
        +YE KV  ++ YG FV +        +TGL+HVS+VS   V  +  + + G  ++V V  +D  K+RI+LS + LE  P  L+E  D+++
Subjt:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP--LLETLDKVI

Q93VC7 30S ribosomal protein S1, chloroplastic8.4e-1831.84Show/hide
Query:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL--MEPYKSIQD--IAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD
        S+R  +    W+  R+      I + ++ G+N GGL+     L    P+  I     A+ L    I +K ++ DE   KL+ S ++A  +    Q+G+G 
Subjt:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL--MEPYKSIQD--IAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD

Query:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP
        V    V SL+ YGAF+ +        + GL+HVS++S D V D+  +L  GD + V +++ DRD+ R++LS K+LE  P
Subjt:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP

Q9JZ44 30S ribosomal protein S11.6e-1631.22Show/hide
Query:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL-------MEPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQ--
        S  +A+R+ADW A  E +++G I  G I G   GGL V   S+       +   + ++D      G  I  KVI+ D++   ++ S +    +    +  
Subjt:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL-------MEPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQ--

Query:  -----VGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP
             +  G V +  V ++ DYGAFV L   DGL H+T      +++W  V+   ++L  G EV  KV+  D++K R++L +KQL EDP
Subjt:  -----VGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12800.1 Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein3.2e-2032.53Show/hide
Query:  QDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFS----EKEAAWSK---FSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDI
        Q    S  G  I V V+ A+  ++KLIFS    E E    K      ++ VGDV +  +  +  +G F  L        +  LVH SEVSWD   D    
Subjt:  QDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFS----EKEAAWSK---FSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDI

Query:  LSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPL--PGLETIIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDL
           G  V  KV  +D    RI LS+K++  DPL E L+ V+  D+    D  G +  +  +    P +E++I+EL   EGI  V  +R  F    ++   
Subjt:  LSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPL--PGLETIIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDL

Query:  QLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERV
        Q+++  AP  E ++ LLARAG +VQE+ +  SL +E +K  +     RV
Subjt:  QLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERV

AT3G23700.1 Nucleic acid-binding proteins superfamily4.2e-10558.74Show/hide
Query:  LSLLSSTTDASSTSSS------SFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRF
        L LL S++ +SS  +S      SF     + + R S+ S+  S+      +  + DTS E+   A   +DWK A+ Y  SG  +EG ++G N GGLL+RF
Subjt:  LSLLSSTTDASSTSSS------SFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRF

Query:  YSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTG
        +SL+               EP KSI +IAK+L GS + VKV+QADE N+KLI SEK A W K+S  V VGDV+  +VGS+EDYGAF+HLRF DGLYHLTG
Subjt:  YSLM---------------EPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTG

Query:  LVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETIIEELLQEEGIVDV
        LVHVSEVSWD VQDVRD+L +GDEV V V N+D++KSRITLSIKQLE+DPLLETLDKVI +DSS    S    +   I PLPGLETI+EELL+E+GI  V
Subjt:  LVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETIIEELLQEEGIVDV

Query:  RVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP
        ++NRQGFEKRVVSQDLQLWLSN PP + KF LLARAGRQVQEI LTTSL+Q GIK+ALQ VLERVP
Subjt:  RVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLARAGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP

AT4G29060.1 elongation factor Ts family protein1.2e-0624.83Show/hide
Query:  GDVYEAKVGSLEDYGAFVHL-RFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPD
        G  +  KV +++ +GAFV    F+D      GLVHVS++S + V+DV  +++ G EV V+++  D +  RI+L++++ ++ P  ++     P+       
Subjt:  GDVYEAKVGSLEDYGAFVHL-RFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPD

Query:  SFGPKS------DSEIIPLPGLETIIEELLQEEGIVDVRVNRQGF
        S G         +S+      L+ +++ L +    + +    +GF
Subjt:  SFGPKS------DSEIIPLPGLETIIEELLQEEGIVDVRVNRQGF

AT4G29060.2 elongation factor Ts family protein1.2e-0624.83Show/hide
Query:  GDVYEAKVGSLEDYGAFVHL-RFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPD
        G  +  KV +++ +GAFV    F+D      GLVHVS++S + V+DV  +++ G EV V+++  D +  RI+L++++ ++ P  ++     P+       
Subjt:  GDVYEAKVGSLEDYGAFVHL-RFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPD

Query:  SFGPKS------DSEIIPLPGLETIIEELLQEEGIVDVRVNRQGF
        S G         +S+      L+ +++ L +    + +    +GF
Subjt:  SFGPKS------DSEIIPLPGLETIIEELLQEEGIVDVRVNRQGF

AT5G30510.1 ribosomal protein S16.0e-1931.84Show/hide
Query:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL--MEPYKSIQD--IAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD
        S+R  +    W+  R+      I + ++ G+N GGL+     L    P+  I     A+ L    I +K ++ DE   KL+ S ++A  +    Q+G+G 
Subjt:  SVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRFYSL--MEPYKSIQD--IAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGD

Query:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP
        V    V SL+ YGAF+ +        + GL+HVS++S D V D+  +L  GD + V +++ DRD+ R++LS K+LE  P
Subjt:  VYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEVTVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAATCTTTGTTGCAACAATCGCCTCTGTCTCTGCTCATTCCTTTCTCTCACTCCTCTCCTCCACTACTGATGCTTCTTCAACCTCCTCCTCCTCCTTCATTTTACC
ACTCAAATCCCCCTCTAGACGCCCTTCCAATTTCTCCTCCAGAGTTTCCCTCTCCGGAAAACCCGAACCCATTGCCGGAGTTCTAGACACCTCCCCGGAATCCGTTCGAC
GTGCTCGGAGATCTGCTGATTGGAAGGCAGCGAGGGAATACCTTGATAGTGGATTTATCTATGAGGGCAGGATTGAAGGTTCAAATGCTGGAGGTTTACTGGTCCGATTT
TATTCTCTTATGGAACCATACAAGAGTATTCAAGATATTGCAAAAAGCTTAACTGGTTCGCTTATATCAGTAAAGGTAATCCAAGCAGATGAGAGAAACAAGAAATTGAT
ATTTTCAGAGAAGGAAGCTGCGTGGTCGAAATTTTCTGGGCAAGTGGGTGTGGGAGATGTCTATGAAGCTAAAGTTGGATCTTTGGAGGATTATGGTGCTTTTGTACATC
TACGTTTCTCTGATGGTCTTTATCATCTTACTGGGCTAGTACACGTATCAGAAGTTTCATGGGATCTAGTTCAGGATGTAAGAGACATATTAAGTGAGGGTGACGAAGTG
ACAGTGAAAGTCATTAATGTTGATAGGGATAAGTCTAGGATCACATTGTCGATCAAACAACTCGAGGAAGATCCACTTTTAGAAACATTGGACAAAGTAATACCGCAGGA
CAGCTCTGCTGAACCTGATTCTTTCGGACCTAAAAGCGACAGCGAAATAATACCCCTCCCTGGACTTGAAACAATAATTGAAGAGCTACTGCAGGAAGAGGGTATAGTAG
ATGTTCGTGTCAACCGACAAGGATTTGAGAAACGTGTGGTTTCACAAGACCTACAGCTTTGGCTATCAAATGCACCTCCCGTTGAAAAGAAATTCACTCTCCTTGCTCGA
GCCGGGAGGCAGGTTCAAGAAATTCAGCTGACAACATCACTCGATCAGGAAGGTATAAAAAGGGCATTGCAGCGAGTGTTGGAACGTGTCCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCAATCTTTGTTGCAACAATCGCCTCTGTCTCTGCTCATTCCTTTCTCTCACTCCTCTCCTCCACTACTGATGCTTCTTCAACCTCCTCCTCCTCCTTCATTTTACC
ACTCAAATCCCCCTCTAGACGCCCTTCCAATTTCTCCTCCAGAGTTTCCCTCTCCGGAAAACCCGAACCCATTGCCGGAGTTCTAGACACCTCCCCGGAATCCGTTCGAC
GTGCTCGGAGATCTGCTGATTGGAAGGCAGCGAGGGAATACCTTGATAGTGGATTTATCTATGAGGGCAGGATTGAAGGTTCAAATGCTGGAGGTTTACTGGTCCGATTT
TATTCTCTTATGGAACCATACAAGAGTATTCAAGATATTGCAAAAAGCTTAACTGGTTCGCTTATATCAGTAAAGGTAATCCAAGCAGATGAGAGAAACAAGAAATTGAT
ATTTTCAGAGAAGGAAGCTGCGTGGTCGAAATTTTCTGGGCAAGTGGGTGTGGGAGATGTCTATGAAGCTAAAGTTGGATCTTTGGAGGATTATGGTGCTTTTGTACATC
TACGTTTCTCTGATGGTCTTTATCATCTTACTGGGCTAGTACACGTATCAGAAGTTTCATGGGATCTAGTTCAGGATGTAAGAGACATATTAAGTGAGGGTGACGAAGTG
ACAGTGAAAGTCATTAATGTTGATAGGGATAAGTCTAGGATCACATTGTCGATCAAACAACTCGAGGAAGATCCACTTTTAGAAACATTGGACAAAGTAATACCGCAGGA
CAGCTCTGCTGAACCTGATTCTTTCGGACCTAAAAGCGACAGCGAAATAATACCCCTCCCTGGACTTGAAACAATAATTGAAGAGCTACTGCAGGAAGAGGGTATAGTAG
ATGTTCGTGTCAACCGACAAGGATTTGAGAAACGTGTGGTTTCACAAGACCTACAGCTTTGGCTATCAAATGCACCTCCCGTTGAAAAGAAATTCACTCTCCTTGCTCGA
GCCGGGAGGCAGGTTCAAGAAATTCAGCTGACAACATCACTCGATCAGGAAGGTATAAAAAGGGCATTGCAGCGAGTGTTGGAACGTGTCCCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPIFVATIASVSAHSFLSLLSSTTDASSTSSSSFILPLKSPSRRPSNFSSRVSLSGKPEPIAGVLDTSPESVRRARRSADWKAAREYLDSGFIYEGRIEGSNAGGLLVRF
YSLMEPYKSIQDIAKSLTGSLISVKVIQADERNKKLIFSEKEAAWSKFSGQVGVGDVYEAKVGSLEDYGAFVHLRFSDGLYHLTGLVHVSEVSWDLVQDVRDILSEGDEV
TVKVINVDRDKSRITLSIKQLEEDPLLETLDKVIPQDSSAEPDSFGPKSDSEIIPLPGLETIIEELLQEEGIVDVRVNRQGFEKRVVSQDLQLWLSNAPPVEKKFTLLAR
AGRQVQEIQLTTSLDQEGIKRALQRVLERVP